国家科技重大专项(2013ZX10004221)
- 作品数：5 被引量：44H指数：4
- 相关作者：徐征高源徐丽朱兵清邵祝军更多>>
- 相关机构：中国疾病预防控制中心传染病预防控制所传染病预防控制国家重点实验室温州医科大学更多>>
- 发文基金：国家科技重大专项国家重点基础研究发展计划国家高技术研究发展计划更多>>
- 相关领域：医药卫生更多>>
- 16S rDNA序列在诺卡菌菌种鉴定中的价值研究被引量：21
- 2015年
- 目的 评价16SrDNA序列在诺卡菌菌种鉴定中的应用价值。方法 对13种49株诺卡菌（43株标准株和6株临床株）16SrDNA序列片段进行PCR扩增,将扩增片段进行纯化后测序,从GenBank上下载32株诺卡菌（包括星形诺卡菌,少食诺卡菌,短链诺卡菌等）及3株棒状杆菌（Corynebacterium,C.）,3株弗兰克氏菌属（Frankia,F.）,3株分支杆菌（Mycobacterium,M.）,3株链霉菌（Streptomyces,S.）的16SrDNA序列。对所测得的诺卡菌序列及GenBank所报道的诺卡菌序列用DNASTAR程序分析处理,计算种内及种间相似性,用Mega6.06构建诺卡菌菌种系统进化树。结果 在81条受试诺卡菌16SrDNA序列中,16SrDNA能将诺卡菌大致可分为11群,除了不能将亚种分离外,诺卡菌其他种属均能得到很好的分离。诺卡菌16SrDNA种内及亚种内相似性为99.1%~100%;种间相似性在95.7%~98.8%之间。结论 16SrDNA序列分析是一种快速,简单,特异性较好的诺卡菌菌种鉴定方法,能将诺卡菌鉴定至种的水平。
- 李路茜张媛媛刘海灿谭晓罗李振军楼永良
- 关键词：诺卡菌RDNA序列
- 2003—2012年中国部分地区脑膜炎奈瑟菌体外抗生素敏感性分析被引量：12
- 2015年
- 目的了解我国脑膜炎奈瑟菌对抗生素敏感性的变化趋势。方法对2003—2012年本研究室收集的脑膜炎奈瑟菌菌株,根据分离年份、血清群和来源(患者或健康携带者)选择487株,采用微量肉汤稀释法和E-test浓度梯度扩散法,对其进行体外12种抗生素敏感性检测和分析。结果所有菌株对头孢噻肟、头孢曲松、阿奇霉素、美洛培南、氯霉素和米诺环素均敏感;对青霉素和氨苄西林不敏感的菌株分别是4.9%(24/487)和3.5%(17/487),75.6%(368/487)的菌株对萘啶酸耐药,87.1%(424/487)对复方新诺明耐药,48.9%(238/487)对环丙沙星耐药。从2005年开始出现对环丙沙星耐药的菌株23.8%(24/101),从2006年开始出现对青霉素类药物不敏感菌株2.4%(2/82)。患者和健康携带者来源的菌株对萘啶酸、复方新诺明和环丙沙星3种药物显现不同的耐药率。结论我国流脑菌株对磺胺类和喹诺酮类药物具有较高的耐药性,对青霉素类药物不敏感的菌株也逐渐增多。这种耐药性与菌株分离年份、血清群和菌株来源具有相关性。
- 徐丽朱兵清徐征高源邵祝军
- 关键词：脑膜炎奈瑟菌药敏E-TEST
- 中国不可分群脑膜炎奈瑟菌的分子分型分析被引量：9
- 2014年
- 目的了解我国血清不可分群(non-serogroupable,NG)脑膜炎奈瑟菌分子分型特征。方法选取我国2005-2011年分离的104株血清不可分群脑膜炎奈瑟菌作为研究对象,采用多位点序列分型(MLST)和聚合酶链反应(PCR)基因分群(A、B、C、W、E、X、Y、Z、H、I、L、K、cnl)方法,检测其ST序列群及基因群。结果 104株不可分群脑膜炎奈瑟菌中,基因群分布为荚膜基因缺失菌株(capsule null locus,cnl)(36株)、B群(20株)、C群(14株)、W群(9株)、E群(9株)、X群(3株)和Y群(3株),余下10株未鉴定出基因群;未发现其他基因群菌株。MLST分型将104株NG菌株分为45种ST型,其中14种为新的ST型;17种ST型可归为7个序列群(65株);cnl菌株全属于ST-198序列群,B群和C群菌株以ST-4821为优势序列群,W群以ST-11和ST-174序列群为主。结论我国NG脑膜炎奈瑟菌具有基因多态性,其中ST-198序列群全部为cnl菌株。
- 徐征朱兵清高源徐丽邵祝军
- 关键词：脑膜炎奈瑟菌多位点序列分型
- 中美艰难梭菌A-B+株毒力编码区域转录及B毒素表达的研究被引量：4
- 2014年
- 目的研究中国艰难梭菌A-B+型分离株BJ08和美国艰难梭菌A-B+型暴发流行株US1的毒力编码区域PaLoc各基因转录及B毒素的表达,为预防和控制中国可能暴发的艰难梭菌感染提供理论支持。方法每隔3 h提取BJ08与US1艰难梭菌和培养上清,用荧光定量聚合酶链反应(PCR)法测定各时间段两菌株毒力编码区域PaLoc各基因(tcdA、tcdB、tcdC、tcdR、tcdE)的表达;用酶联免疫吸附试验(ELISA)法检测BJ08和US1各时间段的细胞和培养液上清中B毒素的含量。结果 US1的生长速率稍快于BJ08,衰退速率显著快于BJ08(P<0.05);它们都不表达A毒素,但是都检测到tcdA基因的转录,而且tcdA转录没有明显差异。BJ08的tcdB、tcdC和tcdE基因的转录要比US1早3 h。B毒素在两种菌株的胞内和胞外合成或分泌没有明显差异。结论中国艰难梭菌A-B+型高分离株BJ08与美国艰难梭菌A-B+型暴发流行株US1相比,有相似的毒力表达或更强的基因调控能力,要警惕中国艰难梭菌BJ08暴发流行的可能。
- 李先平李文革王晶卢金星
- 关键词：艰难梭菌抗生素相关腹泻假膜性肠炎
- 副溶血弧菌RIMD2210633与霍乱弧菌N16961中超级整合子结构差异分析被引量：1
- 2013年
- 目的确定副溶血弧菌(Vibrio parahaemolyticus)RIMD2210633与霍乱弧菌(Vibrio cholerae)N16961菌株中超级整合子结构特点差异。方法 (1)使用Perl脚本搜寻RIMD2210633和N16961中superintegron(SI)中核心序列(core segment,CS)和反向核心序列(inverted core segment,ICS);(2)配对核心序列和反向核心序列,获得副溶血弧菌重复序列(V.parahaemolyticus repeat,VPR)及霍乱弧菌重复序列(V.cholerae repeat,VCR)基因组位置信息;(3)使用Perl语言脚本获得副溶血弧菌RIMD2210633以及霍乱弧菌N16961的SI中重复序列,并获得基因盒的构成和分布信息;(4)使用全局比对软件Clustal W将上一步获得的所有VPR和VCR序列进行多序列比对,使用Perl语言脚本处理比对结果以获得一致性序列;(5)使用MEGA 4.0查看多序列比对结果,并使用Perl脚本计算各位置的变异频率,据此结果来分析副溶血RIMD2210633和霍乱弧菌N16961中的弧菌重复序列以及基因盒分布的特点。结果在RIMD2210633的超级整合子鉴定了69个VPR,其核苷酸长度在91～125bp之间。在包含128个核苷酸的一致性序列中,15个为保守核苷酸位点,113个为可变核苷酸位点。在副溶血弧菌的SI中,共确定了64个基因盒,基因盒的长度范围是420～1 709bp,中位数是648bp。在霍乱弧菌N16961的超级整合子中鉴定了158个VCR,长度在117～124bp之间。在包含126个核苷酸的一致性序列中,37个为保守核苷酸位点,89个为可变核苷酸位点。N16961的SI中共存在146个基因盒,基因盒的长度范围是390～5924bp,中位数是1 518bp。结论与霍乱弧菌的VCR相比,副溶血弧菌的VPR可变区序列变异更大,与弧菌重复序列之间序列一致性高的特点不相吻合。
- 卢昕阚飙逄波
- 关键词：副溶血弧菌霍乱弧菌VCRVPR基因盒
