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浙江省1999-2011年麻疹流行株全基因组序列分析被引量：5: 2012年; 目的从全基因组层面探讨浙江省1999—2011年麻疹病毒的变异及其与疫苗株S191之间的差异。方法选取浙江省不同年份分离的麻疹病毒流行株9株，采用RT-PCR方法扩增全基因组序列，并与疫苗株S191及国外主要流行基因型毒株进行全序列比较分析。结果1999--2011年浙江麻疹流行株间的氨基酸同源性为98．77％～99．89％，麻疹病毒尚未受到明显的正向压力，各基因的变异仍属随机漂移。与疫苗株S191相比，两者间氨基酸的同源性仅为96．63％～98．16％，分别存在135—159个氨基酸的改变，其中共同的氨基酸变异位点113个，导致5个糖基化位点的变异。在核苷酸水平上，N基因的平均变异率最大（5．5％）；而在氨基酸水平上，P蛋白的平均变异率最大（7．7％）。此外，在全基因组序列上，浙江流行株与各国疫苗株的遗传距离均大于D4、B3基凶型流行株与各国疫苗组的遗传距离（t=-9．76，P〈0．05；t=-12．39，P〈0．05）。结论浙江麻疹流行株与疫苗株S191在各基因上均产生了较大的差异，现行疫苗株与H基因型流行株之间的差异远大于疫苗株与国外优势流行株（D4、B3基因型）之间的差异，应密切关注这一变化趋势，及早研究后备麻疹免疫株。; 金青青冯燕徐昌平卢亦愚钟淑玲莫世华; 关键词：麻疹病毒全基因组疫苗

浙江省2005-2010年风疹病毒分子流行病学研究被引量：4: 2011年; 目的分析2005--2010年浙江省风疹病毒流行株的病原学与分子流行病学特征。方法采集该期间风疹疫情中的疑似患者标本，于Vero细胞上分离病毒。采用巢式RT-PCR扩增流行株E1、E2和C三个结构基因片段，对扩增产物进行序列测定与分析。结果从52例临床标本中共分离到风疹病毒流行株7株，除RVi／Zhejiang．CHN／23．08株为2B基因型外，其余6株均属于1E基因型。基因进化树上，1E基因型流行株分别与香港、海南地区流行株具有最近亲缘关系，而2B基因型流行株与BuenosAires．ARG／46．08位于同一分支。遗传距离分析表明，浙江2B型流行株与全球其他地区流行株间的遗传距离（0．011）小于与中国流行株（0．023）间的遗传距离。浙江风疹流行株与中国风疹疫苗株BRDⅡ在核苷酸水平上的同源性为C〉E2〉E1，而氨基酸水平上的同源性为E1〉C〉E2，对应存在3、11和23个氨基酸的变异。各位点氨基酸熵值表明，E1蛋白上仅存在一个易变位点（熵值〉0．600），而E2蛋白上有7个易变异位点和1个高变异位点（熵值〉1．000）。结论2005--2010年浙江省存在两种基因型风疹病毒流行，1E为优势基因型，2B可能为境外输入株。流行株E1基因氨基酸序列相对保守，而E2基因氨基酸变异较大，在风疹病毒流行病学监测中除关注E1基因外，应开展对结构基因E2和C的研究。; 冯燕钟淑玲徐昌平史雯卢亦愚; 关键词：风疹病毒分子流行病学

依赖解旋酶恒温扩增技术快速检测麻疹病毒核酸被引量：7: 2012年; 目的建立依赖解旋酶恒温扩增[Helicase-dependent Isothermal Deoxyribonucleic Acid(DNA)Amplification,HDA]技术快速检测麻疹病毒核酸。方法在麻疹病毒的血凝素基因上设计特异性引物,采用逆转录-依赖耐热解旋酶恒温扩增(Reverse Transcription-therm ophilic HDA,RT-tHDA)技术进行恒温扩增,并对反应条件进行优化。结果采用RT-tHDA技术检测麻疹病毒核酸,对风疹病毒、流行性腮腺炎病毒、肠道病毒71型、呼吸道合胞病毒均无交叉反应,具有良好的特异性;且最低检测限可达5.012×10-10摩尔/升(mol/L),敏感度与普通RT-聚合酶链反应方法无明显差别。结论麻疹病毒RT-tHDA检测方法具有简便、特异、敏感以及对仪器要求低的特点,为麻疹病毒的核酸检测,提供了一种新方法。; 马丽敏卢亦愚徐昌平冯燕; 关键词：麻疹病毒

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浙江省自然科学基金(Y2091178)

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