国家自然科学基金(30671492)
- 作品数：5 被引量：1H指数：1
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- 相关机构：上海交通大学广西医科大学更多>>
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- 基于基因集富集分析的犬膨大性心肌症关键基因通路筛选
- 2012年
- 犬膨大性心肌症(DCM)是以心室功能受损心房室都显著膨大为显著特征的犬常见疾病。尽管此病的发病率非常高,但该疾病的的遗传机制研究较少。本研究利用基因集富集分析(GSEA)的方法,针对NCBI的GEO数据库中的DCM的表达芯片数据进行分析,共发现与犬膨大性心肌症相关的显著上调的基因通路4个,显著上调的GO集合15个。这些显著的基因集合可作为犬膨大性心肌症相关的候选通路,为进一步进行犬膨大性心肌症的早期诊断,预防和个性化治疗奠定基础。
- 刘春慧王起山潘玉春
- Meta-AS:整合关联分析系统
- ＜正＞引言候选基因法是研究数量性状遗传机制的一个有效途径,因而已经成为动物遗传育种领域的研究热点。然而,目前候选基因法无论是在统计方法方面,还是在其应用方面都存在着大量问题:一是许多研究者对统计分析方法和软件无法熟练和准...
- 王起山胡艳玲赵洪波王明辉潘玉春
- 关键词：单体型数量性状标记辅助选择
- 文献传递
- 单体型关联分析方法研究进展被引量：1
- 2008年
- 基于单体型的分析方法在当前的复杂疾病和数量性状候选基因的研究中扮演越来越重要的角色。本文综述了开展单体型关联分析研究的动机,单体型的生物功能及单体型的统计优势。介绍了单体型关联分析的回归分析模型,应用的局限和需要进一步的研究的领域。
- 王起山潘玉春胡艳玲
- 关键词：单体型
- 基于半参数回归模型的多区域单倍体型与纵向性状关联分析
- 2010年
- 由于影响复杂性状的有些基因组单体型是有时间效应的,因此对复杂性状与基因组单体型的关联分析应该考虑时间效应。Zhang等提出的半参数模型不能直接应用于基因组单体型的分析。本文在Zhang等提出的分析纵向数据的半参数模型基础上,把模型的参数固定效应用来拟合单倍体型和其他固定协变量效应,时间效应通过二次可微函数来拟合,参数的估计按照Zhang等的方法,采用似然比检验来检验单倍体型效应。通过对我们升级的方法与一般的混合模型Haplo.stats和FAMHAP的htr模型进行模拟比较,证实对动态性状通过考虑多次采样数据的时间效应比对单次采样更能提高单倍体型效应的检出率。我们把这种半参数回归模型研究猪具有多胎的繁殖记录与MMP1和MMP10基因的单倍体型分析中。
- 胡艳玲吴潇王起山潘玉春
- 关键词：半参数回归模型单倍体型
- 奶牛能量负平衡的基因集富集分析
- 引言奶牛繁殖力低的最常见原因之一,是能量供给不能满足它的需求或是能量处于负平衡状态(NEB)。长时间营养不良或者急性限饲,容易导致能量负平衡的发生。在泌乳早期,大多数奶牛由于不能摄入足够的能量而总是处于
- 赵洪波王起山潘玉春
- 关键词：奶牛能量负平衡
- 文献传递
