国家质检总局科技计划项目(2007IK242)
- 作品数：1 被引量：25H指数：1
- 相关作者：顾海丰曾晓茂刘伟陈世界范京安更多>>
- 相关机构：四川出入境检验检疫局中国科学院成都生物研究所中国科学院成都计算机应用研究所更多>>
- 发文基金：国家质检总局科技计划项目国家自然科学基金国家重点基础研究发展计划更多>>
- 相关领域：农业科学更多>>
- DNA条形码识别 Ⅵ：基于微型DNA条形码的果实蝇物种鉴定被引量：25
- 2009年
- 选用双翅目实蝇科12属36种55个样本为材料,将其DNA条形码(mtDNACOI基因648bp)与微型DNA条形码(mtDNACOI基因50～200bp)数据进行比较分析,探讨微型DNA条形码对果实蝇物种鉴定的可行性.采用虚拟实验(Silico analysis),将BOLD数据库中49个样本的序列分别拆成648bp、160bp、50bp三个片段,通过构建NJ树,并进行遗传距离分析,得出每个片段鉴定物种的准确性依次为100%、94%、84%.同时做了实体实验(Empirical test),得到了果实蝇属6个物种的COI序列,将其与虚拟实验中的49个样本序列合并,以DNA-barcode指定序列5’端160bp序列为分析基础,通过遗传距离分析,得出其鉴定物种的准确性为94%,验证了虚拟实验结果.即微型DNA条形码(Minimalistbarcode)鉴定果实蝇物种的准确性与DNA条形码基本一致,均可作为果实蝇物种鉴定的有效依据.
- 范京安顾海丰陈世界莫帮辉温演庆何万兴刘伟曾晓茂
- 关键词：实蝇科COI基因DNA条形码物种鉴定
