国家自然科学基金(904090010)
- 作品数：7 被引量：239H指数：7
- 相关作者：沈自尹黄建华刘小雨吴斌林伟更多>>
- 相关机构：复旦大学第二军医大学同济大学更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金上海市卫生局中医药科研基金国家重点基础研究发展计划更多>>
- 相关领域：医药卫生更多>>
- 基于基因表达谱数据建立肾虚证量化数学模型被引量：25
- 2008年
- 目的利用基因表达谱数据,建立量化肾虚证程度的数学模型。方法采用4、10、18、24月龄SD大鼠,以24月龄大鼠加淫羊藿总黄酮(EF)干预,摘取大鼠下丘脑、垂体、肾上腺、淋巴细胞、骨、肝、肾、脾,利用基因芯片技术,检测全基因组mRNA表达,用不同月龄大鼠的基因表达谱数据建立神经网络模型,然后用此模型评价EF干预肾虚证的效果。结果7个组织共筛选到199个基因表达具年龄依赖特征,其中相当一部分为神经内分泌免疫相关基因。模型预判发现EF作用后,24月龄老龄大鼠下丘脑、垂体、肾上腺、肝、肾、骨、脾的基因表达与8～13月龄大鼠相似,分别为12.64、10.87、8.10、12.70、11.93、13.14、10.13月龄。结论基于基因表达谱数据能建立量化肾虚证程度的模型,并能预测补肾药的效果,研究也表明EF能使老年状态基因表达向年轻化靠近,提示其具有改善肾虚、延缓衰老的作用。
- 沈自尹张新民林伟吴斌黄建华刘小雨许世雄
- 关键词：肾虚证基因表达谱淫羊藿总黄酮数学模型
- 从基因表达谱和代谢组学角度探讨淫羊藿总黄酮延缓衰老的效应及机制被引量：21
- 2008年
- 目的用系统观点从不同角度揭示淫羊藿总黄酮(EF)延缓衰老的效应及机制方法50只SD大鼠分为4、10、18、24月龄组和EF组共5组,EF组大鼠自21月龄开始灌胃EF至24月龄。摘取大鼠下丘脑、垂体、肾上腺、淋巴细胞等组织,进行基因芯片检测;取血清,利用高效液相和质谱进行代谢组检测;利用专用芯片检测淋巴细胞NF-κB信号通路相关分子基因表达。利用上述数据,建立神经网络模型,评价衰老程度和药物干预的效果。结果199个基因表达具年龄依赖特征,EF能逆转大部分基因表达,神经网络模型输出显示EF使24月龄大鼠基因表达年轻化至8～13月龄;代谢组检测共获得1 885个代谢物谱峰,已鉴定17个代谢物随增龄变化显著,EF干预使代谢物水平年轻化至18月龄;NF-κB信号通路基因表达整体水平随增龄而降低,EF使之上升,神经网络模型显示向10.5月龄靠近。结论不同层面的衰老表型首先表现为均具有年龄依赖关系;EF能逆转不同层面的增龄性变化,具有同步的表现。
- 黄建华沈自尹吴斌刘小雨林伟
- 关键词：基因表达谱衰老淫羊藿总黄酮
- 中医药的一大特色——调节整体 改善局部被引量：12
- 2006年
- 整体观的运用体现在证概括了产生疾病的各方面因素和条件,并参考不同体质,辨证施治通过调节整体而改善局部病变,是中医学整体观具体运用,形成了中医药的一大特色。根据中医辨证,分别采用活血化瘀药、清热解毒药、芳香温通药、温补肾阳药对冠心病介入治疗后再狭窄、过度炎症反应、冠心病血管内皮损伤、肾上腺皮质功能降低等局部的病变有显著改善作用,从而体现了中医这一特色。
- 沈自尹
- 关键词：整体观辨证施治中医药特色
- 以药测证对肾虚和肾阳虚大鼠基因表达谱的比较研究被引量：57
- 2007年
- 目的在分子水平揭示肾虚和肾阳虚内涵的异同。方法肾虚证采用自然衰老大鼠模型,肾阳虚证采用皮质酮大鼠模型,均用淫羊藿总黄酮(epi mediumflavonids,EF)以药测证,分别取下丘脑、垂体、肾上腺、淋巴细胞(HPAT)组织,采用Affymetrix公司的大鼠全基因组芯片,各两次重复基因表达谱研究。结果老年大鼠和皮质酮大鼠与青年大鼠比较,在HPAT轴上首先是众多的神经递质显著下调,接下来是生长激素类和性激素类都显著下调,其表达下调的模式呈高度一致,EF能逆转上述基因的表达;但EF在皮质酮大鼠显著上调热休克蛋白(HSP)和细胞色素P450以及促甲状腺激素(TSH)大幅度上调。结论两组大鼠均具有肾虚的内涵,但肾阳的主要物质基础是甲状腺激素促进能量代谢的氧化磷酸化过程。
- 沈自尹黄建华陈伟华
- 关键词：肾虚肾阳虚基因表达谱
- 以药测证对肾虚证基因网络和信号转导的研究被引量：29
- 2005年
- 总结了从细胞内的小的信号转导通路组成的网络到中等的下丘脑—垂体—肾上腺—胸腺(HPAT)轴网络和涵盖全身,联络多个重要系统的大的神经内分泌免疫(NEI)网络,提出人体受到外界干预而形成的“病”或“证”,亦都是以众多的分子网络变化为基础。描绘了信号转导通路的方式、能力、研究信号转导通路变化的方法,提出“以药测证”是按系统生物学方法研究证的干预手段。作者采用补肾复方以药测证发现肾阳虚证涵盖着NEI调节网络,而且直接作用于NEI网络的调控中枢—下丘脑。采用从补肾复方中提取的有效组分———淫羊藿总黄酮(EF),发现它通过NEI网络的下行通路激活免疫系统,能激活生长激素轴、性腺轴、淋巴细胞凋亡3个方面的网络机制发挥分子网络效应;也观察到EF调控基因网络表现出多种多样的方式,在淋巴细胞凋亡和增殖的网络机制中重塑对立的凋亡相关基因及增殖相关基因平衡;能会聚与整合共刺激分子、转化生长因子及多个原癌基因,成为启动促增殖、抗凋亡的上游因子网络;使NIK/IKK/IκB/Rel/NFκB信号转导通路中对立的IκBα与NFκB同时升高,既维持NFκB适度升高,又保证NFκB呈强者态势发挥其分子调控网络中的枢纽作用,并由此观察到肾虚证HPAT轴上有序的基因网络调控路线图谱。
- 沈自尹
- 关键词：网络信号转导肾虚证以药测证
- 从整体论到系统生物学进行肾虚和衰老的研究被引量：56
- 2009年
- 中医学对世界医学的贡献之一就是整体观,我们从整体观出发研究了肾阳虚证与下丘脑-垂体-靶腺轴功能紊乱的联系;采用基因芯片技术研究老年大鼠(肾虚证)及中药干预后下丘脑-垂体-肾上腺-胸腺(HPAT)轴的分子网络调控规律;通过基因芯片也揭示存在于老年大鼠下丘脑、垂体、肾上腺、淋巴细胞、骨骼、肝脏、肾脏等与"肾"相关组织的神经-内分泌-免疫以及神经-内分泌-骨代谢两大基因网络路线,从而推进"证"的整体性研究。近年按照系统生物学的动态、干预、多层面整合的要求,在全基因组转录水平、代谢组和单个衰老相关信号通路3个不同层面揭示衰老在不同层面的共同规律;揭示出基因的时空关联随着衰老进程逐渐弱化;并且中药淫羊藿总黄酮能有效改善衰老在上述两方面的系统改变。因此从整体观到系统生物学的转变可能促进中医学进入现代生命科学领域。
- 沈自尹黄建华林伟王琦吴斌刘小雨张新民许世雄张卫东
- 关键词：整体观肾阳虚系统生物学衰老
- 系统生物学和中医证的研究被引量：66
- 2005年
- 对自 15世纪下半叶以来科学思想和科学方法论的回顾 ,阐明还原论是研究存在的科学 ,而涌现论则是生成的观点 ,科学的态度是把还原论和整体论结合起来 ,指出系统生物学理论和分子生物学相结合 ,以及数学建模的方法是生命科学研究的新趋势 ,而“证”的研究正好和这个处于科学前沿、综合程度很强的系统生物学理论相结合 ,将几十年来用还原论方法在分子水平的研究成果用生物数学方法进行系统整合 ,将再次把“证”
- 沈自尹
- 关键词：系统生物学中医证还原论数学建模
