国家自然科学基金(31128016)
- 作品数:2 被引量:18H指数:2
- 相关作者:徐吉臣李昊阳徐倩施杨徐筱更多>>
- 相关机构:北京林业大学更多>>
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- 相关领域:农业科学生物学更多>>
- 水稻扩展蛋白家族的生物信息学分析被引量:14
- 2014年
- 扩展蛋白是植物细胞壁的重要组成部分,具有松驰细胞壁和增加细胞壁柔韧性的作用,在植物的生长发育及抗性等方面起到重要的作用.水稻的全基因组序列统计分析显示,水稻扩展蛋白基因家族包含58个成员,分属于A(34)、B(19)、LA(4)和LB(1)4个亚家族,分布在水稻10条染色体上的58个位点,且同一亚家族成员有成簇存在的现象.扩展蛋白基因长度范围为687~1128 bp,编码蛋白质具有保守的结构域,以及保守的半胱氨酸和色氨酸残基.多数情况下,亚家族成员之间的氨基酸一致率小于35%,而同一亚家族成员之间的氨基酸一致率大于35%.在内含子、外显子组成模式上,水稻扩展蛋白呈现明显的亚家族特异性,除个别基因以外,A类基因含有1或2个内含子,B类含有3个内含子,LA和LB类含有4个内含子.密码子使用统计显示,与其他物种相比,水稻中的扩展蛋白具有更多的密码子使用偏好性,有26个高频密码子存在.研究结果展示了水稻扩展蛋白基因家族的基本信息,为深入研究扩展蛋白基因的功能、探讨物种间的进化关系奠定基础.
- 施杨徐筱李昊阳徐倩徐吉臣
- 关键词:水稻细胞壁基因家族生物信息学
- 12个草地早熟禾品种愈伤组织诱导体系的研究被引量:4
- 2012年
- 以生产中常见的12种草地早熟禾(Poa pratensis L.)成熟种子为外植体,对其愈伤组织诱导及愈伤组织增殖生长体系进行了优化试验.结果表明,在愈伤组织诱导试验中,单纯使用2,4-D时,不同品种愈伤组织诱导率在60%~93%之间,2,4-D质量浓度3 mg/L时12个早熟禾品种的愈伤组织诱导率均值最高,达到86%;在2,4-D基础上添加少量6-BA(0.1~0.2 mg/L)后,不同品种愈伤组织诱导率在30%~92%之间,12个品种的愈伤组织诱导率均值有所降低(3.1%~25.4%).在愈伤组织增殖试验中,单纯使用2,4-D时,不同品种愈伤组织增殖率在38%~164%之间,12个早熟禾品种的愈伤组织增殖率均值在3 mg/L 2,4-D时最高,达到81%;在3 mg/L 2,4-D基础上施加少量的6-BA(0.05~0.2 mg/L)后,愈伤组织增殖率均值有所降低,但存在品种的差异性.研究结果还显示,热激处理对部分草地早熟禾愈伤组织诱导及增殖有一定的促进作用.
- 代亮柳玉霞刘洁李昊阳王晓桐徐吉臣
- 关键词:草地早熟禾愈伤组织诱导增殖率