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国家自然科学基金(31072001)

作品数:4 被引量:9H指数:1
相关作者:徐苹雷初朝黄洁萍刘东花毛春春更多>>
相关机构:西北农林科技大学更多>>
发文基金:国家自然科学基金更多>>
相关领域:农业科学更多>>

文献类型

  • 4篇中文期刊文章

领域

  • 4篇农业科学

主题

  • 4篇多态
  • 4篇多态性
  • 2篇多态性分析
  • 2篇基因
  • 2篇RFLP
  • 2篇SNP
  • 1篇单倍型
  • 1篇单核
  • 1篇单核苷酸
  • 1篇单核苷酸多态
  • 1篇单核苷酸多态...
  • 1篇新疆驴
  • 1篇遗传多样性分...
  • 1篇片段
  • 1篇限制性片段长...
  • 1篇限制性片段长...
  • 1篇基因多态性
  • 1篇基因多态性研...
  • 1篇家驴
  • 1篇核苷

机构

  • 3篇西北农林科技...

作者

  • 3篇雷初朝
  • 3篇徐苹
  • 2篇毛春春
  • 2篇刘东花
  • 2篇黄洁萍
  • 1篇孙伟
  • 1篇党瑞华
  • 1篇王风巧

传媒

  • 3篇家畜生态学报
  • 1篇Journa...

年份

  • 1篇2017
  • 1篇2013
  • 2篇2012
4 条 记 录,以下是 1-4
排序方式:
玉树马和德保矮马SLC36A1基因多态性研究被引量:1
2013年
控制马香槟毛色的CH(Champagne gene)基因家族包含4个候选基因(SLC36A1、SLC36A2、SLC36A3、SPARC),研究发现SLC36A1基因外显子2的突变是造成马香槟毛色的关键位点。为揭示中国马SLC36A1基因遗传多态性,本研究以玉树马和德保矮马共74个样本为研究对象,以马DNA池为模板扩增SLC36A1基因的10个外显子及部分内含子序列并进行测序分析。共发现马SLC36A1基因5个SNPs,分别位于内含子3(g.26699953A>G,g.26699851G>C,g.26699850G>C),外显子4(g.26699562G>A)及外显子6(g.26697018C>T)。利用PCR-RFLP方法对74个家马样本进行基因分型,发现外显子6的SNP有基因型CC、CT;外显子4的SNP有基因型GG、GA;内含子3的g.26699850G>C突变有基因型GG、GC;内含子3的另外2个SNPs(g.26699953A>G,g.26699851G>C)通过测序,发现有AA、AG、GG与GG、GC、CC基因型。所有5个马SNPs均为野生型占主要优势。由此界定了马SLC36A1基因有9种单倍型(H1-H9),其中H5是最主要的单倍型。德保矮马遗传多样度为0.4190,比玉树马(0.2228)高,表明德保矮马香槟毛色遗传多态性比玉树马更丰富。玉树马与德保矮马的平均单倍型多样度为0.3160,表明其香槟毛色遗传多态性相对较低。
徐苹黄洁萍王风巧党瑞华雷初朝
关键词:多态性SNPPCR-RFLP
德保矮马与哈萨克马KIT基因多态性分析被引量:1
2012年
马毛色是品种鉴定和个体识别的重要依据。马KIT基因位于3号染色体,KIT基因突变影响马毛色及毛色的分布。对德保矮马和哈萨克马69个个体的KIT基因21个外显子及部分内含子直接测序,共发现了5个SNPs,其中1个位于5'-UTR区(g.91214T>G),1个位于内含子20(g.171356C>G),另外3个分别位于外显子15、20和21(g.164297C>T;g.170189C>T;g.171471G>A,p.Ala960Thr)。用PCR-RFLP方法对69个个体进行分型,发现外显子15有3种基因型TT、CT、CC;外显子20有3种基因型TT、CT、CC;外显子21有2种基因型GG与GA,且均为野生型占优势。德保矮马KIT基因多态性比哈萨克马更丰富。
毛春春孙伟刘东花徐苹雷初朝
关键词:KIT基因SNP
新疆驴和青海驴MSTN基因多态性分析
2012年
为揭示中国家驴MSTN基因的遗传多样性,以新疆驴和青海驴为研究对象,根据GenBank上公布的马的MSTN序列,设计9对特异性引物,利用驴混合DNA池为模板对该MSTN基因部分序列进行PCR扩增和测序分析。结果显示,扩增出的驴MSTN基因部分序列长度为3242bp,包括5'-UTR区(671bp)、第一外显子(373bp)、第一内含子(1825bp)和第二外显子(373bp)。在该基因中共发现4个SNPs,分别为65bp处T→C(5'-UTR),872bp处A→G(第一外显子),2017bp处G→A(第一内含子),2395处C→G突变(第一内含子)。利用PCR-RFLP技术对新疆驴和青海驴共计80个样本进行基因分型,4个突变位点共检测到6种单倍型(H1-H6),其中H1是最主要的单倍型。两个家驴品种MSTN基因的遗传多样性很丰富(H=0.6044),这对中国驴的遗传资源保护具有重要作用。
刘东花徐苹黄洁萍毛春春雷初朝
关键词:家驴MSTN基因单倍型
The genetic diversity analysis in the donkey myostatin gene被引量:7
2017年
Myostatin(MSTN)gene negatively controls skeletal muscle development and growth,variations of which play an important role in the regulation of skeletal muscle growth in mammals.However,study on genetic polymorphism of MSTN gene in donkey is limited.In this study,we screened the single nucleotide polymorphsims(SNPs)of MSTN gene in 13 Chinese donkey breeds.Four novel SNPs(g.229T>C,g.872A>G,g.2014G>A,and g.2395C>G)were detected and genotyped by sequencing and polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism(PCR-RFLP)methods.Six haplotypes(H1–H6)were analyzed,which indicated abundant haplotype diversities in Chinese donkeys.The haplotype H1 was the most dominant and ancient in all breeds.Xinjiang donkey displayed the highest haplotype diversity.The Neighbour-Joining(NJ)tree of MSTN gene among different species was constructed.The clustering result of nine species was consistent with the fact of species differentiation.Our results will provide a reliable theoretical basis for the preservation,exploration and utilization of Chinese donkey genetic resources.
LIU Dong-huaHAN Hao-yuanZHANG XinSUN TingLAN Xian-yongCHEN HongLEI Chu-zhaoDANG Rui-hua
关键词:遗传多样性分析MSTNN基因限制性片段长度多态性单核苷酸多态性
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