广州市科技计划项目(12C14071615)
- 作品数：6 被引量：36H指数：4
- 相关作者：宋长绪张乐宜蔡汝健蒋智勇夏平安更多>>
- 相关机构：广东省农业科学院动物卫生研究所河南农业大学更多>>
- 发文基金：广州市科技计划项目广东省农科院院长基金国家现代农业产业技术体系建设项目更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- 广东省猪圆环病毒2型毒株分离及全基因序列分析被引量：6
- 2014年
- 为了解广东省猪圆环病毒2型（PCV2）的流行、变异及进化情况,对2013年广东省多个猪场发生PCV2感染的病猪血清进行PCV2病毒分离,参考GanBank上已发表的PCV2全基因序列,设计3对引物,用PCR方法扩增其全基因序列,测序并进行序列分析.结果分离到9株PCV2毒株,全基因序列长度都为1 767 bp.同源性分析表明,9株PCV2分离株核苷酸同源性为93.6％～99.4％,与2012年分离株同源性为94.5％～99.7％,与2011年分离株同源性为94.2％～99.7％,与GenBank中其他PCV2分离株的同源性为93.2％～99.7％.9株PCV2的ORF2核苷酸及其推导的氨基酸序列同源性分别为89.0％～99.9％和86.4％～ 100％,存在一定的变异.基因型分析表明,有5株属于PCV2d,3株属于PCV2b,1株属于PCV2a.对2011-2013年分离的PCV2基因组特征进行分析,发现PCV2核苷酸序列比较稳定,与世界其他分离株也具有较高的同源性.
- 孟张丽梁鹏帅夏平安刘燕玲李艳蒋智勇蔡汝健宋长绪
- 关键词：猪圆环病毒2型全基因序列
- 猪红斑丹毒丝菌GZ株的分离鉴定及序列分析被引量：4
- 2014年
- 2013年11月从广州某猪场发生急性败血症死亡的母猪心脏、肺脏、脾脏分离到1株病原菌，经形态学观察、培养特性、生化特性及16SrRNA、spaA基因测序，确定为猪红斑丹毒丝菌，命名为GZ株。结果表明，该菌株对阿莫西林、利福平、庆大霉素、头孢类抗生素高度敏感，对其他药物广泛耐药，对BALB／c小鼠的致死剂量为1．5×10^8cfu／mL。测序结果与NCBI收录的猪红斑丹毒丝菌进行Blast比对分析，16SrRNA基因与不同地区分离自人、蛋鸡、猪、白海雕、野猪、野兔、鼠等动物的同源性为95．9％～99．8％。spaA基因与NCBI收录的分离菌株核苷酸同源性为98．9％～99．9％，氨基酸同源性为99．5％，3处发生突变，其中，第36位缬氨酸突变为亮氨酸，第203位异亮氨酸突变为蛋氨酸，第257位亮氨酸突变为异亮氨酸；与1998年和2006年日本1a型Fujisawa株的核苷酸同源性最高，为99．8％，因此确定分离的GZ株为1a血清型。
- 张乐宜蔡汝健蒋智勇宋长绪
- 关键词：RRNA
- 猪葡萄球菌EXHC、SHETA基因的克隆、序列分析及蛋白结构预测被引量：1
- 2014年
- 为分析猪葡萄球菌脱落毒素EXHC和SHETA基因结构并预测其所编码蛋白的结构和功能,本试验根据GenBank已报道的猪葡萄球菌脱落毒素EXHC和SHETA基因序列分别设计了1对特异性引物,从猪葡萄球菌GDZC株中扩增获得EXHC和SHETA基因片段,大小分别为1007和971bp。序列分析结果表明,EXHC基因与猪葡萄球菌丹麦分离株（GenBank登录号：AF515455）及猪源松鼠葡萄球菌河北分离株（GenBank登录号：JF755400）的核苷酸序列、氨基酸序列同源性均为100.0%,而与其他葡萄球菌脱落毒素基因的核苷酸、氨基酸序列同源性分别为3.3%~53.9%和7.9%~44.2%。SHETA基因与日本分离株（GenBank登录号：AB036768）的核苷酸序列同源性为96.2%,氨基酸序列同源性为98.4%,在保守区共有31个碱基发生突变。利用DNAStar软件对EXHC和SHETA蛋白结构进行分析,结果显示EXHC基因编码的蛋白为亲水性蛋白,SHETA基因编码蛋白为疏水性蛋白,抗原性较差。本研究从猪葡萄球菌GDZC株中成功扩增获得EXHC和SHETA基因片段并对其编码的蛋白结构进行了预测,证实了中国分离的猪葡萄球菌同时携带有EXHC和SHETA2种毒素基因,为进一步研究猪葡萄球菌的致病机理及毒素之间的相互作用提供了理论依据。
- 张乐宜李艳蔡汝健蒋智勇刘燕玲宋长绪
- 关键词：猪葡萄球菌
- 猪化脓隐秘杆菌的分离鉴定及病原特性研究被引量：8
- 2014年
- 从广东惠州某猪场患有心包炎和肺炎的病猪内脏器官分离到1株细菌，经形态学观察、生化特性分析，初步确定为化脓隐秘杆菌（Arcanobacterium pyogenes ）。利用 PCR 方法对16 S rRNA 基因以及毒力基因 plo、nanH、nanP、cbpA 基因进行扩增及序列测定。Blast 结果表明，该分离株的16 S rRNA 基因与GenBank 数据库中分离自野猪、牛、羊、林麝等动物的化脓隐秘杆菌的核苷酸序列同源性为91．6％～95．0％，证实该分离株为猪化脓隐秘杆菌（A．pyogenes）。毒力基因扩增出 plo、nanH、fimA 基因，未扩增出nanP、cbpA、fimC、fimG 基因。动物致病性试验显示该菌株具有较强的致病性。药敏试验结果显示，分离菌株对头孢唑啉、头孢拉定、头孢噻肟、新生霉素、阿莫西林、氨苄西林、万古霉素高度敏感，对强力霉素、恩诺沙星、阿米卡星、氧氟沙星中度敏感，对链霉素、磺胺异噁唑、四环素、庆大霉素、林可霉素、新诺明、诺氟沙星耐药。本研究为猪化脓隐秘杆菌的鉴定及其流行病学调查与防治提供了参考依据。
- 张乐宜蔡汝健宋长绪
- 关键词：化脓隐秘杆菌病原
- 猪源绿色气球菌的分离鉴定及16S rRNA基因序列测定与遗传进化分析被引量：7
- 2014年
- 为研究引起广东部分地区猪场仔猪发生急性死亡的致病菌及其系统发育地位,本研究从广东英德、惠州龙门、翁源、汕头等地区猪场急性死亡病仔猪中分离到6株呈α溶血的细菌。通过细菌形态学观察、生化特性鉴定、药敏试验、致病性试验以及16S rRNA基因的序列分析,确定为猪源绿色气球菌,分别命名为HD、WY、ZQ、LM、YD和ST。动物感染试验表明:6株分离菌株均具有不同程度的致病性;药敏结果显示:6株分离株均对头孢曲松、头孢唑啉、恩诺沙星、阿莫西林高度敏感,对新生霉素、利福平、阿米卡星、庆大霉素、多粘菌素B中度敏感,对其他抗生素均耐药;同源性及遗传进化分析结果显示:6株分离株与12株国内外参考菌株核苷酸同源性在93%以上,其中与澳大利亚分离自犬的15MS株同源性最高,为98.1%,与广西分离自猪的GXBL-1株同源性最低,为83.6%;6株分离株与广东分离株和澳大利亚分离株亲缘关系最近,暗示进化不存在明显的地域相关性。本研究确定了广东部分地区引起规模化猪场仔猪发生急性死亡的病原菌,为该菌引起的疾病的防治提供了依据。
- 张乐宜李艳蔡汝健刘燕玲蒋智勇宋长绪
- 关键词：绿色气球菌RRNA遗传进化分析
- 华南地区猪流行性腹泻病毒的分子流行病学调查与分析被引量：10
- 2015年
- 为了解华南地区猪流行性腹泻病毒(PEDV)的流行、变异及进化情况,从该地区的不同猪场采集2 159份样品,利用RT-PCR方法检测PEDV,扩增了部分PEDV阳性样品中的S、M和ORF3基因并测序,利用生物信息学软件进行序列分析。结果显示,PEDV在猪场中的检出率为100%,在所有样品中的平均检出率为53.0%,在哺乳仔猪、断奶仔猪、育肥猪和母猪样品中,PEDV平均阳性率分别为67.6%、42.8%、12.8%和47.2%。根据S、ORF3和M基因建立的进化树,PEDV可分为2个基因群,其中当前样品株为一群,韩国、美国和中国的参考毒株为一群。结果表明,PEDV在华南地区猪场普遍存在,其基因也在不断发生变化。
- 王栓群孙瑞芹刘燕玲夏平安宋长绪
- 关键词：猪流行性腹泻病毒分子流行病学
