上海市科学技术委员会资助项目(05JC14013)
- 作品数：2 被引量：9H指数：2
- 相关作者：刘炳亚于颖彦张俊瞿颖李建芳更多>>
- 相关机构：上海交通大学医学院附属瑞金医院复旦大学上海市疾病预防控制中心更多>>
- 发文基金：上海市科学技术委员会资助项目国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：医药卫生生物学更多>>
- 应用蛋白质指纹图谱技术对胰腺癌标志物的筛选分析研究被引量：2
- 2008年
- 目的:应用表面增强激光解吸离子化飞行时间质谱(surface enhanced laser desorption/ionization-time of flight-masss pectrometry,SELDI-TOF-MS)筛选胰腺癌患者血清蛋白标志物。方法:应用强阴离子交换芯片(strong anionic exchange chromatography,SAX),选择最佳结合、洗脱缓冲液对18例胰腺癌患者及18例正常人血清标本进行蛋白质质谱分析。结果:应用SAX,经SELDI-TOF-MS分析,在胰腺癌患者血清筛选出与正常人血清有统计学意义差异蛋白8个(P<0.05),其中3个为高表达,相对分子量为4136.60、4465.92、4359.53Da,5个为低表达,相对分子量分别为15856.8、7564.52、15116.1、2042.78、2016.44Da。在18例胰腺癌患者中包括11例导管腺癌和7例其他类型癌,两者之间有统计学意义的差异蛋白1个,相对分子量4136.60Da。应用ROC曲线分析,确定6个差异蛋白对胰腺癌有中等诊断价值,敏感度为83%～94%,特异度为56%～67%。结论:经SELDI-TOF-MS技术在胰腺癌患者血清中筛选出灵敏度和特异度较好的差异表达蛋白,有助于胰腺癌的诊断。
- 郭静会张顺财王文静廖萍靳大勇楼文晖吴炯
- 关键词：生物标志物蛋白质组学
- 胃癌中IRX1的表达与启动子区甲基化的相关性被引量：7
- 2007年
- 目的探讨胃癌中同源盒基因IRX1的表达与启动子区甲基化修饰之间的关系。方法生物信息学软件分析IRX1基因启动子区;RT-PCR检测胃癌细胞株及手术切除胃癌组织IRX1基因mRNA表达水平;MSP及BSP法检测启动子区甲基化状态;检测去甲基化试剂5-杂氮-2’-脱氧胞苷的干预对胃癌细胞IRX1基因表达的逆转效应。结果经生物信息学预测IRX1基因转录起始点上游启动子区富含CpG岛;胃癌细胞株及胃癌组织IRX1基因表达有不同程度下调;MSP及BSP检测显示所有胃癌细胞株启动子区呈高甲基化状态;经5-Aza-CdR处理的细胞株IRX1基因的表达有不同程度上调。结论胃癌中IRX1基因的表达下调与启动子区甲基化修饰有一定关系,为探讨IRX1基因作为去甲基化治疗靶点的可能性提供了实验数据。
- 潘玉申于颖彦计骏纪玉宝瞿颖李建芳张俊刘炳亚朱正纲林言箴
- 关键词：同源盒基因胃癌甲基化
