国家科技支撑计划(2012BAK11B00)
- 作品数：6 被引量：11H指数：2
- 相关作者：王文斌孙涛岳志芹方义亮徐保海更多>>
- 相关机构：山西农业大学山东出入境检验检疫局福建省疾病预防控制中心更多>>
- 发文基金：国家科技支撑计划国家质检总局科技计划项目福建出入境检验检疫局科技计划项目更多>>
- 相关领域：农业科学医药卫生自动化与计算机技术更多>>
- 一株H1N1亚型猪流感病毒全基因克隆及遗传特性分析被引量：2
- 2015年
- 为快速获知流感病毒的全基因组序列,及时得知其遗传演化特性。设计11对通用条形码引物,采用RT-PCR法扩增A／swine／Shandong／01／2009（H1N1）株的8个基因节段,进行克隆测序和遗传进化分析。核酸序列测定结果显示,全基因组序列完整无缺失,但是基因组内2个位点突变导致PB1-F2、NS-1蛋白表达不完整,HA切割位点处氨基酸序列PSIQSR/GLF,无多个连续的碱性氨基酸,符合非致病性切割位点的特征。从绘制的各个片段进化树分析,此毒株与11株近5年在人和猪中流行的H1N1相似度高,HA的同源性达98.1%~99.7%,NA同源性98.6%~99.8%,与2009年暴发的A型H1N1流行株A/California/07/2009（H1N1）8个片段进行比对,核酸同源性高达99.1%~99.6%。
- 孟慧芝孙涛岳志芹王文斌
- 关键词：猪流感病毒H1N1全基因组测序
- 检疫性有害生物DNA条形码检测数据库建设及应用
- 2017年
- 研发具有我国自主知识产权的DNA条形码信息管理系统与分析鉴定系统，建立检疫性有害生物DNA条形码数据库、凭证标本库及数字标本库，构建我国检疫性有害生物DNA条形码鉴定平台。
- 关键词：检疫性有害生物条形码检测数据信息管理系统自主知识产权
- 含有H3N8马流感病毒HA基因噬菌体病毒样颗粒的构建与纯化被引量：2
- 2015年
- 为构建含H3N8马流感(EIV)HA基因的噬菌体病毒样颗粒(VLPs),本研究将编码组氨酸标签序列插入MS2噬菌体编码外壳蛋白的β发夹环结构序列中,构建含有重组组氨酸标签的MS2噬菌体外壳蛋白和表达成熟酶蛋白基因的重组质粒p NH-MS2his。并通过RT-RCR技术扩增H3N8亚型EIV的HA基因,将其克隆于p NH-MS2his中,构建原核重组表达质粒p NH-MS2his-H3,并将其转化于大肠杆菌BL21(DE3)中进行诱导表达。结果表明,表达的重组蛋白能够自主装配形成VLPs,其中含有H3N8亚型EIV的HA基因RNA序列,并且该RNA序列具有良好的稳定性,可以作为RNA病毒检测时的标准品和质控品用于临床及海关样品检测。
- 张晓文姜帆孙明君郑小龙于业峰王群
- 关键词：H3N8亚型马流感病毒
- 马动脉炎病毒进化分析及DNA条形码的确定被引量：1
- 2016年
- 从GenBank数据库下载马动脉炎病毒所有基因组全序列和同属的其他病毒基因组序列,对其进行多重比对,绘制系统进化树,并根据序列比对筛选保守序列作为马动脉炎病毒的DNA条形码。结界发现马动脉炎病毒分为两个分枝,即欧洲型和美洲型,两者同源性在85%以上,而与同属其他病毒同源性低于40%,亲缘关系较远;对马动脉炎病毒基因组序列进行分析,筛选出9条基因序列作为马动脉炎病毒的DNA条形码,可用于马动脉炎病毒的鉴别诊断。
- 郑小龙徐彪王群朱来华孙涛梁成珠岳志芹
- 关键词：马动脉炎病毒系统进化DNA条形码
- 福建对台口岸蚊媒种类及滋生环境调查被引量：5
- 2013年
- 目的掌握福建对台口岸蚊媒种类以及滋生环境,为对台口岸卫生检疫防止蚊传疾病传入传出提供依据。方法采用幼虫调查法、人诱法、牛诱法相结合,幼虫饲养后成蚊鉴定。结果此次调查蚊媒8种滋生环境,经鉴定隶属于2亚科7属24种,并在口岸旧船舱中首次发现有三带喙库蚊滋生。结论福建作为对台的重要口岸,在卫生检疫中建议针对性加强对登革热以及乙脑等相关蚊传疾病监测。
- 方义亮高博王宇平肖武徐保海张建庆王光辉吴荣泉
- 关键词：孳生环境登革热乙脑
- 基于血凝素裂解位点的DNA条形码在A型流感病毒分型中的应用被引量：1
- 2015年
- 为了建立一种快速鉴别AIV的HA亚型的RT-PCR方法,本研究探讨了流感病毒血凝素裂解位点基因作为DNA条形码对A型流感病毒进行亚型鉴定的可行性。通过生物信息学方法对16种A型流感病毒的血凝素基因全长进行比对,在HA裂解位点的两端高度保守区设计一对DNA条形码引物,RT-PCR扩增获得约170bp的核苷酸片段。利用MEGA5.0软件构建N-J系统树并计算亚型间及亚型内平均遗传距离。结果显示,不同A型流感病毒裂解位点氨基酸具有单系性,每一亚型可分别形成各自独立的分支。不同亚型间平均遗传距离为0.277,相同亚型内平均遗传距离0.032。研究表明,利用DNA条形码技术可在A型流感病毒分型方面进行有效的分子分类鉴定。
- 孟慧芝孙涛岳志芹王文斌
- 关键词：DNA条形码亚型鉴定
