国家农业科技成果转化资金(2009GB2B100084)
- 作品数:1 被引量:4H指数:1
- 相关作者:赵建军闫如勋白雪倪佳闫喜军更多>>
- 相关机构:中国农业科学院特产研究所江苏科技大学更多>>
- 发文基金:国家农业科技成果转化资金更多>>
- 相关领域:生物学更多>>
- 狐、貉源犬瘟热病毒H和F基因的克隆与序列分析被引量:4
- 2012年
- 为研究我国圈养狐、貉流行犬瘟热病毒(canine distemper virus,CDV)的基因分型与遗传变异情况,通过RT-PCR方法扩增与测序分析了2009年来源于山东省和河北省病料中的CDV H与F基因,并分别与GenBank CDV野毒株和疫苗株的基因序列比对,构建了核苷酸序列的系统发生树。H基因系统发生分析显示,6株毒株归属为Asia-1型。H蛋白氨基酸序列比较表明,除HeB(09)3株有8个潜在N-连接的糖基化位点外,其余毒株N-连接的糖基化位点均为9个。以往的研究结果显示,日本和中国台湾分离株的潜在N-连接糖基化位点为8~9个。6株野毒F蛋白编码区氨基酸的同源性为98.0%~99.5%,与CDV3(登录号EU726268)和Onderstepoort(登录号AF305419)疫苗株的同源性为89.1%~90.6%,F蛋白的前导区(1~135位氨基酸)与疫苗株相比的同源性为62.2%~66.7%;野毒株F蛋白氨基酸在108~110处比疫苗株CDV3多1个潜在N-连接的糖基化位点,HeB(09)3的F蛋白还在366~369位多1个潜在的N-连接的糖基化位点。目前在山东省和河北省2地狐狸和貉中流行的犬瘟热野毒株为Asia-1型,HeB(09)3株H蛋白和F蛋白在N-连接糖基化方面与其他5株野毒株有明显的不同。
- 闫如勋赵建军柴秀丽闫喜军倪佳张海玲高晗白雪张蕾陈立志吴威
- 关键词:狐狸犬瘟热病毒融合蛋白基因