广东省自然科学基金(U0631006)
- 作品数：12 被引量：156H指数：6
- 相关作者：陈金顶赵明秋蒋红霞张小华汤电更多>>
- 相关机构：华南农业大学中山大学佛山科学技术学院更多>>
- 发文基金：广东省自然科学基金国家自然科学基金长江学者和创新团队发展计划更多>>
- 相关领域：农业科学医药卫生生物学更多>>
- 结核分枝杆菌与牛分枝杆菌全基因组比较分析被引量：3
- 2010年
- 本研究旨在揭示结核分枝杆菌与牛分枝杆菌全基因组的遗传差异,为结核分枝杆菌与牛分枝杆菌的鉴别诊断提供新的分子标志。利用结核分枝杆菌H37Rv和牛分枝杆菌AF2122/97的全基因组测序结果,通过在线比对,完成了两者的全基因组比对分析。结果显示AF2122/97相对H37Rv存在14处大片段缺失,大小范围为0.8～12.7kb,其中RD18、RD19及RD20等3处缺失为首次报道。此外,AF2122/97还存在6处基因内部小片段的缺失,大小范围为12～714bp,其中Mb1319及Mb3293c基因内部缺失为首次报道。H37Rv相对AF2122/97存在6处大片段缺失,大小范围为1.3～5.4kb。此外,H37Rv还存在5处基因内部小片段的缺失,大小范围为10～48bp,这些基因的内部缺失都为首次报道。通过结核分枝杆菌H37Rv和牛分枝杆菌AF2122/97的全基因组序列比对,揭示了这2种菌株间的遗传差异,阐述影响表型特征、寄主偏好性及毒力差异的关键性遗传基础。这些新的认识将有助于开发新的药物、诊断试剂和疫苗。
- 朱汝仪潘文赵明秋琚春梅易琳王佳莹胡永明陈金顶
- 关键词：结核分枝杆菌牛分枝杆菌
- 新型可视化LAMP检测布鲁氏菌方法的建立及初步应用
- 本研究针对布鲁氏菌种特异的omp25基因建立了一种布鲁氏菌的新型可视化环等温扩增(loop-mediated isothermal amplification,LAMP)检测方法。应用该方法对布鲁氏菌S19株、S2株、M...
- 潘文李珊珊赵明秋琚春梅陈金顶
- 关键词：布鲁氏菌
- 文献传递
- 耐环丙沙星患病动物源沙门菌的多重耐药分子特征被引量：1
- 2012年
- 采用13株耐环丙沙星食品动物源沙门菌进行喹诺酮类作用靶位基因及质粒介导耐药基因的扩增测序、有机溶剂耐受试验、HeLa细胞侵袭试验,探讨其多重耐药的分子特征。结果显示,菌株均携带质粒介导的喹诺酮耐药基因,7株对环丙沙星敏感性降低或低水平耐药(最小抑菌浓度0.125～4μg/mL),靶位基因无突变或gyrA单位点突变及外排泵活性增强;5株对环丙沙星高水平耐药(最小抑菌浓度32～128μg/mL),均在gyrA和parC发生双位点突变及外排泵活性增强,其中4株携带β内酰胺酶blaCTX-M基因。对环丙沙星高水平耐药的沙门菌的侵袭力显著高于敏感菌株。表明患病食品动物源沙门菌中,无论外排能力增强与否,gyrA单位点突变或质粒介导的喹诺酮耐药基因阳性,仅导致沙门菌对环丙沙星的低水平耐药;而外排泵机制联同染色体靶位基因突变可导致菌株对环丙沙星的高水平耐药,往往同时携带blaCTX-M基因;临床分离沙门菌随着对环丙沙星耐药程度的增加侵袭力增强。
- 张小华李健任艳娜汪天露孙永学蒋红霞
- 关键词：沙门菌
- 新型可视化LAMP检测结核分枝杆菌与牛分枝杆菌方法的建立及初步应用
- 本研究基于rimM(编码16S rRNA-加工蛋白)基因建立了一种新型的可视化环等温扩增(loop-mediatedisothermal amplification,LAMP)方法,用于快速检测结核分枝杆菌及牛分枝杆菌。...
- 朱汝仪潘文王佳莹赵明秋琚春梅陈金顶
- 关键词：结核分枝杆菌牛分枝杆菌
- 文献传递
- 结核分枝杆菌与牛分枝杆菌全基因组比较分析
- 本研究旨在揭示结核分枝杆菌与牛分枝杆菌全基因组的遗传差异,为结核分枝杆菌与牛分枝杆菌的鉴别诊断提供新的分子标志。利用结核分枝杆菌H37Rv和牛分枝杆菌AF2122/97的全基因组测序结果,通过在线比对,完成了两者的全基因...
- 朱汝仪潘文赵明秋琚春梅易琳王佳莹胡永明陈金顶
- 关键词：结核分枝杆菌牛分枝杆菌
- 文献传递
- 广东地区患病食品动物源大肠杆菌ESBLs和AmpC酶流行分布调查被引量：19
- 2012年
- 质粒介导的超广谱β-内酰胺酶(ESBLs)和AmpC酶广泛传播和扩散,导致全球范围内肠杆菌科细菌对超广谱头孢菌素类的耐药性发展迅速,引起人们高度重视。食品动物源大肠杆菌可作为耐药基因储库,对细菌耐药性在动物、环境和人之间的传播起着非常重要的作用。本研究从2009年患病的食品动物,包括鸡、鸭、鹅和猪,分离鉴定了315株大肠杆菌,调查ESBLs和AmpC酶在患病食品动物中的流行分布。经双纸片协同扩散实验筛选出61株ESBL阳性菌株,PCR检测共检测出8种blaCTX-M基因,分别为blaCTX-M-14/14b、blaCTX-M-79、blaCTX-M-65、blaCTX-M-27、blaCTX-M-15、blaCTX-M-24、blaCTX-M-98和blaCTX-M-13,其中检出率最高的为blaCTX-M-79,其次为blaCTX-M-14/14b。本研究还检测出1株新的SHV型酶,命名为SHV-135;PCR共检测出5株大肠杆菌携带质粒源CMY-型AmpC酶,其中2株鹅源大肠杆菌携带1个新型CMY酶,命名为CMY-64。本研究表明患病动物分离的大肠杆菌中ESBLs和AmpC酶存在复杂性和多样性,而且新型β-内酰胺酶检出日益增多,提示兽医临床应慎用β-内酰胺类抗生素。
- 汤电张浩吉纪雪薇刘继郭玉芳王丽华付晓平张小华孙永学蒋红霞
- 关键词：耐药性ESBLSAMPC酶质粒
- 食品中沙门氏菌PCR快速检测方法的建立被引量：37
- 2007年
- 目的寻求快速检测食品中沙门氏菌的技术方法支持。方法根据沙门氏菌编码侵袭蛋白E(invasion protean E,invE)的基因设计一对引物,对沙门氏菌株及非沙门氏株菌基因组DNA进行PCR扩增,建立了沙门氏菌特异、敏感和快速的PCR检测方法,并对食品中的沙门氏菌进行了检测。结果该方法能检测出3.0×102cfu/mL纯培养的沙门氏菌,4种人工染菌食品的模拟检测结果显示,当各食品中初始含菌量分别为1.5cfu/g(火腿肠)、2.4cfu/g(鲜猪肉)、1cfu/ml(包装鲜奶)和1cfu/g(鲜鸡蛋)时,分别经过6h、18h、12h和18h增菌,PCR检测为阳性,而阴性对照组均为阴性。结论方法具有耗时少,特异性强,敏感性高,操作简便,费用低的优点。
- 钟伟军赵明秋张彩虹陈金顶
- 关键词：食品沙门氏菌聚合酶链反应
- 布鲁氏菌bp26基因缺失株的构建被引量：17
- 2011年
- 选择含有反向筛选基因sacB标记的pRE112质粒为自杀载体,利用等位基因交换的方法成功敲除了布鲁氏菌弱毒疫苗S19株、S2株、M5株的bp26基因,构建了具有非抗性基因标记的缺失株S19-Δbp26、S2-Δbp26、M5-Δbp26。将构建的重组自杀质粒pRE-Δbp26(缺失了bp26基因的681个碱基)电转化入布鲁氏菌后,经过5μg/mL氯霉素筛选单交换子和70g/L蔗糖筛选同源重组双交换子,用菌落PCR及DNA测序的方法进行验证。结果表明,bp26基因的缺失改造成功,连续传20代后菌落PCR及DNA测序的结果显示突变株具有遗传稳定性。以pRE112自杀质粒为基础构建无抗性基因标记的布鲁氏菌缺失株为布鲁氏菌的基因功能研究奠定了基础,同时Δbp26缺失株的构建可为新型布鲁氏菌疫苗的研制奠定基础。
- 潘文王佳莹赵明秋琚春梅易琳常艳虞红娇陈金顶
- 关键词：布鲁氏菌基因缺失株
- 结核分枝杆菌与牛分枝杆菌PCR快速鉴别检测方法的建立被引量：5
- 2010年
- 根据结核分枝杆菌与牛分枝杆菌基因组的比对分析结果,针对结核分枝杆菌与牛分枝杆菌153bp、RD10和TbD1的3处差异缺失区域设计引物,分别建立了结核分枝杆菌与牛分枝杆菌PCR快速鉴别检测方法。应用建立的3种方法分别对84株结核分枝杆菌、3株牛分枝杆菌、51株非结核分枝杆菌及9种其他常见菌株进行了检测。结果显示,用针对153 bp缺失片段建立的PCR方法分别在结核分枝杆菌及牛分枝杆菌中扩增出645 bp及492 bp的目的条带;用针对RD10、TbD1建立的PCR方法分别在结核分枝杆菌及牛分枝杆菌中扩增出478 bp及361 bp的目的条带、358 bp及524 bp的目的条带。这3种PCR检测方法的准确率和特异性均为100%。敏感性试验结果显示,这些检测方法对结核分枝杆菌和牛分枝杆菌基因组DNA的检测极限均为10 pg。表明,此方法可用于牛源或人源结核分枝杆菌及牛分枝杆菌的快速鉴别检测。
- 朱汝仪潘文赵明秋琚春梅王波陈金顶
- 关键词：结核分枝杆菌牛分枝杆菌聚合酶链反应
