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国家自然科学基金(39830020)

作品数:8 被引量:127H指数:5
相关作者:顾红雅陈章良瞿礼嘉田欣李德铢更多>>
相关机构:北京大学中国科学院南京农业大学更多>>
发文基金:国家自然科学基金国家重点基础研究发展计划更多>>
相关领域:生物学农业科学更多>>

文献类型

  • 8篇中文期刊文章

领域

  • 6篇生物学
  • 2篇农业科学

主题

  • 4篇基因
  • 3篇CHS基因
  • 2篇英文
  • 2篇植物
  • 2篇山茶
  • 2篇进化
  • 2篇家族
  • 2篇分子进化
  • 2篇SUPERF...
  • 2篇查尔酮合酶
  • 1篇蛋白
  • 1篇蛋白酶
  • 1篇蛋白酶体
  • 1篇信号
  • 1篇信号传导
  • 1篇有机肥
  • 1篇有机物料
  • 1篇植物分子
  • 1篇植物生物
  • 1篇植物生物化学

机构

  • 4篇北京大学
  • 2篇中国科学院
  • 1篇南京农业大学
  • 1篇金华职业技术...

作者

  • 4篇顾红雅
  • 2篇杨俊波
  • 2篇李德铢
  • 2篇瞿礼嘉
  • 2篇田欣
  • 2篇陈章良
  • 1篇彭宇
  • 1篇杨世雄
  • 1篇王金玲
  • 1篇张树生
  • 1篇陈军
  • 1篇张春兰
  • 1篇郭振华
  • 1篇沈其荣
  • 1篇苏红文
  • 1篇杨继
  • 1篇胡蕾
  • 1篇袁飞

传媒

  • 2篇科学通报
  • 2篇Acta B...
  • 1篇云南植物研究
  • 1篇应用生态学报
  • 1篇金华职业技术...
  • 1篇Scienc...

年份

  • 3篇2006
  • 1篇2004
  • 2篇2003
  • 1篇2002
  • 1篇2000
8 条 记 录,以下是 1-8
排序方式:
查尔酮合酶超家族(chalcone synthase superfamily)基因重复和分化的式样被引量:21
2006年
查尔酮合酶(chalconesynthase,CHS)是类黄酮类物质生物合成途径中的关键酶,对植物的花色素形成以及抗虫和抗病有重要意义.本文综述了有关查尔酮合酶超家族基因重复和分化式样的研究进展.有资料显示,CHS基因在不同植物谱系中发生了不同程度的重复和分化,导致在多数植物基因组中存在具不同表达特性的CHS重复基因,并在部分植物基因组中出现由CHS基因分化形成的类CHS(CHS-like)基因.不同学者对该家族基因序列及其表达式样进行比较分析,揭示了该家族重复基因表达式样的分化在很大程度上受启动子和顺式调节元件的影响,结果导致重复基因的亚功能化(subfunctionalization);而发生在CHS活性位点附近的碱基替换则导致重复基因的新功能化(neofunctionalization),形成不同的类CHS基因,且多数类CHS基因是在不同植物谱系中由CHS基因多次独立进化形成,是趋同进化的结果.探讨CHS超基因家族的进化历史对深入了解基因重复-分化的过程和机制有很大帮助.
杨继顾红雅
关键词:查尔酮合酶基因重复分化
有机物料减轻设施连作黄瓜苗期病害的微生物效应被引量:58
2004年
在黄瓜已感染立枯病、枯萎病的连作土壤上 ,接种病原菌菌丝 ,施入 3种不同组分有机物料 (稻草、木屑、猪粪 ) ,分别用 1%、2 %、3% 3种用量研究不同有机物料减轻黄瓜枯萎病、立枯病的效果 .结果表明 ,抗病效果为稻草 >猪粪 >木屑处理 ,并随其用量的增加抗病效果更好 .土培试验结果表明 ,增施有机物料后土壤中细菌、氨化细菌、放线菌、真菌数量增加 .中稻草和猪粪对土壤微生物区系的影响大于木屑 .施用稻草后不仅土壤细菌、真菌数量增加 ,而且放线菌数量最高 ,青霉、木霉成为真菌的优势种属 .施用猪粪后土壤细菌数最多 ,以假单孢菌、芽孢杆菌为优势种属 ,真菌数也增多 .木屑处理的细菌、放线菌、真菌数量增加较少 ,但随着施入时间延长效果增强 .
袁飞彭宇张春兰沈其荣
关键词:有机物料黄瓜苗期病害土壤微生物
Duplication and divergent evolution of the CHS and CHS-like genes in the chalcone synthase(CHS)superfamily被引量:8
2006年
The enzymes of the CHS-superfamily are responsible for biosynthesis of a wide range of natural products in plants. They are important for flower pigmentation, protection against UV light and defense against phytopathogens. Many plants were found to contain multiple copies of CHS genes. This review summarizes the recent progress in the studies of the CHS-superfamily, focusing on the duplication and divergent evolution of the CHS and CHS-like genes. Comparative analyses of gene structure, ex- pression patterns and catalytic properties revealed extensive differentiation in both regulation and func- tion among duplicate CHS genes. It is also proposed that the CHS-like enzymes in the CHS-superfamily evolved from CHS at different times in various or- ganisms. The CHS-superfamily thus offers a valuable model to study the rates and patterns of sequence divergence between duplicate genes.
YANG Ji GU Hongya
关键词:基因复制CHS基因植物生物化学
COP9信号传导体与调节盖子复合体的进化(英文)
2003年
COP9信号传导体和 2 6S蛋白酶体的调节盖子复合体皆为含有 8个亚基的蛋白复合体 ,在真核生物体中普遍存在 ,它们的相应亚基在大小和氨基酸序列上具有一一对应关系。从NCBI站点的所有数据库中获得了裂殖酵母、酿酒酵母、线虫、果蝇、哺乳动物和拟南芥等多种生物的复合体的亚基序列共 8组。COP9信号传导体与调节盖子复合体相应亚基之间的氨基酸序列一致性大于 12 % ,它们均具有一些保守的区域 ,而且保守位点分布均匀 ,表明它们来自于同一祖先。在基于氨基酸序列构建的系统发育树中 ,各组序列分别形成两个分支 :一个分支由COP9信号传导体亚基和相似蛋白组成 ,另一分支由相应的调节盖子复合体亚基和相似蛋白构成。各个分支中单细胞生物的序列位于动、植物序列的根部 ,表明COP9信号传导体与调节盖子复合体的基因重复发生在真核单细胞生物和多细胞生物分化以前 ,并且二者的亚基基因沿各自的方向独立进化。几乎所有编码两个蛋白复合体的基因在基因组中均为单拷贝 ,第Ⅴ、Ⅵ组的亚基保守程度最高 ,暗示着它们在复合体中起着关键的作用。对COP9信号传导体和调节盖子复合体的相应亚基基因两两之间进行dN/dS的相关性分析 ,分别鉴定出 2 1和 15对亚基编码序列间具有显著的Pearson相关关系 。
苏红文瞿礼嘉陈章良顾红雅
关键词:分子进化蛋白酶体
CHS基因外显子2的进化规律及其用于植物分子系统学研究的可行性被引量:40
2000年
CHS基因的外显子2在进化中较为保守.用PCR方法,从低等的裸子植物(银杏、攀枝花、苏铁)和被子植物(玉兰、睡莲、垂柳、山茶)中成功地扩增了CHS基因外显子2的部分序列,长约860 bp.对这些序列与已发表的序列(合计19个科83个序列)进行最简约性分析,结果表明,对于大部分科,同一科的序列形成一组,而少数科的序列则分散在相距较远的分支中.用CHS基因全长编码区的DNA序列构建的最简约树与用其外显子2构建的最简约树相同.相对进化速率检测结果显示,CHS基因在不同科中进化速率不一致,菊科和茄科的非同义替换率与总的碱基替换率均很高,禾本科的非同义替换很快,而总的碱基替换并不快.从目前的结果来看,CHS基因家族的成员在不同科中的重复和丢失事件的式样不一样,因此,很难找到在不同科中直系同源的成员来进行被子植物科间的系统发育研究,但可用它进行科以下分类等级的研究.
王金玲瞿礼嘉陈军顾红雅陈章良
关键词:CHS基因外显子2进化规律植物系统发育
山茶属CHS基因家族的组成和分子进化初探(英文)被引量:5
2003年
用PCR方法从 4种山茶属 (Camellia) (山茶科 ) (Theaceae)植物的总DNA中分别扩增到CHS基因外显子 2的部分序列 ,经克隆、测序得到 16个该基因的序列 ,这些序列与来自GenBank的该属另一种植物的 3个序列及作为外类群的大豆 (Glycinemax (L .)Merr.)的 2个序列一起进行分析。研究表明 ,山茶属CHS基因家族在进化过程中已分化为A、B、C三个亚家族 ,包括A1、A2、A3、B1、B2、C等 6类不同的基因成员 ;其中只有A2类成员为全部被研究的5种植物所共有 ,而其他 5类成员只在部分被研究的植物中发现 ;所有这些CHS成员具有很高的同源性 :在核苷酸水平上同一亚家族内基本上高于 90 % ,不同亚家族间也在 78%以上。从推测的氨基酸组成看 ,山茶属内CHS基因的功能已发生了分化 ,各类成员的碱基替代率有较大差异 ;从分子系统发育树和可能的氨基酸组成分析 ,山茶属具有新功能的基因成员是在经过基因重复后 ,或是由少数几个位点的突变而成 ,或是由逐渐积累的突变而形成的。进一步分析认为 ,该属CHS基因的分化直到近期还在活跃地进行 ,并且不同种的进化式样有一定的差别 。
杨俊波田欣李德铢郭振华
关键词:山茶属查尔酮合酶分子进化
石笔木CHS基因家族成员的分析被引量:3
2002年
用PCR方法从石笔木 (TutcheriaspectabilisDunn)的总DNA中扩增CHS基因外显子 2的部分序列以代表该基因进行研究 ,经克隆后测序 ,得到长约 74 0~ 780bp的序列共 12个。以EMBL数据库中得到的紫花苜蓿和欧洲赤松各一个序列作为参照 ,进行排序和系统树的构建分析。结果显示 ,所有被测定的序列同源性均高于 70 % ,为CHS基因家族的成员 ,且这些序列由 3大类共 5种不同的基因拷贝组成 :第一类家族成员因碱基的插入和缺失改变了读码框 ,推测已失去了CHS基因的功能 ,成为假基因 ,其中个别拷贝存在较大缺失 ,这在以前的研究中未见报道 ;第二类家族成员因活性位点的氨基酸发生突变 ,可能具有新的基因功能 ;第三类家族成员则具有原CHS基因的功能。综上结果 ,可预测 ,山茶科CHS基因家族较大 ,且有着复杂的进化式样。
杨俊波田欣李德铢顾红雅杨世雄
关键词:CHS基因山茶科
商品有机肥在莴苣作物上的应用效果
2006年
为了了解商品有机肥与NPK化肥平衡配合施用在莴苣作物上的应用效果,作者于2004年根据莴苣作物需肥规律、当地莴苣的产量水平与菜农的施肥习惯,进行了汇仁高效有机肥和NPK化肥的平衡配套施肥田间试验。试验结果表明:汇仁高效有机肥的施用,可在减少化学氮肥一半用量情况下,莴苣产量增加1.4%~10.8%;莴苣茎部的Vc含量增加,硝酸盐含量降低;纯收入增加6.34%~10.18%。并且推荐在莴苣作物上,以667m2基施150kg汇仁高效有机肥,配施纯氮13.7kg、五氧化二磷4.5kg、氧化钾13.5kg的化学肥料,纯收益最高;施用肥料的N、P2O5、K2O比例以1∶0.51∶左右较好。
胡蕾张树生朱小芳
关键词:商品有机肥莴苣
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