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水稻白叶枯病菌双组分调控系统应答调节子基因gacAxoo的功能鉴定: 2010年; 为了阐明水稻白叶枯病菌(Xanthomonas oryzaepv.oryzae,Xoo)双组分系统(TCS)的调控作用,本研究通过基因克隆、序列分析、缺失突变和互补、表型测定,对TCS应答调节子基因gacAxoo的功能进行了鉴定。克隆的gacAxoo基因编码蛋白GacAxoo与其它病原黄单胞菌的同源序列高度保守。GacAxoo是LuxR蛋白家族成员之一,具有磷酸受体结构域(REC)和DNA结合保守结构域(HTH)。用基因标记交换法,构建了△gacAxoo基因缺失突变体。与PXO99A相比,△gac-Axoo的致病性、致敏性、胞外降解酶类活性和嗜铁素产生能力无显著变化,但运动性明显减弱,基因互补可以使之恢复。因此,gacAxoo基因可能参与了Xoo运动性的调控。; 许景升吴茂森何晨阳; 关键词：水稻白叶枯病菌运动性

DNA微阵列技术在病原细菌基因转录谱分析中的应用被引量：1: 2008年; DNA微阵列技术是近年来发展起来的一种功能基因组学研究技术。随着这项新技术的建立和日趋完善及其在植物病理学研究中的应用,为病原细菌致病机理的研究带来了新思路并开辟了新途径。利用DNA微阵列技术,检测病原细菌在不同生长条件下和在侵染植物过程中的基因转录谱,可以从基因组水平上鉴定出新的与毒性和适应性相关的基因及其表达调控网络,有助于阐明这些基因的生物学功能及其机理。本文结合本实验室近几年来的相关研究结果,综述DNA微阵列技术在病原细菌转录谱研究中应用的最新进展。; 高世强张新建吴茂森何晨阳; 关键词：DNA微阵列植物病原细菌

应用GDPs转录物标记法进行水稻白叶枯病菌早期侵染表达谱分析: 2009年; 【目的】揭示水稻白叶枯病菌(Xanthomonas oryzae pv.oryzae,Xoo)在侵染水稻叶组织早期的基因表达谱差异。【方法】采用GDPs-Finder计算法,设计了能够覆盖KACC10331基因组全部ORFs的定向引物(GDPs),对Xoo与水稻互作1、3和7d的总RNA进行反转录,对病菌cDNA探针进行Cy3/Cy5选择性标记,与含有371个Xoo致病相关基因的芯片进行杂交。【结果】在水稻侵染的不同时期,Xoo致病相关基因表达谱存在差异。与在NBY中生长相比,Xoo在侵染1、3和7d时分别有42个(18个上调和23个下调)、51个(29个上调和22个下调)和33个(16个上调和17个下调)基因发生了差异表达;其中5个基因是共有上调表达的,5个是共有下调表达的。推测这些基因的差异表达可能与病菌适应寄主体内环境、生长与定殖以及为害与显症过程有关。【结论】应用GDPs转录物标记技术可以成功地进行Xoo侵染过程的表达谱分析,鉴定出的差异表达的基因可以作为功能研究的靶标基因。; 张新建高世强吴茂森何晨阳; 关键词：水稻白叶枯病菌表达谱差异表达基因

水稻转录因子OsBTF3对不同病原菌和信号分子的基因表达反应被引量：10: 2009年; 转录因子基因OsBTF3在水稻品种日本晴悬浮细胞中受白叶枯病菌(Xanthomonas oryzae pv.oryzae,Xoo)诱导表达。为了阐明OsBTF3在水稻叶组织中的表达特征,本研究利用RT-Q-PCR技术,对经3种亲和性病原菌[水稻白叶枯病菌(Xoo)、水稻条斑病菌(Xooc)和稻瘟病菌(Mg)]接种和4种信号分子[脱落酸(ABA)、水杨酸(SA)、茉莉酸甲酯(MeJA)、乙烯(ETH)]诱导处理的水稻叶片中OsBTF3的转录本进行了定量分析。结果表明,OsBTF3对Xoo、Xooc和Mg侵染的基因表达反应均显著地受到诱导,但反应速度和强度略有差异。而4种信号分子对OsBTF3表达的诱导作用差异较大,ABA诱导活性最强,MeJA和ETH次之,SA诱导作用不显著。因此,OsBTF3基因表达不仅具有病原菌Xoo、Xooc和Mg的诱导性,而且也具有信号分子MeJA、ETH和ABA的应答性。; 李广旭吴茂森何晨阳; 关键词：基因表达病原菌信号分子实时定量PCR

水稻基因启动子OsBTF3p的克隆和启动活性分析被引量：9: 2009年; 【目的】分子克隆水稻基因OsBTF3启动子片段,明确其对靶基因表达的启动作用,为抗病转基因水稻研究提供理论依据和启动子元件材料。【方法】对OsBTF3编码区上游1387bp的启动子(OsBTF3p)序列进行了克隆和序列分析,构建了OsBTF3p∷GUS融合基因植物表达载体pCAM-OsBTF3p,利用农杆菌介导的水稻遗传转化,获得了39株OsBTF3p∷GUS转基因植株,对OsBTF3p进行了启动活性、组织特异性及病原菌诱导性分析。【结果】分子克隆了OsBTF3p片段,其序列与GenBank中的已知序列一致。在转基因水稻愈伤组织中能够检测到GUS活性,表明该启动子具有启动活性。在转基因水稻叶片维管束组织和根部组织能检测到GUS活性。水稻白叶枯病菌(Xoo)侵染后OsBTF3p驱动的GUS活性明显地上调表达。【结论】OsBTF3p具有驱动GUS基因表达的启动活性、组织表达特异性和病原菌诱导性。; 柏亚男吴茂森何晨阳; 关键词：GUS活性组织特异性水稻

水稻白叶枯病菌c-di-GMP代谢系统成员鉴定及其信号机制分析: ＜正＞环鸟苷二磷酸（c-di-GMP）是一种广泛存在于细菌中的新型第二信使,具有调节包括细胞信号交流、生物膜形成、运动性和毒性等生物学功能。c-di-GMP的代谢（生物合成和降解）分别受带有GGDEF结构域的鸟苷酸环化酶...; 杨凤环梁士敏王红敏孙蕾管文静吴茂森陈华民何晨阳; 文献传递

水稻白叶枯病菌转录调控因子基因fleQxoo和σ^54因子基因rpoNxoo的分子鉴定被引量：7: 2008年; 为了阐明水稻白叶枯病菌(Xanthomonas oryzaepv.oryzae,简称Xoo)鞭毛生物合成及运动性的调控机理,本研究首先通过基因克隆、序列分析、缺失突变及表型测定,对转录调控因子fleQxoo和编码σ54因子的基因rpoNxoo进行了分子鉴定。通过基因特异性扩增,成功地从Xoo菌株PXO99A中克隆了fleQxoo和rpoNxoo。其基因序列与其它黄单胞病原菌中的同源序列高度保守。FleQxoo是NtrC家族激活蛋白成员之一,具有与σ54作用的结构域和DNA结合保守结构域(HTH)。用标记交换法构建了△fleQxoo和△rpoNxoo基因缺失突变体。与PXO99A相比,△fleQxoo和△rpoNxoo鞭毛产生能力丧失,运动性减弱,基因互补可以使之恢复;但其胞外纤维素酶和木聚糖酶活性以及对烟草叶片组织的致敏性无明显改变。因此,FleQxoo和σ54主要参与了鞭毛生物合成及其运动性的调控。; 张静许景升吴茂森何晨阳; 关键词：水稻白叶枯病菌

水稻白叶枯病菌TonB-Dep-Rec蛋白家族成员Tdrxoo的功能鉴定被引量：2: 2010年; 【目的】旨在揭示水稻白叶枯病菌(Xanthomonas oryzaepv.oryzae,Xoo)致病性和运动性及其基因表达的调控途径。【方法】本研究通过基因克隆、序列分析和缺失突变方法,对与应答调节子GacAxoo互作的Tdrxoo的分子特征和功能进行了鉴定。【结果】利用序列特异性引物进行基因扩增,成功地从野生型菌株PXO99A中克隆了tdrxoo基因。Tdrxoo与其它病原黄单胞菌的同源序列高度保守,具有TonB-Dependent-Receptor(TDR)结构域,推测其是位于细菌外膜、可能接收来自细菌体外环境信号的蛋白。用基因标记交换法,构建了△tdrxoo基因缺失突变体。与PXO99A相比,Δtdrxoo在人工培养条件下的生长受到影响,致病性完全丧失,胞外纤维素酶和木聚糖酶活性和运动能力显著减弱,基因互补可以使之恢复;Δtdrxoo嗜铁素产生无明显改变。【结论】Tdrxoo作为一种细胞外膜蛋白,可能参与调控了病菌的生长、致病性、胞外酶活性和运动性等表型。; 许景升吴茂森何晨阳; 关键词：水稻白叶枯病菌

c-di-GMP信号途径对细菌致病性的调控作用被引量：8: 2009年; 环鸟苷二磷酸(c-di-GMP)是一种广泛存在于细菌中的新型第二信使。鸟苷酸环化酶(DGC)和磷酸二脂酶(PDE)分别控制了c-di-GMP的合成和降解,其中DGC活性由GGDEF结构域决定,PDE活性由EAL和HD-GYP结构域决定。c-di-GMP调控着细菌多种生物学功能,抑制毒性因子产生和运动性,促进生物膜形成。c-di-GMP下游是一个包括转录、翻译以及翻译后等多层次的复杂调控网络。本文结合本室有关水稻白叶枯病菌的研究结果,综述近年来国内外在c-di-GMP研究领域的最新进展。; 管文静吴茂森何晨阳; 关键词：毒性运动性生物膜形成

水稻白叶枯病菌在寄主体内外不同生长条件下致病基因差异表达的分析被引量：1: 2009年; To demonstrate the expression profiling of Xanthomonas oryzae pv.oryzae(Xoo) in vitro and in planta,DNA microarrays of 371 genes potentially associated with pathogenicity and virulence were used to compare the transcriptional level alteration of the wild-type strain PXO99A and gene deletion mutants ΔgacAxoo and ΔfleQxoo of Xoo grown in the rich medium NBY vs.hrp-inducing minimal medium XOM2 or leaf tissues of rice.Results indicated that 17 and 38 genes of PXO99A were differentially expressed in XOM2 and the leaf tissues of rice relative to NBY,respectively.Twenty-eight genes of ΔgacAxoo grown in XOM2 and 12 genes of ΔfleQxoo in NBY were differentially expressed relative to PXO99A.The identification of differentially-expressed genes,GacAxoo-and FleQxoo-regulons and novel candidate genes of Xoo strains would provide us the target genes for further functional analysis in pathogenesis of Xoo.; 高世强张新建吴茂森何晨阳

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