国家卫生部科学研究基金(WKJ2008-2-36)
- 作品数：2 被引量：14H指数：2
- 相关作者：陈忠许晶晶董继扬徐乐李伟更多>>
- 相关机构：厦门大学更多>>
- 发文基金：国家卫生部科学研究基金国家自然科学基金福建省自然科学基金更多>>
- 相关领域：理学更多>>
- 核磁共振代谢组学数据预处理中的自适应分段积分方法被引量：8
- 2009年
- 提出一种用于核磁共振代谢组学数据预处理的自适应分段积分方法.通过计算各数据点统计特性,并根据相邻数据点的统计差特性进行自适应积分,克服了目前普遍采用的等间隔分段积分法可能存在的缺陷(如统计差异性相反的信号相互抵消、微弱特征信号被掩盖及谱图信噪比下降等),从而避免了对后续统计分析所产生的负面影响.为比较自适应分段积分和等间隔积分对数据预处理的效果,分别采用计算机模拟数据和饮食差异人群两种模型进行分析.研究结果表明,新方法能够有效地削弱噪声和非特异信号的影响,提高后续的主成分分析结果的可靠性,使代谢组学数据分析更具生物学意义.
- 董继扬徐乐许晶晶陈忠
- 关键词：核磁共振代谢组学数据预处理
- 核磁共振代谢组学数据的尺度归一化新方法被引量：6
- 2011年
- 提出了一种新的尺度归一化方法,该方法不强调各变量在尺度上的归一,而是在原始数据的基础上,通过提高稳定性高且在不同类别样本中具有显著差异性的变量的权重,以增强与特征代谢物相关的信息.分别采用模拟数据和真实代谢组学数据对新归一化方法的性能进行评估,并与单位方差法(Unit variance)、变量稳定性(Variable stability)和尺度缩放法(Level scaling)等常用的尺度归一化方法进行了比较.研究结果表明,新归一化方法能够提高多变量统计模型的预测能力,较好地保留了核磁共振谱的分子信息,有助于特征代谢物的识别,并使后续的数据分析结果具有更好的可解释性.
- 董继扬李伟邓伶莉许晶晶Julian L.Griffin陈忠
- 关键词：核磁共振代谢组学
