国家高技术研究发展计划(2006AA10A120)
- 作品数：18 被引量：82H指数：6
- 相关作者：李辉王守志张细权户国饶友生更多>>
- 相关机构：东北农业大学华南农业大学江西教育学院更多>>
- 发文基金：国家高技术研究发展计划国家重点基础研究发展计划国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：生物学农业科学更多>>
- 畜禽全基因组选择被引量：9
- 2010年
- 数量遗传学在经历了传统的数量遗传学后逐步发展产生了数量遗传学与分子遗传学、生物技术相结合的分子数量遗传学。应用分子标记定位影响重要经济性状的QTL已经取得了显著的成果。QTL一旦得到定位,确定了该位点对表型的贡献率,就可以利用位于QTL侧翼的标记直接进行标记辅助选择。然而应用于标记辅助选择的标记只捕获了构成表型的一部分变异,而无法检测到构成性状的所有变异,为了解决这个问题,其中的一个途径就是利用全基因组范围内的标记,进行标记与表型的全基因组关联分析,鉴定对性状有影响的遗传标记,然后将这些标记应用于选择,这就是全基因组选择。文章就家畜QTL定位和标记辅助选择进行了简要的概述,同时对家畜全基因组选择进行了重点综述。
- 张慧王守志李辉
- 关键词：QTL标记辅助选择全基因组选择
- 鸡A-FABP基因5′-调控区22bp插入缺失位点与生长和体组成性状的相关研究
- 引言A-FABP基因作为脂肪代谢的重要候选基因一直受到人们的密切关注,王启贵于2002年首次克隆出了鸡的A-FABP基因,随后王启贵等对该基因外显子及内含子区域进行了多态性检测,并进行了相关分析,分析结果
- 关天竹王启贵王守志李辉
- 关键词：A-FABP基因多态性单倍型
- 文献传递
- 利用鸡F_2资源群体构建1号染色体遗传连锁图谱被引量：6
- 2007年
- 在鸡1号染色体上选取23个微卫星标记,利用东北农业大学鸡F2资源群体构建了遗传连锁图谱。选用369只F2个体用于基因型测定。结果表明23个微卫星位点除MCW0058为低度多态,其他位点均为中高度多态。构建的连锁图谱覆盖1号染色体全长,总共637.9cM。MCW0115和ROS0025标记顺序与EL图谱不同,但与WAU图谱一致。其他标记顺序与3大参考家系标记顺序一致,图谱总长和标记间距离大于3大参考家系。此连锁图谱的构建为数量性状位点(QTL)定位奠定了良好的基础。
- 柳晓峰王守志胡晓湘高宇王启贵张慧李宁李辉
- 关键词：微卫星
- Association Analysis of Microsatellite Markers and Body Weight and Abdominal Fat Traits in an Unique F2 Population of Chicken
- Introduction Over the past few years,several experimental crosses of chicken were used to detect QTL affecting...
- ZHANG Hui,WANG Shou-Zhi,LI Hui College of Animal Science and Technology,Northeast Agricultural University,Harbin 150030
- 关键词：CHICKEN
- 文献传递
- PPAR-γ基因对脂质代谢调控机制的生物信息学分析被引量：3
- 2009年
- 过氧化物酶体增殖激活受体γ(PPAR-γ)是具有重要生物学功能的转录因子,可调控脂肪细胞分泌的多种蛋白质因子基因的表达,促进脂肪细胞分化。它与肥胖、Ⅱ型糖尿病、心血管疾病、癌症的发病风险相关联。研究基于TRANSFAC数据库信息,利用MEME/MAST方法对PPAR-γ进行全基因组范围的靶基因生物信息学定位,并对获得的靶基因进行了GO和KEGG分析,探讨PPAR-γ基因对脂质代谢影响的分子机理。结果表明,PPAR-γ靶基因显著富集于36个GO节点(P<0.05),并参与了10个KEGG代谢通路(P<0.05),这其中大部分GO节点和KEGG代谢通路与脂质代谢密切相关。研究有助于理解PPAR-γ基因对脂质代谢影响的分子机理;同时,对于肥胖和糖尿病等复杂疾病的诊断、预防和治疗具有积极意义。
- 户国王守志李辉
- 关键词：PPAR-Γ脂质代谢靶基因生物信息学
- DRD2基因14个多态位点与鸡产蛋性状的相关性被引量：9
- 2010年
- 本研究旨在分析DRD2基因与鸡产蛋性状的相关性,寻找可作为鸡产蛋性状的重要标记。在该基因上选取了14个多态位点,采用PCR-RFLP及PCR测序等方法在宁都三黄鸡母系644个个体中进行了鸡产蛋性状的关联分析。结果表明:位于该基因5′调控区的4个突变位点G-38560C、T-38326G、T-32751C和A-16105G与鸡的开产日龄显著或极显著(P<0.05或P<0.01)相关,位点A-16105G还与300日龄总产蛋数显著相关(P<0.05);由G-38560C、G-38544A、I-38463D与T-38326G这4个位点组成的单倍型块与开产日龄呈极显著相关(P=0.006 5<0.01)。研究结果提示:G-38560C、T-38326G、T-32751C和A-16105G这4个突变位点以及由G-38560C、G-38544A、I-38463D与T-38326G组成的单倍型块可作为产蛋性状标记辅助选择的有效分子标记。
- 徐海平周敏方梅霞曾华聂庆华张德祥张细权
- 关键词：多态位点单倍型产蛋性状
- DRD1及DRD2基因多态性与鸡冠高和体重的相关性被引量：13
- 2010年
- 研究鸡DRD1及DRD2基因与冠高和体重的关系。在DRD1和DRD2基因上共选取20个多态位点,对586只宁都三黄鸡的基因型进行检测,分析各位点与77、84及91日龄冠高和体重性状的相关性。结果表明:位于DRD2基因5′侧翼区的位点A-6543G与91日龄体重显著相关(P<0.05),位点C-6539T与91日龄冠高显著相关(P<0.05);DRD1基因编码区上6个多态位点与不同日龄的鸡冠高和体重无显著相关(P>0.05),但由C+765T、C+1011T与G+1065A这3个位点组成的单倍型块与77日龄冠高呈显著的相关性(P<0.05)。研究结果提示:DRD1基因的单倍型块可作为77日龄冠高的辅助选择的有效分子标记;而DRD2基因上A-6543G可作为91日龄体重的有效分子标记,位点C-6539T可为91日龄冠高标记辅助选择提供参考。
- 徐海平周敏罗成龙曾华聂庆华张德祥张细权
- 关键词：多态位点体重
- 四个鸡品种GHSR基因遗传多样性分析
- 采用PCR-RFLP方法,对杏花鸡、泰和丝羽乌骨鸡、隐性白洛克鸡和红色原鸡GHSR基因的5个位点的遗传多样性进行研究。结果表明,5个位点的基因频率在这4个群体中分布差异很大,各位点群体杂合度在0和0.505 4之间波动。...
- 方梅霞聂庆华何丹琳刘满清张细权
- 关键词：单倍型分析
- 文献传递
- 同源相同性连锁不平衡作图构建高清晰度的QTL图谱
- 2009年
- QTL(quantitative trait loci)定位是近年来遗传学研究的一个重要内容,基于不同的遗传标记、不同的研究群体和不同的试验设计,运用标记—连锁分析可以把QTL成功地定位在染色体的某一特定区域.该法的一个明显不足是QTL图谱的清晰度必须依赖样本的规模以及标记的密度.许多研究表明,连锁不平衡分析是实现QTL精细定位的行之有效的方法.现就基于同源相同性连锁不平衡作图构建高清晰度QTL图谱的研究方法进行了综述,并对其应用前景进行了展望.
- 饶友生王樟凤
- 关键词：QTL
- 鸡pATGL基因的电子克隆及比较基因组分析被引量：2
- 2008年
- 利用生物信息学和比较基因组学方法对鸡pATGL(predicted adipose triglyceride lipase)基因的结构、表达和功能进行了分析,结果表明:(1)电子克隆获得的鸡pATGL基因cDNA全长1 788 bp,包括1 452 bp的编码区和5′UTR(70 bp)、3′UTR(266 bp),编码合成483个氨基酸的多肽;(2)鸡pATGL基因全长在30 kb以上,包含9个外显子和8个内含子,其中内含子1(约20 kb)远远长于其他区域;(3)鸡pATGL蛋白的相对分子质量为53 600,不含信号肽,具有GXSXG(氨基乙酸-X-丝氨酸-X-氨基乙酸)脂肪酶活性结构和Patatin结构域,可能存在5个N端朝内的跨膜螺旋结构;(4)基于cDNA及EST数据库的检索显示,鸡pATGL基因在腹脂、胸腺、黏液囊、脾、骨髓、垂体、下丘脑和松果腺、心脏、软骨组织、小脑、卵巢乃至胚胎等组织中表达;(5)鸡pATGL基因与CD151、RPLP2位于5号染色体的紧密连锁群,这种连锁关系与人、小鼠以及狗紧密一致.
- 聂庆华方梅霞李伟民谢亮张细权
- 关键词：比较基因组
