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番茄NAC转录因子家族的鉴定及生物信息学分析被引量：19: 2014年; NAC转录因子家族是植物特有的一类转录因子,在植物的生长发育、器官建成及逆境胁迫和激素信号应答中均发挥重要作用。本研究在基因组范围内,利用生物信息学方法对番茄的NAC转录因子家族成员、分布及结构和功能等进行分析。预测结果显示番茄NAC家族包含102个蛋白质,分为12亚族,其中茄属特有的TNAC亚族中成员最多,具有25个,其他NAC转录因子与拟南芥NAC家族具有相似分类。保守基序分析,在番茄NAC结构域中包含7个保守的NAM基序,主要分布在序列的N端,表明这些基序的存在对NAC蛋白质功能的执行是必需的。理化性质和结构分析表明,番茄NAC蛋白质绝大多数是亲水蛋白质,主要以无规则卷曲构成,而α-螺旋、β-折叠和β-转角则散布于整个蛋白质中,在各亚族中没有规律。; 陈秀玲王傲雪张珍珠李景富; 关键词：番茄 NAC转录因子生物信息学

三株生防酵母菌对Botrytis cinerea的抑菌作用研究被引量：2: 2014年; 针对三株生防酵母菌Cryptococcus albidus 63(Ca63)、Cryptococcus albidus 64(Ca64)、Candida parapsilosis yett1006对番茄灰霉病病原菌B.cinerea t08016b的抑菌作用进行研究。三株生防酵母菌与B.cinerea t08016b的对峙培养过程中,未产生明显抑菌圈,均可减弱B.cinerea t08016b生长势;几丁质酶和β-1,3-葡聚糖酶活性测定结果表明,t08016b并无诱导三株酵母菌分泌酶活显著增加(P>0.05);研究酵母菌对B.cinerea t08016b菌丝生长和孢子萌发率影响发现,C.albidus 63、C.albidus 64和C.parapsilosis yett1006对菌丝生长量的抑制率分别为88.57%、90.66%和85.65%,高浓度菌液对孢子萌发有显著抑制效果,1×108cfu·mL-1菌体活细胞能完全抑制病原菌孢子萌发,菌体活细胞浓度越低抑制效果越不明显,无菌滤液和灭活的菌体活细胞对病原孢子的萌发无显著抑制效果。结果表明,生防酵母菌主要通过竞争有限的生长空间和营养条件,而非通过分泌抑菌物质实现拮抗作用。; 王傲雪关鑫张俊峰张珍珠王瑞虎陈秀玲; 关键词：生防酵母菌孢子萌发率

番茄热激转录因子HSF家族的系统进化分析被引量：5: 2016年; 热激转录因子(heat Shock factors)普遍存在于整个生物界中,在调控植物生长发育以及对环境的响应中起重要作用。目前,已经对多个物种的HSF基因进行生物信息学分析,但未见对番茄中HSF基因家族的分析报道。通过番茄基因组数据库,鉴定和分析番茄HSF转录因子家族,获得24个HSF基因家族成员。多重序列比对发现番茄HSF基因具有保守的DBD结构域和广泛的保守基序。根据与拟南芥基因系统进化分析将这些基因分类,分成Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ支,又将Ⅰ支分成A、B、C 3个亚支,并且存在5对旁系同源蛋白和10对直系同源蛋白。染色体分布和遗传分析结果表明,番茄HSF基因存在于10条染色体上,呈不均匀分布。; 王婷婷仇有文王沛文陈宏宇杨俊颖王窦逗伍淼王傲雪; 关键词：番茄基因家族系统进化

解淀粉芽孢杆菌TF28抗菌蛋白TasA基因序列分析及蛋白质结构预测被引量：5: 2015年; 本研究以解淀粉芽孢杆菌TF28为材料,采用PCR方法从基因组DNA中扩增出抗菌蛋白TasA基因,利用生物信息学方法对TasA基因序列及其编码的蛋白质结构进行分析和预测。结果表明TasA基因全长786 bp,含有一个完整的开放阅读框和一个终止密码子,编码261个氨基酸,经Blast比对,该基因与其它解淀粉芽孢杆菌TasA基因同源性为95%-99%,与B.amyloliquefaciens FZB42（CP 000560.1）TasA基因序列同源性最高为99%,与B.amyloliquefaciens DSM7（FN597644.1）的同源性最低为95%。预测该基因编码蛋白质分子量为28 kD,等电点为6.35,是含有信号肽和跨膜结构的亲水蛋白,蛋白结构中含有糖基化和磷酸化位点,二级结构中以琢螺旋、茁折叠和无规则卷曲为主。; 高娃姜威孟利强李晶陈靖宇曹旭胡基华刘宇帅张鹏远张淑梅; 关键词：解淀粉芽孢杆菌蛋白结构预测

一株淡色生赤壳菌的生防作用分析及系统发育树构建被引量：4: 2014年; 保护地栽培面积的增加使果蔬病害的防治难度加大,生物防治手段越来越受到青睐。采用平板对峙法、扫描电镜法、5.8S rDNA-ITS序列分析及系统发育树构建对一株从草炭土中分离的菌株进行研究。该菌对番茄灰霉病、番茄叶霉病、番茄绵疫病、番茄黄萎病、番茄枯萎病、杨树烂皮病、杨树枯萎病和黑穗醋栗叶斑病均有抑制作用。扫描电镜显示,该生防菌对番茄灰霉病具有明显抑制作用。5.8S rDNA-ITS序列分析及系统发育树构建表明该菌为淡色生赤壳菌,为果蔬病害的生物防治提供了新的选择。; 陈秀玲李景富张丽莉张俊峰王傲雪; 关键词：系统发育树番茄灰霉病

多毛番茄冷诱导转录因子CBF1转化番茄的研究被引量：4: 2015年; 番茄在气温低于12℃时即不能正常开花结实,因此番茄生产受到了很大限制。多毛番茄是一种野生番茄,具有耐低温甚至抗冻的特性,短暂遭受0℃的低温,仍能正常开花结实。构建了多毛番茄冷诱导转录因子CBF1的植物表达载体,并通过农杆菌介导法转入番茄中,获得8株转基因阳性植株。转基因植株经冷诱导处理后,丙二醛(MDA)含量和超氧自由基(O-2·)含量均低于非转基因对照,而超氧化物歧化酶(SOD)活性、过氧化物酶(POD)活性、脯氨酸(Pro)含量、过氧化氢酶(CAT)活性、抗坏血酸过氧化物酶(ASA)活性和苯丙氨酸解氨酶(PAL)活性则高于非转基因对照,表明转多毛番茄CBF1基因(Sh CBF1)可以提高番茄的抗冷性。; 王沛文朱文哲刘阳李景富陈宏宇陈秀玲王傲雪; 关键词：多毛番茄耐冷性番茄

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国家自然科学基金(31301780)