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基因芯片技术在肾移植组织配型中的应用被引量：1: 2005年; 目的比较基因芯片和特异性聚合酶链反应(PCRSSP)两种HLADR分型方法,探讨适用于肾移植供、受者分型的新方法。方法对60份肾移植供、受者的DNA样本同时采用基因芯片和PCRSSP进行HLADR分型,并进行分析比较。结果60例样本的两种分型方法结果完全一致56份,相同率达93%。结果不相同的样本共4份,经第三方验证,其中基因芯片分型漏1个位点2例、1个位点误判1例,PCRSSP分型漏1个位点1例。其中20份样本作了重复实验,其重复率达到96%。结论基因芯片用于HLA分型具有灵敏度高、效率高、标准化程度高的优点,是其它分型方法所无可比拟的,具有广阔的应用前景。; 王庆华谭建明王英曾章新林忠清; 关键词：基因肾移植 HLA-DR抗原聚合酶链反应基因芯片技术特异性聚合酶链反应分型方法

福建汉族人群HLA-DRB1等位基因多态性研究被引量：3: 2006年; 目的调查福建汉族人群HLA-DRB1等位基因的多态性。方法应用寡核苷酸基因芯片分型技术对福建地区620名汉族人群进行HLA-DRB1位点的基因分型。结果在HLA-DRB1位点共检出了14种等位基因,基因频率较高的依次为DRB1*09、12、15、04、08。结论福建汉族HLA-DRB1等位基因多态性与南方汉族人群相近,但也有其独特的特点。; 王庆华陈威震谭建明; 关键词：人类白细胞抗原遗传多态性基因分型

肾移植受者的细胞因子及其受体单核苷酸多态性与术后感染的相关性: 2005年; 目的探讨肾移植受者的某些细胞因子及其受体基因多态性与术后感染的相关性。方法采用自行研制的细胞因子及其受体单核苷酸多态性检测芯片,分析129例肾移植受者的肿瘤坏死因子(TNF-α)、白细胞介素10(IL-10)、转化生长因子(TGF-β1)、IL-4、IL-6及其受体的21个位点的基因多态性分布情况,并按照患者术后是否发生感染进行分组比较。结果5种细胞因子及其受体单核苷酸多态性在感染组和非感染组中分布明显不同,分别是基因型IL-6R(-183GG、G/A)、IL-10(-824C/T,-597C/A)及TNF-α(-308GG、G/A);等位基因为IL-10R1(1112G/A)、IL-6R(-183G/A)、IL-4R(1902A/G)、TNF-α(-308G/A)及TGF-β1(+869T/C)。结论基因型IL-6R(-183GG)、IL-10(-824C/T,-597C/A)及TNF-α(-308GG),等位基因IL-4R(1902A)、IL-6R(-183G)、IL-10R1(1112G)、TNF-α(-308G)及TGF-β1(+869C)是肾移植后感染的易患因素;而基因型IL-6R(-183G/A)和TNF-α(-308G/A)可能为移植后感染的非易患因素。; 郭义峰谭建明李荣宇刘三震李瑶应康谢毅毛裕民; 关键词：肾移植细胞活素类单核苷酸多态性肾移植受者术后感染细胞因子

供、受者细胞因子及其受体单核苷酸多态性对肾移植近期急性排斥反应的影响: 2005年; 目的研究肾移植供受者的细胞因子和细胞因子受体单核苷酸多态性对术后早期移植物急性排斥反应的影响.方法 (1)根据有无急性排斥发生,129例肾移植受者分成急性排斥组和无排斥组(6个月内),根据HLA-A-B-DR错配、神经钙蛋白抑制剂、肾功能延迟恢复、ATG或MAb诱导治疗、冷缺血时间等情况,对两组患者进行比较,并比较两组5种细胞因子及5种受体的21个位点的基因型分布情况.(2)根据HLA-DR配型情况分成0～1个HLA DR位点错配组(0～1MM)、HLA-DR完全错配组(2MM),比较两组基因多态性的分布情况.结果 (1)129例肾移植受者中,39例(30.2%)发生急性排斥反应.(2)急性排斥组HLA-DR错配数和无排斥组中差异有统计学意义(P<0.05).(3)细胞因子和细胞因子受体位点的多态性在急性排斥组和无排斥组中的分布有明显不同,差异有统计学意义.(4)HLA-DR完全错配组(2MM组)和0～1个位点错配组(0～1MM组)进行比较,两者多态性分布亦有不同.结论肾移植供受者不同基因多态性对预测排斥的发生有指导意义.; 郭义峰谭建明李荣宇刘三震李瑶应康谢毅毛裕民; 关键词：肾移植移植物排斥寡核苷酸探针

寡核苷酸芯片在细胞因子及其受体单核苷酸多态性检测中的应用被引量：1: 2005年; 目的建立检测细胞因子肿瘤坏死因子(TNF)α、白细胞介素(IL)10、转化生长因子(TGF)β1、IL4、IL6及其受体单核苷酸多态性位点的寡核苷酸芯片,通过测序等方法评价其性能。方法根据相关文献、参照NCBI的SNP数据库和NCI的SNP500Cancer数据库,选取临床上有意义的细胞因子及其相应受体单核苷酸多态性位点基因和相应序列,设计寡核苷酸探针59条,基因组DNA通过多重多聚酶链反应(PCR)扩增,Cy5标记。标记后的产物与芯片上探针杂交,激光扫描,荧光信号值分析,判断各位点的基因型,并通过测序验证。结果130份外周血样,除10份因时间过久,没有PCR产物外,余120份均检测成功,3次重复检验无差异,测序验证无位点错误。结论寡核苷酸芯片技术检测细胞因子及其受体单核苷酸多态性位点,具有特异性高、敏感性高、重复性好、高通量、操作简便等优点,是一种较为理想的方法。; 郭义峰谭建明李荣宇刘三震李瑶应康谢毅毛裕民; 关键词：寡核苷酸芯片细胞因子受体 (TNF)-Α PCR产物 NCBI 探针杂交

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上海市科委重大科技攻关项目(024919005)