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基于全基因组信息鉴定中国荷斯坦牛产奶性状基因及功能注释被引量：5: 2012年; 前期研究基于中国荷斯坦牛女儿设计资源群体,采用Illumina公司Bovine50K微珠芯片对产奶性状进行了全基因组关联分析(GWAS),利用传递不平衡(L1-TDT)和回归分析(MMRA)2种统计分析方法共同检测到35个显著SNPs位点。本研究旨在基于该GWAS结果进一步对产奶性状基因进行鉴定及功能注释。基于牛基因组序列草图(Btau4.2),采用生物信息学和比较基因组学方法进行显著SNPs位置候选基因筛查和功能预测。分析发现,12个SNPs位点位于基因内部,23个位于基因侧翼,最终鉴定到28个位置候选基因,并确定了其物理位置、基因类型及潜在功能。基因功能可归纳为6种类型:调节机体营养成分代谢和平衡、细胞骨架或基质成分、调节细胞增殖和周期及凋亡、参与细胞信号转导和盐离子通道构成、具有激酶活性、参与mRNA转录调控或翻译调控。该研究为进一步鉴定中国荷斯坦牛产奶性状主效基因及功能验证打下了基础。; 齐超谢岩吴晓平姜力刘剑锋孙东晓张勤张沅; 关键词：中国荷斯坦牛全基因组关联分析产奶性状功能注释

天津地区荷斯坦公牛CVM、DUMPS和CN遗传缺陷检测被引量：1: 2014年; 本文旨在研究天津地区中国荷斯坦公牛脊椎畸形综合征(Complex?vertebral?malformation,CVM)、尿苷酸合酶缺乏症(Deficiency?of?uridine?monophosphate?synthase,DUMPS)和瓜氨酸血症(Citrullinemia,CN)3种遗传缺陷的携带者比率及系谱来源。通过PIRA-PCR和PCR-RFLP方法分别对天津奶牛发展中心参加全国青年公牛联合后裔测定和国家良种补贴项目的110头荷斯坦公牛进行了CVM、DUMPS和CN三种遗传缺陷检测。共发现6头CVM隐性有害基因携带公牛,携带者比例为5.45%,隐性有害等位基因频率为2.72%。经过系谱分析,其中4头CVM携带者均为美国公牛Carlin-M?Ivanhoe?Bell的后代,另外2头因系谱不完整而无法查询。未检测到DUMPS和CN隐性有害基因携带者。基于此,我国有必要尽快建立荷斯坦牛隐性遗传缺陷监控体系并进行系谱标注,避免携带公牛进入后裔测定和良种补贴项目,以逐步降低我国奶牛群体中遗传缺陷隐性等位基因频率。; 梁若冰谢岩范学华张毅孙东晓张胜利马毅吴周良; 关键词：荷斯坦公牛 CVM CN

中国荷斯坦公牛脊椎畸形综合征和尿苷酸合酶缺乏症遗传缺陷检测被引量：6: 2014年; 本研究旨在研究中国荷斯坦公牛脊椎畸形综合征(Complex vertebral malformation,CVM)和尿苷酸合酶缺乏症(Deficiency of uridine monophosphate synthage,DUMPS)两种遗传缺陷的携带者及系谱来源。通过PIRA-PCR和PCR-RFLP方法对参加全国青年公牛联合后裔测定和国家良种补贴项目的、来自全国27个公牛站的691头荷斯坦公牛分别进行了CVM和DUMPS的遗传缺陷检测,共发现34头CVM和1头DUMPS隐性有害基因携带者公牛,携带者比例分别为4.92%和0.14%,隐性有害等位基因频率分别为2.46%和0.07%。经过系谱分析发现,其中28头CVM携带者均为美国公牛Carlin-M Ivanhoe Bell的后代,另外6头因系谱不完整而无法查询1头DUMPS携带者为美国公牛Skokie Sensation Ned后代因此,我国有必要尽快建立荷斯坦牛隐性遗传缺陷监控体系并进行系谱标注,通过青年公牛预选和选种选配,避免携带者公牛进入后裔测定和良种补贴项目,以逐步降低我国奶牛群体中隐性有害等位基因频率,为提高奶牛群体质量提供依据。; 梁若冰谢岩范学华张毅孙东晓张胜利; 关键词：CVM

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天津市农业科技成果转化与推广项目(201104090-02)