国家自然科学基金(30360098)
- 作品数：12 被引量：79H指数：5
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- 原发性肝癌患者乙型肝炎病毒前C区联合基本核心启动子变异的分析被引量：4
- 2008年
- 目的:研究原发性肝癌患者乙型肝炎病毒前C区联合基本核心启动子变异情况及与基因型的关系。方法:收集乙型肝病毒感染者血清132份,HBVDNA均阳性,用半巢式聚合酶链反应扩增HBV前C及C基因部分片段,产物纯化后直接测序,检测前CA1896联合BCPT1762/A1764变异。用S基因PCR-RFLP方法确定HBV基因型。结果:乙型肝炎病毒前C区联合基本核心启动子变异在原发性肝癌组的阳性率为41.18%(14/34),显著高于慢性肝病组的11.22%(11/98)(P<0.01)。前C A1896联合BCP T1762/A1764变异在B基因型检出率与C基因型相比,差异无显著性(P>0.05)。结论:乙型肝炎病毒前C区联合基本核心启动子变异与原发性肝癌关系密切,与基因型无相关性。
- 刘悦晖丁静娟范学工
- 关键词：原发性肝癌基因型
- 贵州省四城市乙型肝炎病毒感染者病毒基因型调查研究被引量：4
- 2006年
- 目的调查贵州省4城市乙型肝炎病毒(HBV)感染者的病毒基因型及其与临床的关系。方法选择贵阳、遵义、凯里、都匀4城市慢性HBV感染患者共786例,其中无症状携带者(ASC)346例,慢性肝炎(CH)313例,肝硬化(LC)77例,肝细胞肝癌(HCC)50例。用S基因限制性片段长度多态性确定基因型,直接测序分析B基因亚型,比较主要基因型地区分布及临床特征。结果786例中,B基因型497例(63．23%),C型275例(34．99%),A型7例(0．89%),D型7例(0．89%),未发现E、F型。B型的分布：凯里市最高(96．04%),遵义、都匀市其次(78．79%、64．52%),贵阳市最低(53．14%)。C型的分布,贵阳(45．84%)高于都匀(34．41%)、遵义(13．13%)及凯里市(3．96%),差异有统计学意义(P＜0．05或P＜0．01)。94例B型感染者中,93例为Ba(98．94%)、1例为Bj亚型。从ASC、CH、LC到HCC组,B型的分布逐渐降低,而C型在各组的分布逐渐增高。与B型相比,C型感染者年龄较大；ALT水平较高(P＜0．05)；HBeAg阳性较低(P＜0．025)。结论贵州省存在A、B、C、D 4种HBV基因型,但以B型为主,C型其次,A、D型极少。B型中又以Ba亚型为主。B、C基因型在贵州省4城市的分布有一定差异。
- 丁静娟张权彭亮刘悦晖李忠刘三都胡莲
- 关键词：乙型肝炎病毒基因型限制性片段长度多态性
- 贵州地区慢性乙型肝炎病毒感染者病毒基因亚型研究被引量：4
- 2007年
- 目的调查贵州省B、C基因型慢性HBV感染者的病毒基因亚型。方法PCR扩增HBV P区长309 bp的基因片段,扩增产物分别经限制性内切酶NciⅠ、VspⅠ、BstEⅡ酶切,琼脂糖凝胶电泳,根据酶切图谱多态性,用限制性片段长度多态性分析（PCR-RFLP）检测HBV C基因亚型。直接测序确定B基因亚型、对178例用S基因限制性片段长度多态性鉴定为B、C基因型的不同临床类型慢性HBV感染者进行亚型分析。结果84例C基因型HBV感染者中,27例（32.14%）为C1亚型、56例（66.67%）为C2亚型,1例为C1、C2亚型混合感染。94例B基因型HBV感染者中,93例（98.94%）为Ba、1例为Bj亚型感染。从无症状乙型肝炎表面抗原携带者、CHB到肝硬化/肝癌,C1亚型在各组中的比例逐渐降低,分别为60.00%、30.65%和16.67%;而C2亚型在各对应组中的分布逐渐增高,分别为40.00%、67.74%和83.33%。结论贵州地区B、C基因型慢性HBV感染者中,以Ba、C2亚型为主。C1、C2亚型在疾病中的分布有一定差异。PCR-RFLP分析HBV C1、C2亚型,方法简便、特异性强,适合较大样本分析,可用于流行病学调查。
- 丁静娟刘悦晖王梅
- 关键词：基因亚型限制性片段长度多态性分析测序
- 贵州侗族、苗族和汉族人群乙型肝炎病毒基因型分布被引量：8
- 2004年
- 目的 了解贵州侗、苗、汉族HBV感染者的基因型。方法 比较 12 7株各基因型HBV全序列S基因核苷酸序列 ,用DNA分析软件筛选出 3个限制性内切酶。设计 3条HBVS区引物并进行聚合酶链反应扩增 ,产物经MboⅠ、BstNⅠ或BsmAⅠ酶切 ,分析酶切产物电泳图谱 ,建立区分HBV(A～F)基因型的方法。对贵州 16 6份侗、苗、汉族HBV感染者血清进行基因分型 ,5份PCR产物直接测序验证分型方法的准确、可靠。结果 S基因PCR RFLP分型结果准确 ,5份酶切鉴定结果经测序证实。 16 6份标本中 ,B基因型 138份 (83 13% ) ,C型 2 8份 (16 87% ) ,未发现B、C以外的其他基因型。侗族的 4 8例中 ,4 7例为B型 (97 92 % ) ,1例C型 (2 0 8% ) ,苗族的 5 2例中 ,4 9例为B型(94 2 3% ) ,3例C型 (5 77% ) ;6 6例汉族也以B基因为主 (6 3 6 4 % ,4 2 6 6 ) ,但C型有 2 4例 (36 36 % ) ,与侗、苗族HBV感染者相比 ,差异有显著意义 (χ2 =35 0 5 88,P <0 0 0 5 )。结论 贵州地区HBV基因型由B、C 2型构成 ,且以B基因型为主。汉族患者C型较多 ,而侗、苗族患者中B型是占绝对优势的基因型。
- 丁静娟彭亮张权李忠唐光鹏
- 关键词：乙型肝炎病毒基因型B基因S基因HBV基因型电泳图谱
- 贵州乙型肝炎病毒基因型分布及意义分析被引量：8
- 2006年
- 目的调查贵州乙型肝炎病毒(HBV)基因型分布。方法选择贵阳、遵义、凯里、都匀慢性HBV感染者693例,其中无症状携带者(ASC)292例,慢性肝炎(CH)276例,肝硬化(LC)76例,肝细胞肝癌(HCC)49例。用S基因限制性片段长度多态性确定基因型,比较主要基因型的地区分布及其与临床的关系。结果693例中,B基因449例(64.79%),C型233例(33.62%),A型6例(0.87%),D型5例(0.72%),未发现E、F基因型。B型的分布:凯里最高(96.40%),遵义、都匀其次(78.79%、76.19%),贵阳最低(53.66%)。C型的分布,贵阳(45.68%)高于都匀(23.80%)、遵义(13.13%)及凯里(3.96%),差异有统计学意义(P≤0.01)。与B型相比,C型感染者平均年龄大;ALT水平高;HBeAg阳性率低(P≤0.01)。除ASC组外,B、C2种基因型在CH、LC和HCC中的分布差异有统计学意义(P均<0.01)。结论贵州存在A、B、C、D4种HBV基因型,但以B型为主,C型其次,A型、D型仅占很小比例。B、C基因型在贵州不同地区的分布有一定差异。与B型相比,C型感染者肝脏损害的程度较重。
- 丁静娟张权彭亮刘悦晖李忠刘三都胡莲
- 关键词：基因型
- 乙型肝炎病毒前S基因变异与肝病进展的关系被引量：4
- 2007年
- 目的探讨HBV前S基因变异与疾病进展的关系。方法收集无症状携带者（ASC）、慢性肝炎（CH）、肝炎肝硬化（LC）、肝细胞癌（HCC）患者血清138份，PCR扩增前S区基因．聚合酶链反应-限制性片段长度多态性检测前S2起始码变异，聚丙烯酰胺凝胶电泳（PAGE）分析前S缺失变异，直接测序确定前CA1896、基本核心启动子（BCP）T1762／A1764变异。数据行X^2检验。结果HCC、LC组前S缺失变异检出率分别为56．3％和42．9％，高于CH组的11．8％和ASC组的8．1％（P〈0．01）。前S2起始码变异检出率在HCC（50．0％）、LC（37．1％）组亦较CH（5．9％）、ASC（0）组高。前S缺失、前S2起始码变异在HBeAg阴性组的检出率分别为37．5％和36．1％，高于HBeAg阳性组的19．7％和7．6％（P〈0．01）。分析前S基因、T1762／A1764、A1896单独或联合变异在HCC、LC组和CH、ASC组的分布，Fisher精确检验表明，T1762／A1764和前S基因的联合变异是影响疾病进展、导致严重肝病的重要因素（P-0）。结论严重肝病患者前s基因变异发生率高，有T1762／A1764联合前S基因变异HBV感染者的肝病易进展。
- 丁静娟王梅刘悦晖
- 关键词：肝炎病毒乙型蛋白质前体限制性片段长度肝疾病
- 慢性乙型肝炎病毒感染者病毒前C区和基本核心启动子区变异检测及意义被引量：29
- 2005年
- 目的探讨乙型肝炎病毒(HBV)前C区和基本核心启动子(BCP)区变异与基因型及疾病进展间的关系。方法收集HBV携带者(ASC)、慢性乙型肝炎(CHB)、肝炎肝硬化(LC)、肝细胞肝癌(HCC)患者血清148份,用半巢式聚合酶链反应扩增HBV前C/C基因部分片段,产物纯化后直接测序,检测前C区A1896及BCP区T1762/A1764变异。用S基因聚合酶链反应-限制性片段长度多态性分析(PCR-RFLP)方法确定HBV基因型。结果有128份血清能够成功分型和测序,其中B基因型60份,C基因型68份。在B基因型感染者中前C区A1896变异检出率(48.33%)明显高于C基因型感染者(29.41%,χ2=4.83,P<0.05);而BCP区T1762/A1764变异检出率却明显低于C基因型感染者,差异亦有统计学意义(30.00%∶73.54%,χ2=24.25,P<0.05)。前C区A1896变异在CHB、LC、HCC中的阳性检出率分别为46.88%(15/32)、39.39%(13/33)、51.52%(17/33),与ASC的13.33%(4/30)相比,P分别<0.05,差异有统计学意义。BCP区T1762/A1764变异检出率在HCC、LC组分别为87.88%(29/33)和72.73%(24/33),明显高于CHB组的37.50%(12/32)及ASC组10.00%(3/30)(P<0.05)。结论前C区A1896变异常见于B基因型感染者,而BCP区T1762/A1764变异C基因型感染者多见。除ASC外,前C区A1896变异与疾病进展关系不大,而BCP区T1762/A1764变异与乙型肝炎进展及预后相关。
- 刘悦晖丁静娟张权
- 关键词：乙型肝炎病毒基本核心启动子前C基因基因型
- 贵州省乙型肝炎病毒前C区及基本核心启动子变异分布被引量：3
- 2007年
- 目的调查贵州省乙型肝炎病毒（HBV）前C区A1896、基本核心启动子区（BCP）T1762／A1764变异分布。方法收集贵阳、遵义、凯里、都匀4地区不同民族无症状携带者（AS（2）、慢性肝炎（CH）、肝炎肝硬化（LC）、肝细胞肝癌（HCC）患者血清482份，用测序及限制性片段长度多态性检测A1896、T1762／A1764变异。用S基因PCRRFLP确定基因型。结果A1896、T1762／A1764变异检出率分别为23．03％和29．67％。汉族感染者A1896、T1762／A1764变异检出率为27．64％和36．04％，高于侗、苗、布依族感染者合并后的7．96％、8．85％（P〈0．01）。A1896变异在B、C基因型中的分布为20．34％和27．13％（P〉0．05），T1762／A1764变异为18．97％和46．28％（P〈0．01）。A1896、T1762／A1764变异在HBeAg阴、阳性组间的分布差异有统计学意义（P值均〈0．01）。从ASC到HCC组，A1896、T1762／A1764变异分布逐渐增高，LC、HCC组的检出率明显高于CH和ASC组（P值均〈0．01）。A1896、T1762／A1764变异的分布：贵阳（分别为31．79％和41．06％）高于遵义（10．94％和14．06％）、都匀（8．64％和11．11％）及凯里（2．86％和2．86％），但多因素logistic回归分析在控制了HBeAg、HBV基因型及临床类型影响后，在地区间分布差异无统计学意义。结论A1896、T1762／A1764变异在贵州省不同民族间分布有一定差异。C型感染者易发生T1762／A1764变异，两种变异均与疾病进展有关。
- 丁静娟刘悦晖王梅
- 关键词：乙型肝炎病毒限制性片段长度多态性
- 乙型肝炎病毒S基因限制性片段长度多态性分型方法的建立及应用被引量：13
- 2004年
- 目的 建立乙型肝炎病毒(HBV)S基因片段聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(RFLP)的基因分型方法并用于基因型与临床疾病谱关系的研究。 方法 比较GenBank中124株各基因型HBV全序列的S基因核苷酸序列及13株单独S基因序列,设计利用限制性内切酶Mbo Ⅰ、BsTN Ⅰ、BsmA Ⅰ、HpaⅡ酶切S基因片段鉴定HBV基因型(A-F)的方法。对贵州地区176份乙型肝炎患者血清进行基因分型并分析基因型与疾病谱的关系。直接测序2份B型和3份C型毒株的PCR扩增产物,以验证本酶切分型方法的正确性。 结果 测序结果证明本方法能够准确鉴定基因型。在176份标本中,B型100份(56.8％),C型76份(43.2％),未发现其他基因型。B型中无症状携带者(ASC)比例(40.0％)高于C型(15.8％),x2=12.16,P<0.005;慢性中度比例(14.0％)低于C型(31.6％),x2=7.88,P<0,005。 结论 本S基因片段PCR-RFLP基因分型方法简便、准确。贵州地区存在HBV B和C基因型。
- 彭亮丁静娟张莉莎
- 关键词：乙型肝炎病毒S基因限制性片段长度多态性基因分型疾病谱
- 中国贵州地区乙型肝炎病毒前S基因变异的研究被引量：2
- 2007年
- 目的研究HBV前S基因变异与基因型及疾病类型的关系。方法建立聚合酶链反应一限制性片段长度多态性检测HBV前S2起始码变异的方法；用聚丙烯酰胺凝胶电泳分析HBV前S区缺失变异；用直接测序验证方法的准确性。用S基因聚合酶链反应一限制性片段长度多态性确定HBV基因型。检测160份HBV感染者血清，并结合基因型、疾病类型分析。结果160份标本中B基因型81份，C基因型79份。C基因型前S2起始码变异的检出率为43．04％，高于B型的1．23％（P〈0．05）。前S区缺失变异在C基因型中的检出率也高于B型（36．71％与19．75%,P〈0．05）。前S2起始码变异在HCC、LC组的检出率分别为50．00％、39．47％，明显高于慢性肝炎组的8．00％、慢性无症状乙型肝炎表面抗原携带者组的0（P值均〈0．05）。前S区缺失变异检出率在HCC、LC组分别为53．13％和42．11％，也高于慢性肝炎组的18．00％及慢性无症状乙型肝炎表面抗原携带者组的7．50％（P值均〈0．05）。经多因素Logistic回归分析，C基因型和严重肝病是影响前S基因变异的重要因素（OR分别为6．26、11．99，P值均〈0．01）。测序结果与酶切、聚丙烯酰胺凝胶电泳结果一致。结论与B基因型相比，C型HBV感染者更易发生前S2起始码、前S区缺失变异，前S基因变异与肝病进展及预后相关。
- 王梅丁静娟刘悦晖
- 关键词：肝炎病毒乙型基因限制性片段长度多态性聚丙烯酰胺凝胶电泳
