安徽省高校省级自然科学研究项目(KJ2009A70)
- 作品数：2 被引量：10H指数：1
- 相关作者：江海洋程备久朱苏文骆晨江腾更多>>
- 相关机构：安徽农业大学更多>>
- 发文基金：安徽省自然科学基金安徽省高校省级自然科学研究项目更多>>
- 相关领域：农业科学更多>>
- 玉米细胞分裂素反应调节因子基因的克隆与进化分析
- 2010年
- 在植物的生长发育过程中,细胞分裂素在调节细胞分裂和组织发育中起着非常重要的作用。研究表明细胞分裂素的信号转导是一种双组分信号转导途径,在这个系统中,由3种蛋白组成,分别是组氨酸激酶、磷酸转移蛋白和反应调控因子。利用已经克隆的玉米和水稻细胞分裂素反应调节因子基因,进行BLAST分析从玉米全基因组中获得候选ZmRR类型基因。然后设计全长基因引物,通过Trizol法提取玉米叶片总RNA,利用RT-PCR技术克隆出全长候选基因。序列分析表明所扩增序列含有完整的编码框,其编码156个氨基酸残基。序列比对分析其与ZmRR1-10基因具有较高的同源性,并命名为ZmRR11,系统进化树分析证实其属于A类细胞分裂素调控因子,并对所有ZmRR类型基因进行motif分析,共发现37个保守的motif。该基因的克隆和进化分析对阐明玉米双元信号传导体系具有重要的意义。
- 江海洋洪玲朱苏文程备久
- 关键词：玉米细胞分裂素进化
- 玉米Dof转录因子家族基因的全基因组分析被引量：10
- 2010年
- Dof转录因子家族在植物生长发育和基因表达调控过程中具有重要的作用,本文利用公布的玉米基因组草图数据,利用生物信息学方法对玉米全基因组Dof基因的结构、系统进化关系和保守motif进行了分析。结果表明:玉米中共有18个Dof类型基因,命名为ZmDof1-ZmDof18,其蛋白质长度在211aa至618aa之间,通过系统进化树分析后,18个Dof基因可以明显的分为三类,此外玉米Dof基因的数目远远小于水稻和拟南芥,基因复制现象较少是玉米Dof基因数量较少的原因之一,MEME分析证实了Dof基因含有三个保守的motif。对玉米Dof类型基因的系统分析,将有助于玉米Dof类型基因的克隆和功能的进一步研究。
- 江海洋骆晨江腾程备久朱苏文
- 关键词：玉米生物信息学
