福建省科技厅青年人才基金(2008F3045) 作品数:6 被引量:11 H指数:3 相关作者: 廖之君 林德馨 王晓江 王心睿 杨红 更多>> 相关机构: 福建医科大学 华南基因组研究中心 福建省肿瘤医院 更多>> 发文基金: 福建省科技厅青年人才基金 国家自然科学基金 更多>> 相关领域: 生物学 医药卫生 更多>>
DEPDC7基因在肝细胞及肿瘤细胞中的差异性表达 被引量:3 2012年 目的研究DEPDC7基因在正常肝细胞、肝癌细胞及其他肿瘤细胞中的表达情况。方法常规培养正常肝细胞HL-7702,肝癌细胞SMMC7721、HepG2、Huh-7,其他肿瘤细胞ZR-7530、MDA-MB-231、SGC7901、SW480。用MTT检测肝癌细胞转染前后的增殖情况,用RT-PCR方法在转录水平检测DEPDC7基因的表达,用Western blot方法从蛋白质水平检测DEPDC7蛋白的表达。结果 3株肝癌细胞生长增殖速度差异有统计学意义(P<0.05)。肝癌细胞DEPDC7基因在mRNA和蛋白质表达水平比正常肝细胞降低(P<0.05),而其他肿瘤细胞DEPDC7基因表达差异无统计学意义(P>0.05)。结论 DEPDC7基因在正常肝细胞中选择性高表达,而在肝癌细胞株中呈低表达。 廖之君 王晓江 王心睿 林德馨关键词:基因表达 肝细胞癌 利用癌旁组织中基因表达的秩序关系识别肝癌的早期诊断特征 被引量:1 2013年 目前,对于肝癌(hepatocellular carcinoma,HCC)早期检测中放射成像技术无法确定的结节,通常需要通过活检取样来进行组织病理学鉴定。然而,一些早期肝癌组织中所呈现的病理改变微小难辨,活检取样时也经常会出现未取到癌组织而漏检的情况。针对这些临床上肝癌早期诊断的困难,同时为了应对基因表达谱检测批次效应等对分类结果的影响,作者提出了利用癌旁组织中基因表达的秩序关系来鉴别早期肝癌及癌前病变的方法。首先找出在肝癌患者的肝硬化组织(cirrhosis tissue in patients with HCC,wHCC)和非肝癌患者的肝硬化组织(cirrhosis tissue in patients without HCC,woHCC)间基因表达值的相对秩序发生逆转的基因对,然后,借用大样本的肝癌组织表达谱数据筛选出HCC及wHCC中表达相对秩序一致的基因对,再基于这些基因对发展能将HCC、wHCC与woHCC进行鉴别的分类器。结果显示,该分类器对来自不同平台、不同实验室的验证集都有稳健的分类能力,可以用于早期肝癌的辅助鉴别诊断。 章琳 郝春香 陈蓓蓓 廖之君 郭政关键词:肝癌 癌旁组织 肝硬化 基因表达 DEP结构域的功能研究进展 被引量:5 2011年 DEP结构域首先是在三种蛋白(鼠蓬乱蛋白、产卵缺陷10蛋白、血小板-白细胞C激酶底物2蛋白)中发现的,是一个由接近100个氨基酸组成的蛋白模序。人类基因组中至少有67种基因编码含DEP同源结构域蛋白。目前所了解的DEP结构域具有细胞膜定位、信号转导等多种功能。因此,它在细胞的生物学功能方面发挥着重要作用。可通过发掘DEP结构域与复杂的生物系统中多种分子和基因的相互作用,进一步研究DEP结构域的功能。 王晓江 廖之君 林德馨关键词:WNT DEP结构域的结构与功能 被引量:4 2015年 DEP结构域首次在Dishevelled、EGL-10和Pleckstrin三种蛋白质中发现,是一个高度保守的蛋白结构域。过去20年的研究表明,DEP结构域存在于许多信号蛋白中,并参与了信号转导、细胞极性确立和小分子信号激活等生命活动过程,特别是在GPCR信号转导和Wnt信号通路中起着至关重要的作用。本文将结合最新研究进展,以及通过生物信息学的数据挖掘,对DEP结构域的结构和功能进行简要概述。 王心睿 杨红 廖之君关键词:WNT信号通路 肝选择性未知基因loc91614的功能预测及表达研究 被引量:3 2013年 目的:预测肝脏组织选择性未知基因loc91614的功能,实验验证其基因表达。方法:构建含未知基因的肝组织选择性细胞通讯(LSCC)基因网络,再进行聚类、文献挖掘、基因本体、KEGG通路、Transfac转录因子结合位点等分析,用以预测loc91614的功能特征,最后,从mRNA和蛋白质水平验证其基因表达。结果:获得21个节点的LSCC基因网络,聚类显示loc91614与apob密切关联;文献挖掘显示基因与肝组织、胞质、脂等关键词显著相关;GO功能富集分析揭示loc91614具有细胞通讯、信号转导、细胞内信号级联的功能,有7个TFBS可对含loc91614的靶基因集进行调控,loc91614基因在肝细胞表达明显高于肝癌细胞。结论:loc91614可能分布于肝细胞的胞质中,很可能在肝组织中发挥细胞通讯等功能,也可能参与肝脏的糖、脂代谢过程,在肝细胞选择性高表达。 廖之君 马文丽 梁爽 林德馨 王晓江 郑文岭关键词:基因表达 细胞通讯 人绒毛膜促性腺激素对乳腺癌MCF-7细胞侵袭能力的影响 2012年 目的探讨人绒毛膜促性腺激素(humanchorionicgonadotropin,hCG)对乳腺癌细胞侵袭能力的作用。方法应用MTT法、体外侵袭转移实验方法、半定量RT—PCR,观察hCG对高表达LHR(1uteinizinghormone/humanchorionicgonadotropinreceptor)的MCF.7乳腺癌细胞生长、侵袭能力和mmpl、romp2、mmp9、timpl、timp3、vegf等侵袭转移相关基因转录表达的影响。结果hCG对高表达LHR的MCF一7乳腺癌细胞增殖力无明显影响,对侵袭力有明显抑制作用,对romp9、veff基因转录起抑制作用,对timpl基因转录起促进作用。结论hCG对高表达LHR的MCF一7乳腺癌细胞侵袭能力起抑制作用,对mmp9、red基因表达起抑制作用;对timpl基因表达起促进作用。 林授 廖之君 于建刚 林德馨关键词:人绒毛膜促性腺激素 乳腺癌