国家重点基础研究发展计划(2009CB522602)
- 作品数：12 被引量：63H指数：5
- 相关作者：陈泽良王玉飞徐杰于爽陈燕芬更多>>
- 相关机构：军事医学科学院四川农业大学南京农业大学更多>>
- 发文基金：国家重点基础研究发展计划国家自然科学基金长江学者和创新团队发展计划更多>>
- 相关领域：医药卫生农业科学生物学更多>>
- 布鲁菌进化和分类学研究进展被引量：21
- 2011年
- 布鲁菌属革兰氏阴性兼性胞内寄生菌,能感染多种宿主动物和人。该属可分为6个典型种,包括羊种、牛种、猪种、沙林鼠种、绵羊附睾种以及犬种布鲁菌等。此分类是基于其致病性以及宿主偏好性的差异划分。尽管6个种通过传统表型试验能区分,但布鲁菌种内采用DNA-DNA杂交证明DNA同源性高度一致(相似性大于90%)。因此有人提议布鲁菌由单一种组成,即布鲁菌属中只有羊种布鲁菌,其他种都是羊种菌的生物亚型之一。然而基于其他分子技术的基因分型表明其DNA多态性表现明显,说明目前对这个种的分型还是比较准确。而最近分离的海洋种布鲁氏菌分离株(鳍型和鲸型)采用传统分型标准和一些特异的分子标记也证明这种分型比较正确。本文对目前布鲁菌种属进化和分类学进行综述,希望对研究其进化和分类有所帮助。
- 钟志军于爽徐杰王玉飞白耀霞陈燕芬付思美王同坤汪舟佳杜昕颖彭广能黄克和陈泽良
- 关键词：布鲁氏菌进化分类学
- 不同种型布鲁菌标准株的比较基因组学研究被引量：7
- 2013年
- 探究不同种型布鲁菌标准株的基因组构成差异。通过布鲁菌全基因组DNA芯片技术对19株不同种型布鲁菌标准株进行比较基因组学研究。结果显示:19株不同种型布鲁菌标准株之间存在大量缺失基因,同时发现一些基因以多拷贝形式存在。缺失基因的功能大致分为4类:信息储存和传递;胞内活动处理;营养代谢、功能未知或仅了解部分功能,共鉴定到这类基因211个。深入认识了19株不同种型布鲁菌标准株基因组组成上的差异,为我们进一步认识不同种以及亚型在毒力以及宿主特殊性提供了依据。大量缺失基因在19株布鲁菌标准株出现,构成了布鲁菌标准株不同种以及亚型之间的遗传学基础。
- 钟志军徐杰于爽王玉飞周冬生黄祥明乔凤曲勍杨洋罗永久刘学涵原慧陈燕芬黄克和陈泽良彭广能
- 关键词：比较基因组学
- 荧光报告质粒构建及其在布鲁菌细胞侵袭试验中的应用
- 2014年
- 采取质粒shuffling方法,将含GFPmut1的pPS858和能在布鲁菌中复制的质粒pBBR1MCS-2经KpnⅠ酶切后连接,转化DH5α,利用双抗性筛选重组质粒pBBR1-GFP。将荧光质粒转入布鲁菌,获得荧光标记布鲁菌,并用构建好的荧光标记布鲁菌侵染巨噬细胞J774A.1,探讨其用于细胞侵袭试验的可行性。结果显示,成功构建布鲁菌荧光报告质粒pBBR1-GFP,用构建好的荧光标记布鲁菌侵染巨噬细胞后,在细胞内观察到带荧光的布鲁菌,且荧光强度与胞内细菌数成正比。细胞侵袭动态试验结果表明,细菌与细胞共孵育45min后,胞内细菌达到饱和。结果表明,成功构建了布鲁菌的荧光质粒报告系统,可用于布鲁菌细胞侵袭试验。
- 钟志军乔凤于爽任志华徐杰王玉飞黄祥明陈泽良兰景超吴孔菊彭广能
- 关键词：布鲁菌
- 基于VNTR技术对布鲁菌的基因多态性研究被引量：4
- 2011年
- 应用15个VNTR位点对我国保存的19株布鲁菌标准株和4株减毒活疫苗以及松源地区10株临床分离株进行基因多态性研究。采用15个VNTR位点对33株布鲁菌进行PCR扩增,产物进行琼脂糖电泳,根据产物大小计算序列重复数,据此分析菌株的遗传多态性。建立了15个VNTR位点的琼脂糖凝胶电泳及拷贝数计算分析方法,应用该技术分析了33株布鲁菌的遗传多态性。结果表明这15个位点能较好地区分不同种型或亚型以及减毒活疫苗株,同时也为临床株的分型提供了依据。
- 钟志军于爽彭广能徐杰王玉飞曲勍马晓平黄克和甄清陈泽良
- 关键词：布鲁菌遗传多态性
- 布鲁氏菌B.ovis virB缺失株的构建及胞内环境适应性分析被引量：2
- 2012年
- 目的:利用基于T载体快速克隆构建布鲁氏菌突变株的方法,构建缺失VirB启动子区域的绵羊附睾布鲁氏菌株,为绵羊附睾种布鲁氏菌IV型分泌系统功能研究奠定基础。方法:运用同源重组的原理,用Kana抗性基因替换编码分泌系统VirB的启动子区域,从而获得virB的突变株。通过RT-PCR对突变株virB基因的转录进行了分析;分析突变株和野生株在体外模拟的胞内环境下的生存能力,观察virB对B.ovis胞内生存环境适应的影响。结果:成功构建了B.ovis的缺失virB启动子区的突变株,突变株中virB基因的表达抑制。与野生株相比,突变株对胞内环境的适应力发生了改变。结论:利用T载体克隆和抗性替换的方法成功构建了B.ovis的virB的突变株,为B.ovis的IV型分泌系统的功能研究奠定了基础。
- 高光俊柯跃华徐杰王丽萍张正芳李卓琳王璐璐郭英飞王玉飞徐兴然陈泽良
- 布鲁氏菌减毒活疫苗株的比较基因组学研究被引量：4
- 2012年
- 目的探究布鲁氏菌减毒活疫苗株与亲本株的分子遗传差异。方法通过布鲁氏菌全基因组DNA芯片对4株减毒活疫苗株进行比较基因组学研究。结果通过比较基因组学研究,发现疫苗菌株中存在大片段基因缺失,同时发现一些基因以多拷贝形式存在。4株减毒活疫苗株分别缺失不同数目的功能基因,主要为胞内活动有关基因和功能未知基因(分别为31和45个)。较深入地认识了布鲁氏菌减毒活疫苗株基因构成上的差异。结论与亲本株相比,4株减毒活疫苗株缺失大量基因,构成了不同疫苗株差异的遗传基础。
- 钟志军徐杰于爽王玉飞周冬生乔凤曲勍汪舟佳杜昕颖陈燕芬黄克和马晓平陈泽良彭广能
- 关键词：布鲁氏菌减毒活疫苗比较基因组学
- 125株耐碳青霉烯类抗菌药物鲍氏不动杆菌多位点序列分型被引量：5
- 2012年
- 目的了解医院耐碳青霉烯类鲍氏不动杆菌的遗传特征。方法选取耐碳青霉烯类鲍氏不动杆菌分离株,进行多位点序列分型(MLST)。结果选取的125株耐碳青霉烯类鲍氏不动杆菌,7个看家基因中6个等位基因数为1,gpi的等位基因数为3,可变位点数为3;125株菌MLST分析,3个ST型,其中ST 75型有82株,ST92型有20株,ST138型有23株,ST75、ST92与ST138属于同一克隆群。结论医院耐碳青霉烯类鲍氏不动杆菌相对进化较慢,对多种抗菌药物耐药,应严格消毒措施及无菌操作,减少由耐碳青霉烯类鲍氏不动杆菌引起的医院感染;减少抗菌药物的使用,减缓泛耐药菌的产生。
- 徐杰郭洁王丽丽王玉飞苑锡铜袁静宋宏彬黄留玉张宁陈永德陈泽良刘世巍
- 关键词：鲍氏不动杆菌多位点序列分型
- 尿道致病性大肠埃希菌分离株的耐药性与毒力基因分布及相互间关系研究被引量：1
- 2013年
- 目的探讨尿道致病性大肠埃希菌(UPEC)临床分离株中毒力因子的分布、耐药性及其两者间的关系。方法用PCR扩增的方法筛查95株UPEC临床分离株的fimH、traT、aerJ、papGⅢ、fyuA、pAI、hlyA、papG、papC等毒力基因的分布;用K-B法分析菌株对18种抗菌药物的敏感率。结果 95株UPEC中fimH、traT、aerJ、papGⅢ、fyuA、pAI、hlyA、papG、papC等毒力基因的分布率依次为92.63%、81.05%、65.26%、37.89%、24.21%、30.53%、3.16%、11.58%、21.05%;选取的95株UPEC对青霉素类、β-内酰胺酶抑制复合物、头孢类、氨基糖苷类、氟喹诺酮类的耐药率依次为74.74%、33.68%、32.63%、36.84%、76.84%,均>30.00%;而6大类不同抗菌药物中,仅碳青霉烯类的敏感率为100.00%;毒力基因分布与耐药性之间差异有统计学意义(P<0.05)。结论 UPEC分离株以Ⅰ型菌毛为主,同时含有多个毒力基因;大多数UPEC表现为多药耐药;毒力基因数与耐药性之间密切相关,临床应注意抗菌药物的规范合理使用,防止UPEC耐药性的产生和传播,降低耐药菌引起的危害。
- 王立平刘世巍郭洁王玉飞徐杰高光俊王璐璐李卓林张正芳陈泽良李竞
- 关键词：尿道致病性大肠埃希菌毒力基因耐药性
- 不同种型布鲁菌间的基因获得与缺失研究
- 2011年
- 目的:了解不同种型布鲁菌间的基因差异及基因的获得与缺失情况。方法:采用生物信息学方法比较分析已测序的10株布鲁菌基因水平的差异,分析它们的核心基因组与泛基因组,对得到的差异基因用PCR验证其在19株不同生物型标准菌株中的分布情况。结果:不同种型布鲁菌在基因水平上存在较大差异,差异基因主要位于Ⅱ号染色体上;根据差异基因,鉴定了42个差异区段,这些差异区段在19株不同生物型标准菌株中存在差异分布。结论:布鲁菌在进化过程中分别获得或失去了不同的基因区段,从而适应不同的宿主环境。
- 杨毅颜焱峰陈燕芬周晓燕王玉飞周冬生杨瑞馥姜海崔步云陈泽良黄留玉
- 关键词：布鲁菌比较基因组学
- 布鲁氏菌比较基因组学研究进展被引量：14
- 2011年
- 依据宿主偏好性的不同,布鲁氏菌分为6个经典种。根据生物学特性又将其分为19个亚型。包括：B.melitensis（羊种,主要感染绵羊和山羊种,
- 钟志军于爽徐杰王玉飞彭广能陈燕芬白耀霞付思美王同坤汪舟佳杜昕颖黄克和陈泽良
- 关键词：布鲁氏菌比较基因组学生物学特性羊种
