四川省教育厅重点项目(07ZZ02807ZA051)
- 作品数：2 被引量：2H指数：1
- 相关作者：贾仁勇朱德康汪铭书齐雪峰程安春更多>>
- 相关机构：四川农业大学动物疫病与人类健康四川省重点实验室更多>>
- 发文基金：四川省杰出青年科技基金教育部“新世纪优秀人才支持计划”基础研究重大项目前期研究专项更多>>
- 相关领域：农业科学更多>>
- 鸭瘟病毒UL24基因的分子特征分析被引量：1
- 2009年
- 根据本实验室获得的鸭瘟病毒的一段基因序列设计引物，利用PCR扩增UL24基因并克隆到pMD18-T载体，阳性重组质粒进行酶切鉴定、测序验证与生物信息学分析。结果显示，获得的UL24基因全长1230bp，编码409个氨基酸；与其他26株疱疹病毒科中α-疱疹病毒亚科的UL24基因的相似性较β和γ亚科高，其中与α亚科禽疱疹病毒属中的GaHV-3相似性最大（34．7％）；遗传进化树显示，该基因编码的蛋白与火鸡疱疹病毒的UL24蛋白的亲缘性最近。该蛋白是一种保守但不含信号肽的外膜蛋白，具有5个潜在的N-糖基化位点和19个磷酸化位点；编码的氨基酸Ala，Apn，Glu，Phe，Leu，Arg，Thr，Val具有一定的偏嗜性。二级结构分析显示，α螺旋和无规卷曲含量高，均达46．94％，而口折叠仅占6．11％；同源建模比对，未发现与之匹配的三级结构；预测的抗原表位主要位于肽链第36～48、241～323、344～379位区段。
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- 关键词：鸭瘟病毒分子特征生物信息学分析
- 不同条件对鸭瘟病毒感染细胞蛋白质组二维电泳分析结果的影响被引量：1
- 2009年
- 本研究以鸭瘟病毒感染鸭胚成纤维细胞为材料,围绕影响二维电泳因素进行全面探讨,以建立和优化鸭瘟病毒感染细胞蛋白质组二维电泳模型。结果表明,样品经过冷丙酮处理,水化液DTT浓度为30 mmol/L都有利于等电聚焦;采用pH5～8 IPG窄胶条和混合两性载体电解质pH3～10/pH5～8为2/1比pH3～10 IPG宽胶条和单一两性载体电解质pH3～10分离蛋白时,各蛋白点间距较大,分辨率高,更有利于显示低丰度蛋白点;1.5 mg的蛋白上样量偏大,2～DE图像出现拖尾和水平条纹,部分相邻高丰度的蛋白重叠,且还掩盖了低丰度蛋白点。PDQuest7.40软件分析显示:17 cmpH5～8 IPG胶条电泳鸭瘟病毒感染细胞蛋白质组,银染可获得1 253个蛋白点,而考染却检测到388个蛋白点;重复试验仍获得清晰、稳定的2-DE图像,同一样本不同时期,考染可获得约348、331个蛋白点,蛋白点匹配率达88%,表明了鸭瘟病毒感染细胞蛋白质组二维电泳模型稳定、分辨率高、重复性好,为鸭瘟病毒蛋白组的进一步研究和新蛋白的发现提供了重要的研究方法。
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- 关键词：蛋白质组二维电泳鸭瘟病毒成纤维细胞
