内蒙古自治区自然科学基金(20080404MS0408)
- 作品数:2 被引量:4H指数:1
- 相关作者:关平原郝瑞峰胡文兵赵鹏伟白春艳更多>>
- 相关机构:内蒙古农业大学中华人民共和国农业部内蒙古伊利实业股份有限公司更多>>
- 发文基金:内蒙古自治区自然科学基金更多>>
- 相关领域:农业科学更多>>
- 牛传染性鼻气管炎病毒内蒙古分离株gB、gC、gD基因的分子克隆与序列分析被引量:3
- 2012年
- 对牛传染性鼻气管炎病毒(IBRV)内蒙古分离株gB、gC、gD基因进行克隆和序列测定,结果表明IBRV内蒙古分离株gB、gC、gD基因序列分别为2 850、1 723、1 559bp,编码933、508、417个氨基酸组成的完整开放阅读框。序列比较和系统进化树分析结果显示:内蒙古分离株与其他毒株gB、gC、gD基因核苷酸序列的相似性为94.9%~99.9%,其推导的氨基酸相似性在90.3%~99.7%,不同IBRV毒株gB、gC、gD基因在核苷酸和氨基酸水平上高度保守。在系统进化树中内蒙古分离株与瑞典毒株亲缘关系较近,属于同一个分支。
- 胡文兵关平原郝瑞峰赵鹏伟乌日罕
- 关键词:牛传染性鼻气管炎病毒GB基因GC基因GD基因分子克隆
- IBRV内蒙古分离株NM06 gE基因的克隆与序列分析被引量:1
- 2009年
- 参考GenBank发表的牛疱疹病毒Ⅰ型全基因序列设计gE基因PCR扩增引物,以牛传染性鼻气管炎病毒内蒙古分离株NM06提取的DNA为模板,运用PCR的方法扩增gE基因,扩增产物经克隆、序列测定和拼接,结果表明:测定序列全长为2086bp,包含gE基因1793bp,其中有1728bp组成的完整开放阅读框,编码576个氨基酸。将NM06株gE基因序列与GenBank发表的参考毒株核苷酸序列相比,与4株BHV-1病毒的同源性在99.3%~99.9%;与2株BHV-1.1型分离株同源性高达99.5%、99.6%;与BHV-1.2型分离株同源性为93.4%。从进化树中也可以看出:NM06株与BHV-1.1型分离株属于同一个进化分支,而BHV-1.2BH83株属于另一个进化分支,可以推测IBRVNM06分离株属于BHV-1.1型。NM06株与牛疱疹病毒5型N569病毒的同源性为82.9%,与鹿疱疹病毒2型Norway4病毒的同源性为72.6%。
- 白春艳郭日东关平原乌日罕特木尔巴根马立峰菊花
- 关键词:牛传染性鼻气管炎病毒GE基因克隆