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新疆维吾尔自治区自然科学基金(2009211817)
作品数:
1
被引量:4
H指数:1
相关作者:
王慧
林仁勇
吕国栋
王星
王晓东
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传媒
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中华皮肤科杂...
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2011
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基因芯片表达谱筛选Kaposi肉瘤相关基因
被引量:4
2011年
目的筛选Kaposi肉瘤相关基因。方法新疆本地1例经典型Kaposi肉瘤患者,提取病灶组织及正常皮肤组织的总RNA,逆转录成cDNA,采用实时荧光定量PCR(RT—qPCR)的方法检测Kaposi肉瘤相关疱疹病毒(Kaposi sarcoma—associated herpersivirus,KSHV)基因K8.1、K2、ORFSO在组织中的表达来确定所取标本有无交叉污染。随后进行荧光标记制备探针,与含有25100条人类基因的35KcDNA基因表达谱芯片进行杂交,用扫描仪扫描芯片荧光信号图像,并用软件对扫描图像进行数字化处理和分析。结果RT—qPCR检测到KSHV基因在Kaposi肉瘤病灶组织中的存在,而正常皮肤组织中未检测到,说明样本取材无交叉污染。在25100个基因中,共有1313条差异基因,其中756条基因表达上调,557条基因表达下调。差异表达显著的基因涉及细胞凋亡、血管发生、细胞信号传导、蛋白加工和细胞周期调节等,如髓样细胞白血病-1基因(MCI-1)、膜联蛋白基因、丝氨酸蛋白酶抑制剂(SPINK5)基因等。结论MCI—1、SPINK5等基因可能与Kaposi肉瘤的发病有关联。
王慧
吕国栋
王晓东
惠艳
刘辉
林仁勇
王星
关键词:
肉瘤
卡波西
寡核苷酸序列分析
基因表达谱
差异表达基因
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