国家自然科学基金(30125030)
- 作品数：5 被引量：37H指数：3
- 相关作者：何祖华李群田平芳曹家树李志邈更多>>
- 相关机构：中国科学院上海生命科学研究院北京化工大学浙江大学更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金中国科学院知识创新工程更多>>
- 相关领域：生物学农业科学更多>>
- 受逆境诱导的水稻Rim2/Hipa假基因转录本选择性加尾和剪接(英文)被引量：3
- 2005年
- 我们以往的研究证明水稻受病原菌诱导的Rim2/Hipa 因子是水稻基因组所特有的 DNA 转座子超级家族。本实验通过对病原菌诱导的 cDNA文库的筛选和对 EST 数据库的搜索,发现在众多的 Rim2 拷贝中,只有 Rim2-42 因子被表达,其为一个TNP2类转座酶的假基因,其编码区为终止子所打断。序列分析结果表明Rim2转录本被选择性剪接和加尾,而且在两个水稻亚种中的剪接方式有差异,共形成 7 种不同转录本结构,包括一个未知功能的Rim2-XET嵌合转录本,该嵌合转录本为转录通读(read-through)所形成,而 XET 基因是可以被逆境所诱导的。这些结果说明Rim2因子家族可能已失去转座的活性。结果也初步表明Rim2-42 因子插入到了一个 XET 基因启动子的下游,该启动子带动了 Rim2 因子的诱导表达。
- 石夏荣李群何祖华
- 关键词：水稻假基因转录本
- 拟南芥激活标记突变体库的构建及突变体基因的克隆被引量：28
- 2005年
- 激活标记(activationtagging)技术是以功能获得突变体为研究对象,在植物功能基因组学的研究中具有重要的作用。文章以双子叶模式植物拟南芥(Arabidopsisthaliana)野生生态型植株为实验材料,以含有激活标记质粒pSKI015的农杆菌直接喷雾进行转化,并以抗除草剂Basta为筛选标记,构建了拟南芥的激活标记突变体库。结果共得到约20000个独立转化株系(T1代),其中38个株系有明显的表型变化,约占转化植株总数的千分之二。基因组DNASouthern杂交结果表明,大多数转化植株为多拷贝T-DNA插入。通过质粒拯救(plasmidrescue)和TAIL-PCR(Thermalasymmetricinterlaced-PCR)可获得T-DNA插入的基因组旁邻序列,为克隆突变体的基因奠定基础。
- 李志邈张海扩曹家树何祖华
- 关键词：拟南芥
- 水稻Rim2/Hipa超级家族的基因组变异和基于Rim2/Hipa展示的水稻资源的系统进化和指纹分析(英文)被引量：2
- 2006年
- 水稻Rim2/Hipa是最近鉴定的一个受逆境诱导的转座因子超级家族.研究表明,Rim2的核心序列在不同来源的水稻材料中存在显著的差异,暗示Rim2家族的长期进化历程.基于Rim2因子间的差异性以及该因子的静止状态,开发出一种利用Rim2因子展示的新的分子指纹技术,可以灵敏地区分不同水稻资源以及它们的遗传关系.仅用5对引物就可以清楚地将53个栽培稻和普通野生稻材料鉴定出来,并可将它们分为不同的系统进化组.研究表明不仅在水稻资源而且在野生稻种质间均存在明显的多样性.野生稻可以被单独分组,或者分散在粳稻中间.这种新的指纹技术还可以将水稻的杂交子代和它们的亲本区分出来,并可用于种子纯度的鉴定,在水稻基因组进化研究、水稻育种和种子生产中有很好的应用前景.
- 田平芳王建军吴刚李群卢宝荣何祖华
- 关键词：水稻系统树指纹
- Physiological and Molecular Features of the Pathosystem Arabidopsis thaliana L.-Sclerotinia sclerotiorum Libert被引量：4
- 2006年
- 真菌的病原体 Sclerotinia sclerotiorum Libert 原因腐烂因为抵抗变化的缺乏，世界范围的许多庄稼和大经济损失上的疾病经常发生。S 的致病。sclerotiorum 和对病原体的植物回答的分子的基础糟糕被理解。在现在的调查， S 的过程。在 Arabidopsis thaliana L. 的 sclerotiorum 感染，高度产生这真菌的植物，被分析。另外，在主人的防卫激活被调查。用稷谷物的一个方便接种方法为 S 被开发。在 Arabidopsis 的 sclerotiorum。真菌很快感染了植物，可能通过像球或像垫子的感染结构。在 24 h 和植物以内开发的可见症状被打死在接种以后的 72 h。绗维素酶，引起了主人纸巾腐烂的主要的酶，被 S 分泌。以一种 pH 依赖的方式的 sclerotiorum。草酸酸，另一个病原的因素由真菌藏匿了，在叶子的导致的坏死的损害。有 S 的感染。sclerotiorum 强烈导致了生产致病相关(PR ) 在 Arabidopsis 的蛋白质 -1,3-glucanase 和 chitinase。而且， PR 基因 PDF.1 被导致，然而并非 PR1，显示病原体激活 jasmonic 酸 / 乙烯依赖的基础防卫，它与它的 necrotrophic 特征一致。为 Arabidopsis-S 的这 pathosystem。sclerotiorum 能为在 S 之间的相互作用的分析提供一条途径。sclerotiorum 和其它庄稼，从而为控制这病原体便于基因操作技术。
- Fu-Ming DaiTong XuGerhard A. WolfZu-Hua He
- 关键词：核盘菌属阿布属
- Physiological and Molecular Features of the Pathosystem Arabidopsis thaliana L.-Sclerotinia sclerotiorum Libert
- The fungal pathogen Sclerotinia sclerotiorum Libert causes rot diseases on many crops worldwide and large econ...
- Gerhard A. Wolf
- 关键词：DEFENSEPATHOGENESIS
- 植物CACTA转座子的研究进展(英文)被引量：1
- 2006年
- 转座子是染色体上可移动的DNA序列,根据转座机制可将其分为:通过RNA中间体进行转座的逆转录座子(Retrotransposon)和通过DNA中间体进行转座的转座子(Transposon)。En/Spm家族转座子是后者中的一类,它的末端反向重复序列(Terminalinvertedrepeats,TIRs)具有保守的5个碱基CACTA,所以通常又称为CACTA转座子。除此之外,其靶位点一般为3bp的同向重复(Targetsiteduplication,TSD);亚末端区域分布着若干正向或反向的重复序列(Subterminrepeat,STR)。迄今为止,CACTA转座子仅发现于植物基因组。过去一直认为由于其相对保守的转座机制而拷贝较少,但最近研究发现,该因子多拷贝存在于某些禾本科植物基因组中。由于该家族在基因组中分布的广泛性,具有用作分子指纹的应用前景。本文就其结构、转座机制和应用前景等做一综述。
- 田平芳
- 关键词：转座
