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mRNA的二级结构对蛋白质折叠速率的影响被引量：10: 2014年; 建立了一个包含核酸序列信息的蛋白质折叠数据库。以此为基础,对于每一个蛋白质,计算了其相应编码mRNA序列的茎结构含量、环结构含量、折叠自由能及mRNA的柔性等描述mRNA二级结构特征的基本参量。进一步分析了这些mRNA二级结构参量与相应蛋白质折叠速率的关系。结果表明,mRNA茎结构含量与蛋白质折叠速率呈显著负相关性,而环结构含量则与蛋白质折叠速率呈显著正相关性;同时,mRNA的柔性与相应蛋白质折叠速率呈极显著正相关性。进一步的分析表明,当把蛋白质分为不同二级结构类型和折叠类型后,mRNA的柔性对不同类型蛋白质的折叠速率均为重要的影响因素,而mRNA的茎结构含量和环结构含量主要影响二态蛋白质的折叠。结果证实,mRNA的二级结构对蛋白质的折叠有着重要作用。; 李瑞芳于志芬黄俏; 关键词：MRNA

冠状病毒同义密码子使用对mRNA二级结构的影响: 2015年; 从NCBI中获得了45种冠状病毒的mRNA序列总计416条.分别计算了每条编码序列中相对同义密码子使用度(RSCU),然后预测每条mRNA序列的RNA二级结构,计算相应mRNA茎结构含量、环结构含量、单位平均折叠自由能以及mRNA柔性.由此,建立了冠状病毒mRNA二级结构数据库.在此基础上,分析每条mRNA序列同义密码子使用度与mRNA二级结构之间的相关性.分析结果表明,有90%的氨基酸所对应的密码子使用度与mRNA茎结构含量显著相关;有75%的氨基酸所对应的密码子使用度与mRNA环结构含量显著相关;有90%的氨基酸所对应的密码子使用度与单位平均折叠自由能显著相关;有85%的氨基酸所对应的密码子使用度与mRNA柔性显著相关.进一步分析发现,同时与茎结构含量和环结构含量都显著相关的密码子,它们的使用度与两种结构含量的相关性截然相反,在所选的参量中,柔性与同义密码子使用度显示出更好的相关性.结果证实,冠状病毒同义密码子的使用对mRNA二级结构存在很大的影响.; 黄俏李瑞芳于志芬李雪; 关键词：冠状病毒 MRNA二级结构

以初学物理为契机谈“学困生”的转化策略被引量：1: 2016年; "学困生"的转化问题是学校、家长、社会共同关注的问题,一个班级,只有实现了对"学困生"的转化,才能提高教学质量,提升学生管理工作水平。同时,人们认识到,"学困生"的转化问题是教育工作者们面临的一个难题,需要找准机会,共同努力解决。本文结合笔者的教学经历以及对物理学科的理解,对"学困生"的特征进行了分析,并从物理教师的角度,提出了"学困生"一个转化时机——初学物理,论述了在物理教学中对"学困生"的转化对策,意在帮助"学困生"重新找回自信,并激发学习兴趣。; 李欣李瑞芳; 关键词：学困生物理学

大肠杆菌的同义密码子使用偏性对蛋白质折叠速率的影响被引量：1: 2015年; 考虑到同义密码子使用偏性的物种差异性,选取大肠杆菌的54条核蛋白为研究对象,将每条核蛋白按二级结构截取出α螺旋片段、β折叠片段和无规卷曲(α-β混合)片段,然后找到每个片段相关的核酸序列信息,计算其同义密码子使用度和相应肽链的折叠速率.在此基础上,分析了同义密码子使用偏性和相应肽链折叠速率之间的相关性,发现对于不同二级结构类的肽链片段,都有部分密码子的使用偏性与其对应的肽链折叠速率显著相关.因此,在蛋白质折叠中,同义密码子的使用偏性起着重要作用.; 黄俏李瑞芳于志芬; 关键词：大肠杆菌核蛋白同义密码子

同义密码子的使用偏好性对蛋白质折叠速率的影响被引量：10: 2013年; 在现有蛋白质折叠速率数据库和相关文献的数据基础上,建立了一个较大的蛋白质折叠速率库,并在其中收集了相关的核酸序列的信息,然后计算了每一条蛋白对应的核酸序列的同义密码子使用度。在此基础上,对每类蛋白质分析了它们相应核酸序列同义密码子的使用度与蛋白质折叠速率之间的关系。结果表明,对于不同二级结构以及不同折叠类的每类蛋白质,都有一些密码子的使用偏好性与相应折叠速率显著相关。结果证实,在蛋白质折叠过程中,同义密码子的使用偏好性可能起着重要的作用。; 于志芬李瑞芳; 关键词：同义密码子

如何在高校教学中增强学科交叉意识被引量：1: 2014年; 科学技术发展的趋势表现为不同学科之间的交叉与融合,适应交叉科学的发展,我国高校教学改革势在必行。作为当代高校教师,时代要求我们不断扩展视野,不断完善知识结构,不断调整教学模式。这就要求我们在教学中不断增强学科交叉意识,在课堂中积极引入现代科技前沿知识,体现其他学科与本学科的密切相关性,培养学生良好的思维习惯和较高的科研能力。; 李瑞芳; 关键词：高校教学素质教育

枯草芽孢杆菌同义密码子使用偏性对蛋白质折叠速率的影响被引量：2: 2014年; 目前,有关同义密码子使用偏性对蛋白质折叠的影响研究中,样本蛋白均来源于不同的物种。考虑到同义密码子使用偏性的物种差异性,选取枯草杆菌的核蛋白为研究对象。首先,将每条核蛋白按二级结构截取为α螺旋片段、β折叠片段和无规卷曲(α-β混合)片段,并计算其蛋白质折叠速率。然后,整理每个片段相应的核酸序列信息,计算其同义密码子使用度。在此基础上,分析枯草芽孢杆菌核蛋白的同义密码子使用偏性与蛋白质折叠速率的相关性。发现对于不同二级结构的肽链片段,都有部分密码子的使用偏性与其对应的肽链折叠速率显著相关。进一步分析发现,与肽链片段折叠速率显著相关的密码子绝大部分为枯草杆菌全序列或核蛋白序列的每一组同义密码子中使用度最高的密码子。结果表明,在蛋白质的折叠过程中,枯草芽孢杆菌的同义密码子使用偏性起着重要作用。; 于志芬李瑞芳黄俏; 关键词：枯草芽孢杆菌同义密码子

弗朗西斯·克里克的科学人生被引量：2: 2012年; DNA双螺旋结构的发现者之一弗朗西斯.克里克因其伟大的科学成就和广泛的研究领域被后人赋予众多头衔——物理学家[1]、生物学家[2]和分子生物学之父[3]等。＂伟人研究＂是科学史研究的中心领域之一,克里克作为20世纪极具影响力的科学家之一,对其科研人生的全面梳理和研究工作还有待于进一步推进。; 孙咏萍; 关键词：克里克 DNA双螺旋结构分子生物学物理学家生物学家发现者

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内蒙古自治区自然科学基金(2012MS0115)