山东省自然科学基金(Y2008G08)
- 作品数:4 被引量:10H指数:2
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- 基于遗传算法的启动子序列多粒度结构分*析
- 2009年
- 采用遗传算法对启动子序列数据集抽取不同长度的最优模糊子序列模式,以此分析启动子的结构。实验发现:适当调整子序列模式与样本序列的匹配程度阈值,可以发现局部频繁模式,除较长的TATA盒外还发现了其他一些模式,而在阈值较低时算法得到CpG岛。
- 吴彦王立宏赵宪佳
- 关键词:遗传算法启动子
- 基于半监督聚类的真核启动子识别
- 2010年
- 首先将待测试的DNA序列片段利用词项-序列矩阵进行表示,然后通过奇异值分解进行降维,最后采用全局一致性和局部一致性兼顾的半监督聚类算法对长的DNA序列片段进行测试,并与现有的几种启动子识别算法的结果进行对比。
- 赵宪佳
- 关键词:启动子识别半监督聚类奇异值分解
- 一种混合约束的半监督聚类算法被引量:2
- 2011年
- 提出一种混合约束的半监督聚类算法(HCC),综合考虑标号点和成对点约束信息的作用,使两种先验信息在聚类的过程中能以不同的方式发挥作用.给出理论推导、具体算法步骤、实验及分析.实验表明在HCC算法中,标号点对提高聚类结果的作用要比成对点约束信息的作用更明显,算法得到的CRI、聚类数、运行时间等多项指标都比对比算法好.
- 李雪梅王立宏宋宜斌
- 关键词:半监督聚类
- 近邻传播半监督聚类算法的分析与改进被引量:8
- 2010年
- 近邻传播半监督聚类算法SAP在小数据集上运行时可能会出现并列类代表点的现象,当出现并列类代表点时,依据决策矩阵E对角线上数值大于0确定的类代表点并不是全部的类代表点。分析了近邻传播算法的性质,找出了并列类代表点的出现原因,并针对此现象给出了改进算法。
- 赵宪佳王立宏
- 关键词:半监督学习