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国家自然科学基金(31300445)
作品数:
1
被引量:5
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毛琳
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2015
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不同PCR引物在根系丛枝菌根真菌群落研究中的应用比较(英文)
被引量:5
2015年
【目的】基础PCR的各种分子技术已广泛地应用于丛枝菌根真菌(AMF)的群落研究。为探讨不同PCR引物对丛枝菌根真菌群落的特异性差异扩增。【方法】本研究选取4对AMF特异性引物(NS31-AM1,AML1-AML2,NS31-AML2和SSUm Cf-LSUm Br),通过PCR、克隆及测序技术对AMF的多样性及群落结构进行了分析比较。【结果】不同引物对AMF的扩增特异性及覆盖度均有显著性差异,且不同引物得到的AMF群落结构也存在显著性差异。SSUm Cf-LSUm Br的扩增特异性及覆盖度最高,NS31-AML2和NS31-AM1次之,而AML1-AML2则相对较差。【结论】NS31-AML2的扩增区段能很好地与越来越被认可的AMF VT分类数据库(http://maarjam.botany.ut.ee)相匹配,且扩增片段长度也适合于目前的高通量测序技术。基于此,本文推荐NS31-AML2为AMF群落研究中的首选引物。
蒋胜竞
石国玺
毛琳
潘建斌
安黎哲
刘永俊
冯虎元
关键词:
菌根
群落生态学
DNA条形码
PCR引物
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