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国家自然科学基金(30230280)

作品数:7 被引量:105H指数:5
相关作者:相建海张留所吴长功王鸿霞李富花更多>>
相关机构:中国科学院中国海洋大学中国水产科学研究院黄海水产研究所更多>>
发文基金:国家自然科学基金国家高技术研究发展计划国家重点基础研究发展计划更多>>
相关领域:农业科学生物学更多>>

文献类型

  • 7篇中文期刊文章

领域

  • 5篇农业科学
  • 3篇生物学

主题

  • 6篇对虾
  • 4篇微卫星
  • 3篇基因
  • 3篇凡纳滨对虾
  • 2篇中国对虾
  • 2篇微卫星位点
  • 2篇位点
  • 1篇选择性
  • 1篇中国明对虾
  • 1篇实时RT-P...
  • 1篇图位克隆
  • 1篇片段
  • 1篇亲本
  • 1篇亲权
  • 1篇亲权鉴定
  • 1篇全基因
  • 1篇全基因组
  • 1篇全基因组测序
  • 1篇微卫星标记
  • 1篇抗菌肽

机构

  • 6篇中国科学院
  • 1篇中国水产科学...
  • 1篇中国海洋大学

作者

  • 6篇相建海
  • 3篇张留所
  • 2篇王鸿霞
  • 2篇张晓军
  • 2篇李富花
  • 2篇吴长功
  • 1篇孔晓瑜
  • 1篇王兵
  • 1篇孔杰
  • 1篇张绍萍
  • 1篇张洋
  • 1篇刘斌
  • 1篇喻子牛
  • 1篇李云
  • 1篇钟文慧

传媒

  • 2篇海洋科学
  • 2篇遗传
  • 1篇Curren...
  • 1篇海洋学报
  • 1篇Chines...

年份

  • 1篇2012
  • 1篇2008
  • 3篇2006
  • 2篇2005
7 条 记 录,以下是 1-7
排序方式:
基于SAMPL的一种微卫星筛选方法在中国明对虾中的尝试
2006年
微卫星的发展主要受限于微卫星及其旁侧特异引物区的分离,在中国明对虾(Fenner-openaeus chinensis)中建立了选择性扩增多态微卫星位点(SAMPL,selective amplified mic-rosatellite polymorphic loci)技术体系,并初步尝试了基于SAMPL的一种微卫星筛选方法。通过5′端锚定引物引入微卫星序列,对传统SAMPL技术加以改进并以期富集简单重复序列。从测序胶上随机选择5条SAMPL条带(分别命名为S11,S13,S14,S22,S24)克隆测序,大小分别为161,157,147,152,298。其中S11,S13,S14,S22四个片段两端引物分别为AFLP选择性引物和SAMPL引物,S13和S22含微卫星序列重复,S24两端引物均为传统的AFLP引物,在此片断中有一(AG)39重复。
张留所孔晓瑜喻子牛孔杰相建海
关键词:微卫星
凡纳滨对虾繁殖中不同亲本对子代遗传贡献率的差异被引量:20
2006年
利用5个含有稀有等位基因的高度多态性微卫星位点比较了凡纳滨对虾繁殖中不同亲本对子代遗传贡献率的差异。通过稀有等位基因的5个微卫星位点能够对亲代和子代的谱系进行明确的鉴别。10个亲代个体中有8个个体对子代群体的基因库有贡献,不同个体之间的贡献率存在差别,最高为54.28%,最低为8.57%。在亲代和子代群体遗传结构的分析中,子代等位基因的数目与亲代相比降低了11.11%。子代的平均期望杂合度(He)、平均观测杂合度(Ho)和平均多态性信息含量(PIC)等指标均低于亲代。实验结果表明:亲本对子代基因库的贡献率的差异也是造成子代群体遗传变异水平降低的原因之一;微卫星标记可作为一种有效的工具用于对虾系谱的确认。
王鸿霞吴长功相建海
关键词:凡纳滨对虾微卫星亲权鉴定
基因组研究的关键平台--大片段文库被引量:5
2008年
张洋张晓军刘斌李富花相建海
关键词:基因组文库全基因组测序图位克隆克隆载体
微卫星标记应用于凡纳滨对虾家系鉴别的研究被引量:42
2006年
以人工选育建立的凡纳滨对虾(Litopenaeusvannamei)全同胞家系为实验材料,探讨了微卫星标记对混养家系进行亲权鉴定的可能性。Cervus模拟分析表明从10个微卫星基因座组合中选取的多态性信息含量最高的6个进行组合与原组合的累积排除概率均在0.99,多态性信息含量最高的6个基因座的组合判定正确率为0.97,置信度为95%。在家系混养的模拟实验中使用这6个高多态性的微卫星基因座从20个候选雌虾中找到真正母亲的概率为88%,从30个候选雄虾中找到真正父亲的概率为78%,低于理论预测值,分析可能与微卫星基因座中的无效等位基因、等位基因的突变以及PCR过程中Taq酶发生链滑移等因素有关。
王鸿霞吴长功张留所相建海
关键词:微卫星凡纳滨对虾
凡纳滨对虾微卫星位点在两个选育家系中遗传的初步研究被引量:24
2005年
利用两个选育凡纳滨对虾全同胞家系研究了10个微卫星位点的遗传特征。通过ABI310或3100测序仪检测,在所观察到的20个基因型比例(genotypic ratios)(10个微卫星位点×2个家系)中,有17个基因型比例符合孟德尔遗传。微卫星位点TUMXLv8.220在两个家系中均存在无效等位基因,从而3个不符合孟德尔遗传基因型中2个可由无效等位基因来解释。TUMXLv3.1在06家系偏离了1∶1∶1∶1的孟德尔预期比。3个微卫星位点(TUMXLv5.66,TUMXLv7.74,TUMXLv8.224)在两个家系中均表现单态。3个微卫星位点(TUMXLv5.45,TUMX-Lv7.56,TUMXLv8.256)在两个家系均既表现多态又遵循孟德尔共显性遗传,是亲子鉴定和种群遗传分析的较好选择。结果显示在应用微卫星标记进行遗传分析之前利用全同胞家系进行遗传模式研究是非常必要的。
张留所相建海
关键词:凡纳滨对虾微卫星
Expression profiles of antimicrobial peptides (AMPs) and their regulation by Relish被引量:2
2012年
Antimicrobial peptides (AMPs), as key immune effectors, play important roles in the innate immune system of invertebrates. Different types of AMPs, including Penaeidin, Crustin, ALF (antilipopolysaccharide factor) have been identified in different penaeid shrimp; however, systematic analyses on the function of different AMPs in shrimp responsive to different types of bacteria are very limited. In this study, we analyzed the expression profiles of AMPs in the Chinese shrimps, Fenneropenaeus chinensis, simultaneously by real-time RT-PCR (reverse transcription-polymerase chain reaction) when shrimp were challenged with Micrococcus lysodeikticus (Gram-positive, G + ) or Vibrio anguillarium (Gram-negative, G+). Different AMPs showed different expression profiles when shrimp were injected with one type of bacterium, and one AMP also showed different expression profiles when shrimp were challenged with different bacteria. Furthermore, the expression of these AMPs showed temporal expression profiles, suggesting that different AMPs function coordinately in bacteria-infected shrimp. An RNA interference approach was used to study the function of the Relish transcription factor in regulating the transcription of different AMPs. The current study showed that Relish could regulate the transcription of different AMPs in shrimp. Differential expression profiles of AMPs in shrimp injected with different types of bacteria indicated that a complicated antimicrobial response network existed in shrimp. These data contribute to our understanding of immunity in shrimp and may provide a strategy for the control of disease in shrimp.
王冬冬李富花李诗豪温荣相建海
关键词:基因表达谱AMPS抗菌肽实时RT-PCR中国对虾
中国对虾6种组织cDNA文库的构建被引量:23
2005年
以中国对虾血液、眼柄、卵巢、雌虾头胸部、雄虾头胸部和三倍体对虾头胸部组织为材料,采用异硫氰酸胍一酸酚法提取总RNA;用磁珠法纯化mRNA;用UniZAPcDNA合成试剂盒合成双链cDNA并进行修饰,将cDNA定向连接在UniZAP载体上;经Gigapack GoldPackage包装试剂盒包装成为噬菌体颗粒,转染宿主XLl Blue MRF’菌株细胞,形成初级文库.初级文库经转染进一步扩增,形成稳定的cDNA文库.6个文库的库容在0.2×10^6~1.3×10^6之间,重组率都超过90%.从各文库随机取出6~10个清晰的噬菌斑进行PCR扩增,用琼脂糖凝胶电泳检测,其插入片段长度为500~2500bp.由初步功能基因克隆获得阳性结果.多项指标表明,所构建的对虾cDNA文库质量较高,为进一步筛选目的基因、EST测序和制作基因芯片提供了有效的工具.
张晓军王兵张绍萍李云钟文慧李富花相建海
关键词:中国对虾CDNA文库功能基因
共1页<1>
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