国家自然科学基金(31201767)
- 作品数：9 被引量：43H指数：5
- 相关作者：任守文付言峰李碧侠李兰方晓敏更多>>
- 相关机构：江苏省农业科学院中国农业大学国家兽用生物制品工程技术研究中心更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金江苏省农业科技自主创新基金江苏省科技支撑计划项目更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- 瘦素受体对苏钟猪脂肪沉积调控的影响被引量：5
- 2015年
- [目的]研究瘦素受体(leptin receptor,LEPR)的mRNA表达和编码序列单核苷酸多态性(c SNPs)对猪脂肪沉积性状的影响。[方法]本文旨在利用实时荧光定量PCR(RT-q PCR)方法和免疫印迹方法检测了该基因在高脂猪和低脂猪背最长肌、背膘、心、肝和肾共5种组织样中的mRNA和蛋白表达量,利用直接测序方法检测了LEPR第18外显子c SNPs,并对LEPR表达量、编码序列单核苷酸多态位点与苏钟猪脂肪沉积相关性状进行了关联分析。[结果]RT-q PCR结果表明:LEPR mRNA在这5种组织中均有表达,且差异显著(P<0.05),其中背膘组织中的表达量显著高于其他组织(P<0.05),其次为背最长肌中的表达量,高脂猪的mRNA表达量显著高于低脂猪(P<0.05)。Western blot结果表明,LEPR蛋白在背膘和背最长肌中显著表达,且高脂猪的蛋白表达量显著高于低脂猪(P<0.05),说明猪脂肪沉积量越高,LEPR mRNA和蛋白表达量越高。PCR-sequencing结果表明,在LEPR c DNA的c.2841C>T位点处,T等位基因为脂肪沉积的优势等位基因。[结论]LEPR的表达对苏钟猪脂肪沉积调控有显著影响,其c.2841C>T位点可作为苏钟猪脂肪沉积肉质性状改良育种的分子标记。
- 付言峰李兰周艳红李碧侠方晓敏王学敏任守文
- 关键词：瘦素受体脂肪沉积苏钟猪
- 梅山猪胚胎附植期EphA1基因表达及甲基化检测被引量：2
- 2014年
- 旨在研究促红细胞生成素产生肝细胞受体A1(EphA1)在某些哺乳动物胚胎发育期的细胞间侵入和黏附活动中发挥一定作用以及EphA1基因甲基化对胚胎附植期其表达的影响。本研究以梅山猪为研究对象,采用实时荧光定量PCR、Western blot和亚硫酸氢盐测序法,分析了EphA1基因的mRNA表达、蛋白表达和CpG岛甲基化。结果表明,在梅山猪胚胎附植前期(13d)、中期(18d)、后期(24d)的子宫内膜附植点,EphA1的mRNA表达趋势为先升高后降低(P<0.05),蛋白表达趋势为逐渐降低,且妊娠猪的表达量均显著高于空怀猪(P<0.05)。附植前期的EphA1甲基化程度最高,中期的次之,后期的最小,即EphA1甲基化趋势与蛋白表达趋势一致。综上表明,EphA1的CpG岛甲基化很可能影响了基因的表达,进一步影响了猪胚胎附植的调控。
- 付言峰李兰周艳红李碧侠赵为民赵芳任守文
- 关键词：甲基化表观遗传学胚胎附植
- 猪胚胎附植期Eph B6和FTO基因的表达规律研究
- (目的)猪产仔数是一个重要的育种性状和经济性状,提高产仔数的关键是提高胚胎成活率。因为影响胚胎成活率的重要时期有3个,而3个重要时期中有2个发生于猪的胚胎附植期（妊娠13-24 d）,所以如何减少猪胚胎附植期的胚胎死亡便...
- 付言峰李兰赵为民周李生李碧侠方晓敏王学敏任守文
- 关键词：胚胎附植FTO
- 文献传递
- 转录组测序分析猪胚胎附植的中期和后期卵巢差异表达基因被引量：7
- 2018年
- 胚胎附植是影响母猪产仔数的一个重要因素,本研究旨在找到猪胚胎附植的关键调控基因。选用5~7胎次梅山猪母猪4头,在其妊娠第18和24天分别屠宰2头,采集其卵巢组织进行转录组测序(RNA-seq)分析,GO功能富集分析及Pathway分析。结果表明:1)猪胚胎附植中期卵巢(卵_18d)和后期卵巢(卵_24d)两个组织样检测到的表达基因中最多的序列(reads)均为外显子序列;卵_18d测得reads最多的染色体依次为6、14、1和7号,卵_24d依次为1、7、14和M号;卵_24d相较于卵_18d有更多的基因表达,且表达量更高;两个时期卵巢组织中表达量前50位的基因中,线粒体基因占60%以上。2)卵_24d相较于卵_18d,有581个基因上调和103个基因下调,其中二者之间表达差异最大的基因为EN19684,位于线粒体中;表达差异最大的染色体基因为EN11278,位于14号染色体中。3)差异表达基因显著富集于内皮细胞活化等38个生物学过程,宿主细胞质等19个细胞学分区和FAD-AMP裂解酶活性等16个分子功能;差异表达基因在185条生物通路上存在差异,其中前3位极显著差异的生物通路依次为PI3K-Akt信号通路、Hippo信号通路和昼夜周期。综上表明,在卵巢组织表达的基因,重点参与了胚胎附植后期的调控,且高表达量基因多集中在细胞线粒体中,差异表达基因功能以内皮细胞活化为主,生物通路以PI3K-Akt信号通路为主。
- 付言峰李兰赵为民方晓敏李碧侠王学敏周李生任守文
- 关键词：胚胎附植转录组测序基因
- 苏钟猪FTO基因的mRNA表达、克隆测序及其生物信息学分析被引量：13
- 2013年
- 脂肪肥胖相关基因(FTO)在控制食欲和能量消耗方面具有重要作用。为进一步了解猪FTO基因的结构和功能,以苏钟猪为试验对象,利用RT-PCR方法,分析该基因在苏钟猪5种不同组织(肺脏、肝脏、心脏、背膘和背最长肌)RNA水平的表达谱信息;对苏钟猪FTO基因的编码序列(CDS)进行了克隆测序,并用生物信息学方法分析了苏钟猪FTO蛋白的结构和不同物种间的同源性。结果表明,FTO基因在苏钟猪各组织中的mRNA表达丰度表现为:背膘>心脏>肺脏>肝脏>背最长肌,其中背膘中的表达量显著高于其他组织(P<0.05)。苏钟猪FTO的CDS区发现了8个SNPs,分别为G52A、C523T、G628A、A655G、A810G、A886G、G1002A和A1344G。苏钟猪FTO基因编码一个含505个氨基酸的蛋白,理论等电点为5.23,具有亲水性,不存在信号肽,是非分泌型蛋白,与牛、绵羊、狗等物种的亲缘关系最近。FTO的mRNA表达对苏钟猪的皮下脂肪、心脏、肌肉等组织的脂肪沉积有一定影响,其编码序列中丰富的SNPs可成为苏钟猪肉质改良育种中的重要分子标记。
- 付言峰李兰王学敏李碧侠方晓敏赵芳任守文
- 关键词：苏钟猪克隆测序生物信息学
- 猪脂肪沉积和胚胎附植期FTO基因的表达及碱基突变检测被引量：3
- 2018年
- 为了研究脂肪肥胖相关基因(FTO)对猪脂肪沉积和胚胎附植的影响,本研究以太湖流域10头苏山猪和3头梅山猪母猪为试验对象,利用Real-time q PCR方法分析了该基因在脂肪沉积过程中苏山猪不同组织样和胚胎附植过程中梅山猪各组织样中的mRNA的表达,并用克隆测序方法检测了苏山猪群中FTO编码序列上的遗传变异。结果表明,脂肪沉积过程中,苏山猪16种组织样中均检测到FTO的mRNA表达,且背膘中的表达量极显著高于其他任何组织(P<0.01),高脂猪背最长肌中的FTO表达量显著高于低脂猪(P<0.05)。胚胎附植时期,梅山猪15种组织样中均检测到FTO的mRNA表达,且繁殖组织中的表达量显著高于其他组织(下丘脑除外)(P<0.05),表达量前2位组织样依次为:子宫、胚胎。苏山猪FTO编码序列(15~1 532 bp)上共发现10个c SNPs突变,其中有8个直接引起了编码氨基酸的变化。综上所述,FTO作用广泛,很可能在猪脂肪沉积和胚胎附植过程中发挥着重要的作用,其c SNPs可成为潜在的猪肉质性状和繁殖性状育种的分子标记。
- 付言峰李兰Robert V.Knox李碧侠方晓敏任守文
- 关键词：FTO脂肪沉积胚胎附植
- EphB6,LEPR-LEP基因转录组水平对猪胚胎附植调控的影响
- (引言)猪胚胎附植期(第13-24 d)的胚胎不良发育乃至死亡是导致其初生体重低和产仔数降低的一个重要因素,有研究表明EphB6,Leptin receptor (LEPR)和Leptin (LEP)等细胞因子在某些哺乳...
- 付言峰Robert V.Knox李兰任守文
- 关键词：胚胎附植
- 文献传递
- 胚胎附植期梅山猪EphrinA1全编码区克隆及生物信息学分析被引量：5
- 2015年
- 为了研究促红细胞生成素产生肝细胞配体A1(Ephrin A1)对梅山猪胚胎附植期胚胎在子宫内膜间迁移和对子宫内膜黏附活动的影响,利用克隆测序、生物信息学和qRT-PCR方法,克隆了Ephrin A1基因的全长编码序列,对其表达的蛋白结构和功能进行了预测,并检测了其mRNA表达变化。梅山猪Ephrin A1基因编码区有5个c SNPs变异,其中2个导致氨基酸突变,分别为Glu29Asn和Trp33Arg,位于Ephrin A1外显子1和外显子2上。Ephrin A1编码序列中含5个外显子,编码205个氨基酸。Ephrin A1为不稳定的亲水性蛋白,有1个信号肽和一个保守区域,无跨膜区。另外,Ephrin A1在梅山猪胚胎附植期有较强的mRNA表达。表明Ephrin A1基因可能参与梅山猪的胚胎附植调控,其c SNPs有望成为影响猪产仔数基因的潜在分子标记。
- 周艳红付言峰赵为民刘红林任守文
- 关键词：梅山猪胚胎附植EPHRINA1生物信息学
- 基于Eph A4和Ephrin B2基因SNPs标记的7个猪种群体遗传多样性分析
- 用3个SNPs标记对长白、大白、杜洛克、二花脸、苏钟、梅山和金华共7个品种616头母猪进行了分析。结果表明:7个品种猪群在3个位点上大都符合Hardy-Weinberg平衡。各种群SNPs的多态性信息含量PIC为0.49...
- 付言峰王爱国李兰赵芳傅金銮孟翠郅西柱任守文
- 梅山猪胚胎附植期EphB2的组织表达及RNA-seq分析被引量：4
- 2014年
- 猪产仔数是一个重要的经济和繁殖性状,而胚胎附植是影响猪产仔数的重要因素。为了研究促红细胞生成素产生肝细胞受体B2(Eph B2)对猪胚胎附植过程中子宫内膜迁移和粘附活动的影响,文章以太湖流域梅山猪为研究对象,利用实时荧光定量PCR(q RT-PCR)和蛋白免疫印迹(Western blot)方法,检测Eph B2基因在梅山猪胚胎附植前、中、后期子宫内膜附植点/非附植点和卵巢组织的m RNA和蛋白表达谱,并用转录组测序(RNA-seq)方法分析了不同附植时期子宫内膜附植点和卵巢组织的差异表达基因。q RT-PCR和Western blot结果表明,Eph B2在胚胎附植前、中、后期子宫内膜附植点和非附植点的m RNA和蛋白均呈现先升高后降低的表达趋势,且附植中期的表达量显著高于前期和后期(P<0.01);Eph B2在附植前、中、后期卵巢中的m RNA和蛋白表达趋势则相反,为先降低后升高,且不同时期间表达差异显著(P<0.05)。RNA-seq结果表明,Eph B2在子宫内膜附植点的m RNA表达,附植中期极显著高于附植前期(P<0.01);Eph B2在卵巢的m RNA表达,附植中期显著高于附植后期(P<0.05)。综上所述,Eph B2很可能在猪胚胎附植过程中发挥着重要的调控作用,为潜在的猪产仔数性状候选基因。
- 付言峰周艳红王爱国李兰刘红林李碧侠任守文
- 关键词：EPHB2胚胎附植转录组测序梅山猪
