中国博士后科学基金(2003033495) 作品数:5 被引量:125 H指数:4 相关作者: 崔中利 曹慧 李顺鹏 孙波 黄婷婷 更多>> 相关机构: 南京农业大学 中国科学院 南京理工大学 更多>> 发文基金: 中国博士后科学基金 国家自然科学基金 中国科学院知识创新工程 更多>> 相关领域: 农业科学 生物学 更多>>
不同有机肥施用量对红壤固氮基因(nifH)多样性的影响 固氮酶基因 nifH 广泛存在于固氮微生物体中,是研究固氮微生物群落结构的良好标记。采用 PCR-RFLP 的未培养方法, 扩增固氮微生物中固氮酶的保守基因 nifH,以酶切分型与基因序列测定揭示不同有机肥施用量对固氮微... 滕齐辉 曹慧 孙波 李顺鹏 崔中利关键词:生物固氮 有机肥 文献传递 一种土壤微生物总DNA的高效提取方法 被引量:37 2004年 获得高浓度、大片段、多样性程度高的土壤微生物总DNA 是研究土壤微生物群落结构的分子生态学基础。本文采用间接法(菌体细胞回收法)提取红壤地区两种土壤类型的土壤微生物总DNA,定量计算其回收率,并与直接法(细胞原位裂解法)比较了提取效率和纯度。结果表明:红壤地区2种土壤每克干土的总DNA提取量,间接法约为0.34和0.53礸/g干土,直接法约为13.62和24.32礸/g干土;间接法的提取效率低于直接法,但所得DNA片段较大,且Sau 3AⅠ 酶切和16 S rDNA通用引物PCR扩增结果显示,间接法比直接法更能有效地去除土壤中的某些抑制剂,所得总DNA的纯度更高,有利于后续操作。 黄婷婷 曹慧 王兴祥 崔中利关键词:土壤微生物 总DNA提取 江西典型红壤区土壤细菌基因组文库构建及功能初步分析 被引量:4 2006年 黄婷婷 崔中利 张璐 曹慧 李顺鹏关键词:红壤 DNA提取 基因组文库 太湖地区典型菜地土壤微生物16S rDNA的PCR-RFLP分析 被引量:64 2006年 土壤微生物多样性是土壤生态功能的基础,但长期以来缺乏对高强度土地利用条件下的土壤微生物多样性的认识。作者采用间接法提取了江苏省太湖地区典型菜地土壤微生物的总DNA,以细菌的通用引物27F和1492R扩增16SrDNA片段,将扩增产物与T-载体酶连,转化大肠杆菌,建立土壤微生物16SrDNA克隆文库。PCR扩增基因文库中插入的16SrDNA外源片段,用两种限制性内切酶HhaI和RsaI分别酶切,获得该土壤173个克隆的酶切指纹图谱。结果表明,HhaI和RsaI联合酶切产生了63个基因分型,文库的覆盖度达76.30%,单一酶切产生的基因分型少,但文库的覆盖度高;克隆文库中存在两种优势类群,分别占总克隆的16%和12%。16SrDNA测序结果表明,太湖地区菜地土壤细菌在分类方面主要属于-和-变形杆菌亚门。以上结果为进一步研究太湖地区菜地土壤微生物生态功能提供了基础资料。 滕齐辉 曹慧 崔中利 王英 孙波 郝红涛 李顺鹏关键词:土壤细菌多样性 RFLP分析 淹水和旱作水稻土中细菌群落多样性的空间分布 本文采用 ARDRA(amplified ribosomal DNA restriction analysis)的方法对不同耕作条件下的水稻土壤中的细菌多样性及其在0-5、5-10、10-15cm 土层的空间分布进行了研... 王英 滕齐辉 曹慧 胡锋 崔中利关键词:水分 ARDRA 水稻土 文献传递 红壤荒草地氨氧化细菌富集液16S rDNA文库的RFLP分析 被引量:13 2006年 分析红壤荒草地富集液中氨氧化细菌的种群组成,选取氨氧化细菌16S rDNA特异性引物序列,利用PCR技术对从富集液中抽提的细菌总DNA进行扩增,并建立了氨氧化细菌特异性的16S rDNA文库。用酶HhaⅠ和RsaⅠ对该文库特异性片段进行了限制性酶切片断长度多态性分析(Restriction fragment lengthpolymorphism,RFLP),随机挑选的35个特异性克隆片段被分成3个不同的RFLP类型,其中优势型占了所有分析克隆子的94%,另两个型各占3%。从每个RFLP类型中挑取一定的转化子进行测序,测序结果经GenBank检索,发现在该富集液体系文库中存在大量亚硝化单胞菌属(Nitrosomonas)细菌序列,由此推测红壤荒草地中存在氨氧化细菌,Nitrosomonas属细菌能在富集条件下成为优势菌。 张丽娜 曹慧 崔中利 孙波 李大力 李顺鹏关键词:氨氧化细菌 RFLP 红壤 生物表面活性剂生物合成的研究进展 被引量:10 2005年 生物表面活性剂是由微生物产生的具有高表面活性的生物分子,相对于化学合成的表面活性剂,生物表面活性剂对生态系统的毒性较低,且可生物降解。因此,其在工业生产上有潜在的广泛应用价值,人们关于其合成方面的研究逐年增多。但是,由于其是次生代谢产物,传统方法主要是进行高效菌株的筛选,以及研究不同发酵条件对其产量的影响。近年来,由于基因工程技术的广泛应用,分子生物学、遗传学和酶学等方面的方法被人们运用于生物表面活性剂合成过程的研究,人们了解了催化生物表面活性剂合成的各种关键酶、调控基因的操纵元结构、合成中底物变化的过程等,从而对其生物合成的过程有了更进一步了解。 崔中利 刘卫东 曹慧 骆永明 赵其国关键词:生物表面活性剂 生物合成 基因 生物分子 生态系统 淹水和旱作稻田土壤中产甲烷菌的多样性分异 据估计,每年大约有5×1014g 甲烷气体释放到大气中。现在大气中甲烷气体的浓度为1.7ppm,并且每年以1%的速度在增长。甲烷,尽管在大气中的浓度比较低,但甲烷是一种比 CO2更有效的温室气体,其温室效应是 CO2的2... 崔中利 王英 滕齐辉 张斌 曹慧文献传递