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国家重点基础研究发展计划(2011CBA01002)

作品数:5 被引量:2H指数:1
相关作者:张智英白义春魏泽辉徐坤刘林更多>>
相关机构:西北农林科技大学中国农业大学南开大学更多>>
发文基金:国家重点基础研究发展计划国家科技重大专项国家自然科学基金更多>>
相关领域:生物学农业科学更多>>

文献类型

  • 5篇中文期刊文章

领域

  • 3篇生物学
  • 3篇农业科学

主题

  • 2篇端粒
  • 2篇端粒序列
  • 2篇基因
  • 1篇蛋白
  • 1篇多能干细胞
  • 1篇阳性
  • 1篇受体
  • 1篇酸酶
  • 1篇特异
  • 1篇特异性
  • 1篇启动子
  • 1篇启动子克隆
  • 1篇染色
  • 1篇染色体
  • 1篇转录
  • 1篇转录调控
  • 1篇相关受体
  • 1篇锌指
  • 1篇锌指蛋白
  • 1篇锌指核酸酶

机构

  • 3篇西北农林科技...
  • 1篇南开大学
  • 1篇中国农业大学

作者

  • 2篇张智英
  • 1篇张存芳
  • 1篇王令
  • 1篇阮卫民
  • 1篇徐坤
  • 1篇陈成彬
  • 1篇王华岩
  • 1篇刘楷
  • 1篇宋文芹
  • 1篇杨藩
  • 1篇纪光臻
  • 1篇魏泽辉
  • 1篇杨洋
  • 1篇王瑞
  • 1篇杜丽霞
  • 1篇李宁
  • 1篇林娟
  • 1篇白义春
  • 1篇刘林

传媒

  • 1篇遗传
  • 1篇西北农林科技...
  • 1篇生物工程学报
  • 1篇Scienc...
  • 1篇中国科学:生...

年份

  • 1篇2016
  • 1篇2015
  • 3篇2012
5 条 记 录,以下是 1-5
排序方式:
猪CFTR基因特异性锌指核酸酶的筛选与鉴定
2012年
【目的】获得靶向猪囊性纤维化跨膜传导调节因子(Cystic fibrosis transmembrane conductance regu-lator,CFTR)基因的特异锌指核酸酶(Zinc finger nuclease,ZFN),为建立CFTR基因敲除猪细胞系提供技术支持。【方法】通过开源式(Oligomerized pool engineering,OPEN)方法筛选,首先以已知三锌指蛋白为框架,随机突变单个锌指关键位点氨基酸编码序列,建立人工三锌指蛋白随机库;然后应用细菌双杂交技术,从库中筛选出能够结合CFTR基因靶位点的三锌指蛋白;最后将获得的锌指蛋白与非限制性核酸内切酶FokⅠ组装成特异ZFN,通过酵母验证体系,检测ZFN靶向切割其识别序列的效率。【结果】获得3个人工三锌指蛋白随机库,每个库约含有2×106个单克隆,通过2轮细菌双杂交筛选,分别获得48个针对CFTR基因左右两侧靶位点的三锌指蛋白。ZFN活性验证结果表明,约90%的ZFN能够在酵母细胞内实现靶向切割,获得了高效特异的ZFN。【结论】获得了猪CFTR基因高效特异的ZFN。
王瑞王令林娟张存芳张智英
关键词:锌指核酸酶锌指蛋白
猪中间端粒序列的保守性和特征
2012年
哺乳动物包括小鼠和人的端粒由位于染色体末端的TTAGGG重复序列组成,对维持染色体的稳定有重要作用.TTAGGG重复序列也出现在染色体末端以外的其他部位,称为中间端粒序列.异常的中间端粒被用来研究染色体的不稳定性,并且在癌细胞中也发现有异常的中间端粒.通过端粒荧光原位杂交,并与不同的物种进行比对,实验表明,猪的6号染色体着丝粒区有植物的TTTAGGG端粒重复序列(plant telomere sequences of TTTAGGG,bITSs),它与脊椎动物的TTAGGG序列(vertebrate telomere sequences TTAGGG,vITSs)并存于同一区域.通过对不同细胞系端粒长度的分析,ITS的端粒长度是动态变化的,它的变化趋势与末端端粒长度的变化趋势呈正相关.同时,猪的端粒末端有很高频率的双端粒信号(doublets),可能与染色体的不稳定性和ITSs端粒的动态性有关.总之,猪染色体的ITS区含有植物和动物的保守端粒序列,对ITS功能和调节机制的进一步研究可能为进化和染色体不稳定性的研究提供新的依据.
纪光臻刘楷陈成彬阮卫民GLYTSOU Christina杨洋OKUKA Maja宋文芹GAGOS Sarantis李宁刘林
关键词:进化端粒
哺乳动物基因组靶向修饰阳性细胞富集的报告载体系统研究进展被引量:1
2016年
基因组靶向修饰技术对基因功能研究、基因治疗以及转基因育种研究都具有重要的意义和价值。近年来发展起来的人工核酸酶如ZFNs、TALENs和CRISPR/Cas9等的应用大大提高了基因组靶向修饰的效率。但是由于核酸酶表达载体转染效率、核酸酶表达效率及活性以及基因组被打靶后的修复效率等因素在一定程度上制约着基因组靶向修饰阳性细胞的获得。因此富集和筛选基因组靶向修饰阳性细胞是一个亟待解决的问题。报告载体系统可以间接地反映核酸酶的工作效率并有效富集核酸酶修饰的阳性细胞,进而提高基因组靶向修饰阳性细胞的富集和筛选效率。本文主要针对由非同源末端连接(Non-homologous end joining,NHEJ)和单链退火(Single-strand annealing,SSA)两种修复机制分别介导的报告载体系统的原理和应用进行了详细的介绍,以期为以后的相关研究提供借鉴和参考。
白义春徐坤魏泽辉马琤张智英
Conservation and characterization of unique porcine interstitial telomeric sequences被引量:1
2012年
Telomeres are composed of TTAGGG repeats and located at the ends of chromosomes. Telomeres protect chromosomes from instability in mammals, including mice and humans. Repetitive TTAGGG sequences are also found at intrachromosomal sites, where they are named as interstitial telomeric sequences (ITSs). Aberrant ITSs are implicated in chromosomal instability and found in cancer cells. Interestingly, in pigs, vertebrate telomere sequences TTAGGG (vITSs) are also localized at the centromeric region of chromosome 6, in addition to the end of all chromosomes. Surprisingly, we found that botanic telomere sequences, TTTAGGG (bITSs), also localize with vITSs at the centromeric regions of pig chromosome 6 using telomere fluorescence in situ hybridization (FISH) and by comparisons between several species. Furthermore, the average lengths of vITSs are highly correlated with those of the terminal telomeres (TTS). Also, pig ITSs show a high incidence of telomere doublets, suggesting that pig ITSs might be unstable and dynamic. Together, our results show that pig cells maintain the conserved telomere sequences that are found at the ITSs from of plants and other vertebrates. Further understanding of the function and regulation of pig ITSs may provide new clues for evolution and chromosomal instability.
JI GuangZhenLIU KaiCHEN ChengBinRUAN WeiMinGLYTSOU ChristinaYANG YangOKUKA MajaSONG WenQingGAGOS SarantisLINingLIU Lin
关键词:端粒序列间质常染色体
猪ESRRB启动子克隆及其调控活性检测
2015年
Esrrb(Estrogen related receptorβ)属于雌激素受体家族,是一类在胚胎早期外胚层细胞中表达并对干细胞多能性维持起重要作用的基因。为了探索猪ESRRB的表达和转录调控机制,克隆了3.3 kb ESRRB启动子片段,构建了相应的报告载体。并将报告载体分别转染293T人胚肾细胞、Hela人宫颈癌细胞和小鼠C2C12成肌细胞。通过TFSEARCH和JASPER方法对ESRRB启动子潜在的转录调控位点进行分析,发现该启动子上有SMAD、STAT3、MYC、KLF4等多能转录因子的结合位点。将相应的转录因子与ESRRB启动子共转染,并检测报告基因荧光素酶的活性。结果显示猪ESRRB启动子具有明显的组织特异性调控,同时SMAD对ESRRB启动子活性有较明显的调控作用。进一步对3.3 kb片段进行了一系列的缺失,发现猪ESRRB核心区域位于5′上游的-25 bp和-269 bp之间。研究结果表明猪ESRRB启动子上潜在的转录因子结合位点及启动子核心区域是参与调控ESRRB表达的重要序列。
杨藩王亚娴杜丽霞王华岩
关键词:雌激素相关受体启动子多能干细胞转录调控
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