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国家自然科学基金(30671587)

作品数:6 被引量:28H指数:3
相关作者:张泽沈以红向仲怀孙伟韩民锦更多>>
相关机构:重庆大学西南大学九州大学更多>>
发文基金:国家自然科学基金高等学校学科创新引智计划国家高技术研究发展计划更多>>
相关领域:农业科学生物学天文地球更多>>

文献类型

  • 6篇中文期刊文章

领域

  • 3篇生物学
  • 3篇农业科学
  • 1篇天文地球

主题

  • 5篇家蚕
  • 4篇进化
  • 2篇驯化
  • 2篇野桑蚕
  • 2篇桑蚕
  • 2篇转座
  • 2篇肽基因
  • 2篇抗菌肽
  • 2篇抗菌肽基因
  • 2篇基因
  • 1篇在家
  • 1篇中国野桑蚕
  • 1篇生物学
  • 1篇生物学方法
  • 1篇群体动力
  • 1篇群体动力学
  • 1篇转座元件
  • 1篇转座子
  • 1篇组织表达谱
  • 1篇系统发育

机构

  • 5篇重庆大学
  • 4篇西南大学
  • 1篇九州大学
  • 1篇中华人民共和...

作者

  • 5篇张泽
  • 4篇向仲怀
  • 4篇沈以红
  • 3篇孙伟
  • 2篇韩民锦
  • 1篇于红松
  • 1篇李雪
  • 1篇郭意
  • 1篇张化浩
  • 1篇许红恩
  • 1篇程静

传媒

  • 2篇蚕业科学
  • 1篇昆虫学报
  • 1篇蚕学通讯
  • 1篇Scienc...
  • 1篇中国科学:生...

年份

  • 2篇2012
  • 2篇2011
  • 1篇2009
  • 1篇2008
6 条 记 录,以下是 1-6
排序方式:
转座子显示技术及其在家蚕遗传进化研究中的应用展望被引量:1
2008年
转座子显示技术是研究基因组中转座子遗传进化的有力工具。家蚕基因组测序结果发现,基因组中含有大量的转座子。本文综述了转座子显示技术和家蚕基因组中转座子特点,展望转座子显示技术在家蚕遗传进化研究中的应用。
韩民锦李雪张泽
关键词:家蚕转座子
蚕系统发生及进化历史分析被引量:4
2012年
古丝绸之路是连接古亚洲和古欧洲的纽带.作为重要媒介,家蚕和丝绸在其中发挥着重要作用.家蚕是目前唯一一种被完全驯化的昆虫.然而,利用分子数据研究家蚕起源及进化历史的研究还很少,尤其是家蚕及其祖先野桑蚕的分化时间还有待确定.作为重要的驯化物种,家蚕的群体动力学变化历程也鲜有报道.本研究利用线粒体和核基因DNA序列推断了家蚕及其近缘物种的系统发生关系和进化历史.所有系统发生分析结果表明,家蚕和中国野桑蚕具有更近的亲缘关系.家蚕的驯化时间大约为4100年.中国野桑蚕大约在23600年前与日本野桑蚕分开,这个时间与化石证据和历史记载一致.另外,研究结果表明,家蚕在大约1000年前经历了群体扩张.本文对蚕的分化时间及蚕群体动力学进行研究,不仅有利于驯化动物的遗传分析和鳞翅目昆虫的系统发生分析,而且有利于理解人类文明的传播.
孙伟于红松沈以红Banno Yutaka向仲怀张泽
关键词:家蚕驯化群体动力学
Phylogeny and evolutionary history of the silkworm被引量:6
2012年
The silkworm,Bombyx mori,played an important role in the old Silk Road that connected ancient Asia and Europe.However,to date,there have been few studies of the origins and domestication of this species using molecular methods.In this study,DNA sequences of mitochondrial and nuclear loci were used to infer the phylogeny and evolutionary history of the domesticated silkworm and its relatives.All of the phylogenetic analyses indicated a close relationship between the domesticated silkworm and the Chinese wild silkworm.Domestication was estimated to have occurred about 4100 years ago(ya),and the radiation of the different geographic strains of B.mori about 2000 ya.The Chinese wild silkworm and the Japanese wild silkworm split about 23600 ya.These estimates are in good agreement with the fossil evidence and historical records.In addition,we show that the domesticated silkworm experienced a population expansion around 1000 ya.The divergence times and the population dynamics of silkworms presented in this study will be useful for studies of lepidopteran phylogenetics,in the genetic analysis of domestic animals,and for understanding the spread of human civilizations.
SUN WeiYU HongSongSHEN YiHongBANNO YutakaXIANG ZhongHuaiZHANG Ze
关键词:进化史分子生物学方法中国野桑蚕DNA序列昆虫系统学
家蚕抗菌肽基因研究进展被引量:17
2009年
抗菌肽是昆虫先天性免疫系统中十分重要的效应因子,近年来一直是昆虫免疫学研究的热点。家蚕作为鳞翅目昆虫的代表,其抗菌肽研究取得了长足进展。根据已经研究获得的抗菌肽基因序列在家蚕基因组中进行同源搜寻,共获得了40个家蚕抗菌肽基因。这些基因编码的多肽在大小、氨基酸组成和性质上差异很大,但基于结构性质可以分成3类:(1)具有α-螺旋结构并且缺乏半胱氨酸(cysteine,Cys)的线性抗菌肽;(2)富含脯氨酸或甘氨酸的组成性抗菌肽;(3)富含半胱氨酸的环形抗菌肽。以这3类结构作为主线,综述了家蚕抗菌肽近年来的研究进展。
孙伟沈以红向仲怀张泽
关键词:家蚕抗菌肽基因
驯化影响下的家蚕3种抗菌肽基因的进化模式
2011年
抗菌肽作为昆虫的先天性免疫效应因子在昆虫物种进化过程中起着至关重要的作用。测定了家蚕(Bombyx mori)和野桑蚕(Bombyxmandarina)群体的3种不同类型的抗菌肽基因DefA、CecE和MorB3的序列,通过序列核苷酸多态性分析、中性检验、溯祖模拟分析和连锁不平衡分析,发现这3种抗菌肽基因呈现不同的进化模式:DefA属于驯化过程中人工选择的靶基因;CecE是经历了驯化瓶颈效应的中性基因;MorB3的进化受遗传漂变影响。尽管进化模式不同,但家蚕的3种抗菌肽基因连锁不平衡程度均高于野桑蚕,反映家蚕经历了瓶颈效应,群体数量减小导致基因重组率降低。这些结果为理解家蚕不同抗菌肽的进化和功能提供了重要信息。
郭意孙伟程静沈以红张泽向仲怀
关键词:家蚕野桑蚕抗菌肽进化模式
家蚕LTR逆转录转座子的鉴定、分类及系统发育分析
2011年
转座子是真核生物基因组的重要组成成分。为了研究家蚕Bombyx mori长末端重复序列(long terminal repeat,LTR)逆转录转座子的分类及进化,本研究采用denovo预测和同源性搜索相结合的方法,在家蚕基因组中共鉴定出了38个LTR逆转录转座子家族,序列长度占整个基因组的0.64%,远小于先前预测的11.8%,其中有6个家族为本研究的新发现。38个家族中,26个家族有表达序列标签(expression sequencetag,EST)证据,表明这些家族具有潜在的活性。对有EST证据的6个家族和没有EST证据的5个家族用RT-PCR进行了组织表达谱实验,结果表明这11个家族在一些组织中有表达,这进一步证实了这些家族具有转录活性,基于此我们推测家蚕中大部分的LTR逆转录转座子家族很可能具有潜在活性。对转座子的插入时间进行估计,结果表明绝大部分元件都是最近1百万年内插入到家蚕基因组中的。我们还比较了黑腹果蝇Drosophila melanogaster、冈比亚按蚊Anopheles gambiae和家蚕B.mori中Ty3/Gypsy超家族分支的差异,结果表明不同枝在不同昆虫中有着不同的扩张。家蚕中LTR逆转录转座子的鉴定和系统分析有助于我们理解逆转录转座子在昆虫进化中的作用。
许红恩韩民锦张化浩沈以红向仲怀张泽
关键词:家蚕基因组转座元件系统发育分析组织表达谱
共1页<1>
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