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香港保健协会资助项目(20050916-2HK)
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黄冬冬
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博来霉素致C57小鼠肺纤维化分子靶点的探寻
2010年
目的探寻博来霉素(BLM)致C57小鼠肺纤维化分子靶点。方法应用BRB-ArrayTools软件中justR-MA算法分析BLM(实验组)和生理盐水(对照组)作用于C57小鼠1、3、14d后肺组织基因表达谱数据集GSE485,找出差异表达基因;应用DAVID在线工具对这些基因进行功能聚类,结合《京都基因与基因组百科全书》和BioCar-ta进行生物学通路分析;应用MSigDB搜寻[-2kb,2kb]区域富集的转录因子结合位点。结果分别筛选出190、345、527个差异表达基因;按功能显著聚集的有趋化因子、膜蛋白、血清蛋白、补体成分、免疫球蛋白、钙黏蛋白、基质金属蛋白酶、前胶原类;受调控的有Toll样受体、CCR5、ECM受体、补体途径、TGF-β生物学通路;富集度较高的有AP1、SRF、NFKAPPAB转录因子。结论 AP1、SRF和RhoA可能是BLM致C57小鼠肺纤维化的分子靶点。
黄冬冬
王尉平
顾振纶
蒋小岗
周文轩
郭次仪
关键词:
博来霉素
肺纤维化
差异表达基因
转录因子
小鼠
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