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国家自然科学基金(60873103)

作品数:10 被引量:20H指数:3
相关作者:林治华王远强张娅丁元任发亮更多>>
相关机构:重庆理工大学第三军医大学温州医学院附属第一医院更多>>
发文基金:国家自然科学基金重庆市自然科学基金重庆市教育委员会科学技术研究项目更多>>
相关领域:医药卫生交通运输工程机械工程自动化与计算机技术更多>>

文献类型

  • 10篇中文期刊文章

领域

  • 8篇医药卫生
  • 1篇化学工程
  • 1篇机械工程
  • 1篇自动化与计算...
  • 1篇交通运输工程

主题

  • 4篇表位
  • 3篇定量构效关系
  • 2篇血管
  • 2篇抑制剂
  • 2篇制剂
  • 2篇人乳
  • 2篇人乳头状瘤
  • 2篇人乳头状瘤病...
  • 2篇乳头
  • 2篇乳头状
  • 2篇乳头状瘤
  • 2篇乳头状瘤病
  • 2篇乳头状瘤病毒
  • 2篇细胞
  • 2篇细胞毒
  • 2篇瘤病毒
  • 2篇酶抑制剂
  • 2篇免疫
  • 2篇抗原
  • 2篇构效

机构

  • 7篇重庆理工大学
  • 3篇第三军医大学
  • 3篇温州医学院附...
  • 2篇重庆工学院
  • 1篇重庆市肿瘤医...
  • 1篇第三军医大学...

作者

  • 9篇林治华
  • 5篇王远强
  • 3篇贾正才
  • 3篇丁元
  • 3篇欧荣英
  • 3篇徐云升
  • 3篇张娅
  • 3篇吴玉章
  • 3篇倪兵
  • 3篇任发亮
  • 2篇李秉煦
  • 2篇舒茂
  • 2篇刘跃辉
  • 2篇韩英子
  • 1篇陈盛珍
  • 1篇张学奇
  • 1篇李代蓉
  • 1篇姜海蓉
  • 1篇彭方毅
  • 1篇罗兴燕

传媒

  • 3篇免疫学杂志
  • 1篇中华微生物学...
  • 1篇中华妇产科杂...
  • 1篇中华皮肤科杂...
  • 1篇重庆医学
  • 1篇计算机与应用...
  • 1篇Chines...
  • 1篇重庆工学院学...

年份

  • 2篇2013
  • 1篇2012
  • 2篇2011
  • 2篇2010
  • 3篇2009
10 条 记 录,以下是 1-10
排序方式:
基于定量构效关系预测血管紧张素转化酶抑制剂活性被引量:1
2009年
应用启发式方法和支持向量机方法建立了114种血管紧张素转化酶抑制剂活性定量构效关系模型,研究了分子结构对抑制剂活性的影响.2种方法均得到了较好的结果,交互检验的相关系数平方分别为0.72和0.82.通过对模型的稳定性和预测能力比较,发现支持向量机建立QSAR模型能够更好地预测血管紧张素转化酶抑制剂活性.
舒茂王远强林勇林治华
关键词:定量构效关系血管紧张素转化酶抑制剂支持向量机
基于氨基酸性质的EB病毒抗原MHC-Ⅰ类分子限制性表位的定量构效关系建模被引量:2
2013年
目的建立EB病毒(EBV)抗原表位的理论计算模型并用于其定量预测,为肿瘤免疫的多肽疫苗设计提供理论基础。方法从表位数据库中收集33条EBV抗原表位,使用逐步回归(STR)方法筛选2个对平衡解离常数(KD)贡献较大的结构参数用于表位的结构表征,最后用多元线性回归(MLR)方法建立结构参数与KD的定量构效关系(QSAR)模型。结果该模型具有较好的稳定性(R2=0.637,Q2=0.581)与预测能力(R2test=0.501)。结论此方法可确定表位中各个氨基酸的物理性质对于平衡解离常数的贡献,为表位设计与改造提供直接线索;STR和MLR相结合建模方法具有物化意义明确、易于解释及操作简便易行等优点。
韩英子王远强胡勇纪永军路亚阔蓝君罗鸿林治华
关键词:EB病毒表位构效关系
Molecular Modeling Studies of Vascular Endothelial Growth Factor Receptor Tyrosine Kinase Inhibitors Combining Molecular Docking and 3D-QSAR Methods被引量:8
2013年
The vascular endothelial growth factor (VEGF) and its receptor tyrosine kinases VEGFR-2 or kinase insertdomain receptor (KDR) have emerged as attractive targets for the design of novel anticancer agents. In the present work, molecular docking method combined with three dimensional quantitative structure-activity relationships (comparative molecular field analysis (CoMFA) and comparative molecular similarity indice analysis (CoMSIA)) to analyze the possible interactions between KDR and those derivatives which acted as selective inhibitors. The CoMFA and CoMSIA models gave a cross-validated coefficient Q2 of 0.713 and 0.549, non-cross-validated R2 values of 0.974 and 0.878, and predicted R2 values of 0.966 and 0.823, respectively. The 3D contour maps generated by the CoMFA and CoMSIA models were used to identify the key structural requirements responsible for the biological activity. The information obtained from 3D-QSAR and docking studies were very helpful to design novel selective inhibitors of KDR with desired activity and good chemical property.
路亚阔王娟胡勇林勇林治华
关键词:血管内皮生长因子受体酪氨酸激酶抑制剂3D-QSAR三维定量构效关系选择性抑制剂
HPV16E711-20-HSP110复合物的构建及其免疫原性研究被引量:1
2010年
宫颈癌是一种危害妇女健康的常见恶性肿瘤,发病率仅次于乳腺癌,其发生发展主要与高危型人乳头状瘤病毒(human papillomavirus,HPV)16和18型感染密切相关。因此,针对HPV研究、开发宫颈癌治疗性疫苗具有重要的临床意义。目前对于细胞毒T淋巴细胞(cytotoxic T lymphocyte,CTL)表位的多肽疫苗的研究日益深入。
丁珍珍徐云升欧荣英蔡剑峰任发亮倪兵贾正才林治华吴玉章
关键词:高危型人乳头状瘤病毒LYMPHOCYTE复合物细胞毒T淋巴细胞治疗性疫苗妇女健康
HPV16 CTL表位E749-57以HSP110为分子伴侣的免疫原性研究被引量:1
2010年
目的 探讨以mHSP110为分子伴侣的HPV16 CTL表位E749-57的免疫原性.方法 将mHSP110基因克隆、原核表达和纯化,SDS-PAGE和Western blot鉴定.在热休克状态与E749-57结合形成复合物,高压液相色谱(HPLC)鉴定其结合程度.用mHSP1 10-E749-57复合物免疫小鼠,IFN-γ胞内染色、MTT法检测小鼠脾细胞中特异CTL.结果 克隆mHSP110片段经DNA序列测定与基因库中其CDS一致,长度为2577 bp 经SDS-PAGE和Western印迹证实mHSP110表达、纯化成功,HPLC分析E749-57能够与mHSP110形成复合物.复合物免疫小鼠的脾淋巴细胞中CD8+IFN-γ+T细胞的频率、脾淋巴细胞增殖活性明显高于E749-57组、HSP110组和PBS组.复合物免疫小鼠可明显抑制TC-1肿瘤的生长.结论 mHSP110-E749-57复合物能诱导产生特异性CTL并产生抗肿瘤效应.
任发亮徐云升欧荣英倪兵贾正才吴玉章林治华李秉煦郝飞
关键词:人乳头状瘤病毒16表位
原位杂交检测HPV-16E6,-18E6在喉癌组织中的表达被引量:4
2009年
目的检测HPV L1和16/18DNA在喉癌组织中的表达,探讨HPV在喉癌发生中的作用。方法用原位杂交(ISH)检测123例喉癌组织及123例"正常人"的喉粘膜上皮组织中HPV-16/18 mRNA。结果在123例喉癌标本中,ISH检出HPV-16E6的阳性率为46.34%,HPV-18E6的阳性率为35.77%。123例"正常人"的喉粘膜ISH结果表明:低危型HPV的阳性率与喉癌相近;高危型HPV的阳性率虽远远低于喉癌,但随着组织病变程度加重阳性率逐渐升高。对上述结果用SPSS 10.0软件进行case-controlχ2分析,HPV-16感染会增加喉上皮病变的风险(OR=14.58),感染HPV-18时,喉上皮病变的风险(OR=10.77)。结论HPV-16感染是重庆地区喉癌的重要发病因素;HPV-16感染后E6片段的保留并持续表达与喉组织的癌变进程密切相关;HPV-16感染会增强喉上皮病变的风险,而HPV-18有协同作用。
姜海蓉彭方毅陈远翔陈盛珍林治华彭方亮赵卫兵李代蓉
关键词:原位杂交喉癌
APL提高H2-D^b限制性天然CTL表位HPV-16E749-57免疫效应
2009年
HPV-16E749-57是H2-D^b限制性免疫显性CTL表位,是治疗HPV-16相关病变的理想靶标,研制HPV-16多肽疫苗可以参考表位为基础。但天然表位HPV-16E749-57,的肿瘤免疫效果并不理想。对表位进行氨基酸置换修饰,筛选出免疫原性强的修饰多肽配体(APL),对构建HPV-16多肽疫苗有重要的意义。
徐云升吴玉章任发亮倪兵贾正才欧荣英林治华张学奇李秉煦
关键词:CTL表位免疫效应APLHPV-16多肽疫苗相关病变
梨形四膜虫细胞毒性苯酚类似物的三维定量结构毒性相关研究
2012年
目的使用比较分子相似性指数分析(CoMSIA)方法对梨形四膜虫细胞毒性苯酚类似物进行三维定量结构毒性相关(3D-QSTR)研究。方法系统分析了立体场、静电场、疏水场对三维结构毒性模型的影响,并建立相应的3D-QSTR预测模型。结果使用静电场与疏水场协同作用建立了具有良好可靠性和预测能力的3D-QSTR模型(Q2=0.767,r2=0.933)。结论模型具有良好的预测能力,对苯酚类似物的结构修饰具有指导作用。
王远强刘跃辉丁元张娅林治华
应用QSAR预测人双载蛋白Ⅰ型SH3结构域及其配体多肽的亲和力
2011年
蛋白质间的相互作用在信号转导和其他许多生物进程有着至关重要的作用。从20种天然氨基酸的554个物化性质中,单变量建模方法挑选出疏水、静电、立体、氢键4个描述子表征能与人类双载蛋白SH3结构域结合的多肽,预测SH3结构域-肽亲和力。所得描述子并未对变量进行主成分分析(PCA)压缩,且只对氨基酸侧链性质进行结构表征,因此应用这4个描述子并结合多元线性回归(MLR)建模方法对SH3结构域,肽体系进行定量构效关系(QSAR)研究分析域,肽亲和力。测试集的多肽用于模型的验证,内部验证复相关系数(R^2)和外部留一法交互验证相关系数(Q^2)分别为:0.682,0.650,预测均方根误差(RMSE)为0.528,从模型统计数据可知,QSAR模型预测模型稳定性高,预测能力强。说明这4个描述子物具有更为确切的物化意义,表征过程更加简洁有效且研究效率高的多重优点,并可以拓展预测不同的域,肽体系。
丁元王远强舒茂张娅林治华
关键词:多肽定量构效关系多元线性回归
基于氨基酸结构信息的MHCⅠ类抗原表位的定量构效关系建模被引量:3
2011年
目的主要组织相容复合物(MHC)在细胞免疫中具有重要作用,MHC与表位亲和力的大小直接影响T细胞免疫响应的强弱,因此准确预测MHC-表位的结合亲和力可以提高表位的筛选效率并且降低实验成本。方法筛选89种天然氨基酸的理化性质用于15个MHCⅠ类分子亚型表位的结构表征,然后使用逐步线性回归(STR)方法优选对亲和力具有重要贡献结构参数建立预测模型,最终用多元线形回归法(MLR)方法建立了15个MHC亚型的QSAR模型。结果建立的QSAR模型具有稳定性高、预测能力强等优点,能确定表位中各氨基酸及其相应理化性质队对亲和力的贡献,并可很好解释MHC与表位的相互作用机理。结论 STR-MLR建模方法具有计算简便、易于解释、性能优异、物化意义明确等优势。
王远强丁元徐东海刘跃辉张娅韩英子罗兴燕林治华
关键词:表位定量构效关系
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