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肝炎进展为肝癌的代谢组学研究: 肝癌是一种最普遍的原发性肝恶性肿瘤,居世界癌症死亡率的第三位[1]。有报道认为肝硬化和病毒性肝炎感染与肝癌的发生密切相关[2]。我国是病毒性肝炎感染和肝癌的高发区,因此,对肝炎转化为肝癌的发病的分子机制进行研究,发现生物...; 刘娟石小枫孙立业孙博李爱玲颜贤忠

全基因组拷贝数变异的检测技术及算法: 2012年; 拷贝数变异（copynumbervariation，CNV）是基因组结构变异的一种形式。CNV能够通过改变基因剂量或染色体构象来影响基因表达，进而影响疾病的发生和发展。基因芯片技术与深度测序技术是进行全基因组CNV检测的技术手段。文章综述了各种用于全基因组CNV检测的技术平台以及相应的算法。; 夏夏王瑞周钢桥; 关键词：拷贝数变异高通量基因芯片技术复杂疾病

人源microRNA前体的全基因组预测: 2011年; microRNA(miRNA)是一类不编码蛋白的调控小分子RNA,在真核生物中发挥着广泛而重要的调控功能.由于miRNA的表达具有时空特异性,因而通过计算方法预测miRNA而后有针对性的实验验证是miRNA发现的一条重要途径.降低假阳性率是miRNA预测方法面临的重要挑战.本研究采用集成学习方法构建预测miRNA前体的分类器SVMbagging,对训练集、测试集和独立测试集的结果表明,本研究的方法性能稳健、假阳性率低,具有很好的泛化能力,尤其是当阈值取0.9时,特异性高达99.90%,敏感性在26%以上,适合于全基因组预测.采用SVMbagging在人全基因组中预测miRNA前体,当取阈值0.9时,得到14933个可能的miRNA前体.通过与高通量小RNA测序数据的比较,发现其中4481个miRNA前体具有完全匹配的小RNA序列,与理论估计的真阳性数值非常接近.最后,对32个可能的miRNA进行实验验证,确定其中2条为真实的miRNA.; 应晓敏朱娟娟王小磊赵东升付汉江郑晓飞李伍举; 关键词：MIRNA

新型肝损伤血清标志物Pep5定量检测方法的建立及临床应用被引量：1: 2013年; 目的建立定量检测血清多肽Pep5的酶联免疫吸附方法(ELISA),用于判定肝损伤进程的研究。方法以待测血清样本稀释液包被酶联板,5%脱脂奶粉封闭,辣根过氧化物酶标记的抗Pep5单克隆抗体作为标记抗体,建立定量检测人血清多肽Pep5的ELISA,并用于临床检测690例肝损伤及健康血清样本。结果灵敏度为1.25ng/mL;线性范围(0～24ng/mL)内相关系数为0.998 7;与乙酰胆碱酯酶、层黏连蛋白、透明质酸、三型前胶原交叉反应率小于1.00%;添加回收率在99.09%～107.08%;批内、批间变异系数(CV)分别为5.62%～7.32%、6.21%～6.45%。与其他肝损伤指标乙酰胆碱酯酶试剂盒进行对比试验,表明两种检测方法有一定的相关性(r=0.68)。临床检测结果表明血清多肽Pep5水平随着肝损伤程度加重而升高,与正常血清差异有统计学意义(P<0.01)。结论多肽Pep5可用于肝损伤进程定量血清学检测,检测方法简便、可靠,为后续深入研究多肽Pep5的功能及相关诊断试剂盒的研制和开发提供了科学依据。; 傅海媛侯利平周晓明黄亚娟宋纯艳孙云波汪洋杨保安肖汉族甄蓓魏开华王海滨; 关键词：酶联免疫吸附法肝损伤血清学诊断

多肽抗体免疫富集-质谱法检测肝癌患者血清多肽标志物被引量：12: 2011年; 血清多肽是癌症诊断信息的重要来源。近年来针对其复杂多样、丰度低、易降解的特点,多种多肽组技术得到快速发展。建立并优化了检测多肽标志物的免疫质谱方法,用于检测血清中的肿瘤多肽标志物。方法的线性范围为1～40pmol;检出限为0.5pmol;对5pmol合成肽5标准品平行检测3次的相对标准偏差(RSD)为9.5%。采用本方法检测出浓度为35.2nmol/L的血清多肽标志物。本方法适用于临床样本中低浓度标志物的检测研究,对于癌症的早期诊断具有重要意义。; 原剑孙云波周晓明杨帆杨保安郑俊杰甄蓓貌盼勇李楠白洁林利忠徐淑芳肖汉族魏开华; 关键词：多肽抗体质谱肿瘤

胰岛素样生长因子系统与肝癌被引量：3: 2011年; 肝癌是最常见的人类恶性肿瘤之一.肝癌的发生是一个多因素交互作用逐级发生的过程.包括乙肝、丙肝病毒感染、酗酒、肝硬化等都可能导致肝癌.研究表明,胰岛素样生长因子(IGF)系统由IGF1、IGF2及其受体(IGF1R、IGF2R)和胰岛素样生长因子结合蛋白(IGFBP)组成,在正常以及恶性肝细胞的增殖、分化和转移过程中起重要作用.本综述回顾近年来胰岛素样生长因子系统与肝癌发生发展的机理研究,及其在肝癌治疗中可能的临床应用前景的研究进展,并对目前该研究领域存在的主要问题和未来的研究展望提出了看法.; 蔡觅贺福初周钢桥; 关键词：胰岛素样生长因子系统肝癌

循环microRNA与肿瘤诊断被引量：14: 2009年; miRNA是一类小分子调控RNA,在肿瘤的发生与控制方面发挥着重要的作用.已经发现在肿瘤患者的循环核酸中存在源自肿瘤的miRNA分子,这一现象提示循环miRNA分子可能成为无创诊断癌症的一个有效的方法.本文综述了循环miRNA作为循环生物标志物在肿瘤诊断中的应用,以及该领域的最新研究进展.; 铁轶付汉江郑晓飞; 关键词：肿瘤

多肽抗体检测原发性肝癌血清标志物ELISA方法的建立及应用被引量：4: 2012年; 血清多肽是癌症诊断信息的重要来源,建立、优化了检测多肽标志物的直接ELISA法,并应用于肝癌血清中的多肽标志物的检测。制备及纯化针对多肽标志物Pep5的单克隆抗体并进行辣根过氧化物酶标记,用其建立检测相应抗原的直接ELISA法。方法线性范围为1.5-20 ng/mL,检测限为1.24 ng/mL;标准品批内及批间CV分别小于3.66%及4.89%,血清样本批内及批间CV分别小于11.69%及18.18%;线性范围内(9、12和15 ng/mL)的回收率分别为98.98%,99.61%和101.58%。应用该方法共检测160例正常血清、104例肝硬化及156例肝癌患者血清,正常组与肝硬化组及肝癌组间差异显著(P<0.001),Pep5诊断肝癌的敏感性和特异性分别为80.8%和96.2%。同时检测94例HCC血清中的AFP和Pep5,AFP检出率为63.8%,Pep5检出率为90.4%,AFP联合Pep5检测时,能将HCC的检出率提高至94.7%。; 周晓明傅海媛黄亚娟侯利平孙云波原剑杨保安郑俊杰甄蓓肖汉族貌盼勇魏开华; 关键词：多肽抗体 ELISA 肝癌

免疫质谱法检测肝癌血清多肽标志物被引量：4: 2012年; 建立免疫亲和富集分离与质谱分析相结合的免疫质谱法用于血清多肽标志物pep5的检测。多克隆抗体与蛋白A琼脂糖颗粒偶联用于捕获pep5,基质辅助激光解析电离飞行时间质谱检测标志物。本方法的线性范围为1～48 nmol/L,检出限0.2 nmol/L;回收率为93.0%～103.1%,相对标准偏差(RSD)为6.4%～11.8%;反复冻融3次pep5,检测结果稳定;检测临床肝癌/正常血清样本灵敏度为78.0%、特异度为90%。该方法方便、快速、准确,适用于临床样本中低浓度标志物的检测研究,对于癌症的早期诊断具有重要意义。; 傅海媛原剑周晓明孙云波黄亚娟侯利平宋纯艳杨保安甄蓓高蓉貌盼勇林利忠徐淑芳肖汉族魏开华; 关键词：多肽抗体质谱

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艾滋病和病毒性肝炎等重大传染病防治专项(2008ZX10002-016)