河南省科技计划项目(102102110180)
- 作品数：2 被引量：3H指数：1
- 相关作者：周晓平陈小麟方文珍管昊林清贤更多>>
- 相关机构：厦门大学更多>>
- 发文基金：河南省科技计划项目国家自然科学基金福建省自然科学基金更多>>
- 相关领域：生物学更多>>
- 白鹭脱落羽毛的微卫星个体识别研究被引量：2
- 2013年
- 利用鹭科鸟类已有微卫星引物进行跨种扩增筛选，获得12对可用于白鹭（Egretta garzetta）的微卫星引物，结合非损伤采集的脱落羽毛样品，在物种分子鉴定和性别分子鉴定的基础上，建立适用于羽毛样品个体识别分析的微卫星基因分型技术体系．在中国沿海的3个白鹭繁殖种群的181样品中，19个羽毛样品由于DNA质量较差未能有效鉴定物种．119个羽毛样品成功地鉴定为白鹭个体，物种鉴定结果可重复率达93．8％．性别鉴定结果可重复率94．1％，119个白鹭羽毛样品当中的28．57％为雄性．基因分型得到各个位点的等位基因数7～22个，观察杂合度和期望杂合度分别为0．623-0．875和0．779～0．918，没有位点偏离哈迪一温伯格平衡，基因分型错误率为1．2％．个体识别分析发现其中的2个样品为相同基因型，为重复采集自同一个体脱落的不同羽毛．本研究结果将为深入研究白鹭种群遗传结构、扩散模式等保护遗传学问题奠定了基础，并且能够为其他鹭科鸟类的脱落羽毛的物种鉴定、性别鉴定、个体识别提供参考．
- 管昊林清贤周晓平方文珍陈小麟
- 关键词：白鹭羽毛微卫星基因分型
- 应用T载体连接PCR技术分离黄嘴白鹭微卫星位点被引量：1
- 2012年
- 传统的微卫星分离策略对于低丰度的物种如鸟类而言,通常是低效的.探讨了一种改良的T载体PCR序列获取法用于黄嘴白鹭(Egretta eulophotes)微卫星DNA的分离,称为T载体连接PCR(T-vector-ligation PCR,TVL-PCR).在获取第一侧微卫星序列的71个阳性克隆中,59个克隆含有重复序列,设计了48对位点特异巢式引物.经过两轮TVL-PCR后,31个位点的扩增产物为预期大小,经测序后获得21个完整的微卫星位点.除去侧翼序列过短和小卫星位点外,设计16个微卫星位点进行多态信息检测,其中7个位点显示出多态性,平均等位基因数为2～20,观察杂合度(HO)和期望杂合度(HE)分别为0.375～0.958和0.477～0.956,所有位点都符合哈迪-温伯格平衡(HWE)和连锁平衡.说明TVL-PCR技术对低丰度微卫星物种的位点分离具有一定的应用价值.
- 黄勋和周晓平方文珍陈小麟
- 关键词：黄嘴白鹭
