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Detecting cancer cell-surface glycome profilings by lectin microarray: 2009年; Objective: Glycomics is an emerging field in the postgenome and postproteome era. Glycosylation changes of cell-surface have been observed in tumour cell progression; Chun-Hui Li 1, Qun He 1, Yu-Jie Zhao1 1 Biochip Center, Key Laboratory of Cell Biology, Ministry of Public Health of China, China Medical University, Shenyang 110001, China 2 Department of Pathology, The First Affiliated Hospital and College of Basic Medical Sciences, China Medical University, Shenyang 110001, China; 关键词：LECTIN MICROARRAY GLYCOME BIOMARKER

转录因子HSF4的生物信息学分析被引量：2: 2016年; 热休克转录因子4（heat shock transcription factor 4,HSF4）是热休克转录因子HSF家族成员,近年发现HSF4除发挥调控热休克蛋白（heat shock protein,HSP）表达的功能外,亦直接或间接调节许多非热休克基因的表达,参与细胞生长发育及多种生理病理过程。现对9个物种的HSF4蛋白序列进行了多序列对比、进化痕迹分析和蛋白质特定功能区域分析,发现两个保守区域：一个是75-119保守区域,其部分位于文献报道的HSF家族的DNA结合区域,该区域呈现锤子状颈环结构,中部富含亲水氨基酸,提示该颈环结构有嵌入DNA结构内部解开其双链结构起转录调控的作用;另一保守区域在176-230,呈现卷曲螺旋（coil）结构,可能跟HSF4与DNA识别、结合、固定功能相关。对HSF4的生物信息学分析可以为其功能研究奠定理论基础。; 马汝海钟连声王天骄潘忠诚赵雨杰王绍成何群; 关键词：生物信息学分析转录调控

小鼠肝癌与肝正常细胞系ST3Gal和ST6Gal家族mRNA表达差异研究被引量：2: 2011年; 探讨肝癌细胞系Hepa1-6与肝正常细胞系BNL CL.2唾液酸糖基转移酶ST3Gal和ST6Gal家族mRNA表达的差异以及与细胞膜唾液酸含量的关系,采用RT-PCR方法检测ST3Gal唾液酸转移酶家族6个成员以及ST6Gal唾液酸转移酶家族2个成员mRNA表达差异,用凝集素芯片检测细胞膜表面唾液酸表达情况,结果显示:与正常细胞系BNL CL.2相比,hepa1-6细胞内唾液酸转移酶ST3GalⅠ、ST3GalⅣ、ST3GalⅥ呈现高表达,ST3GalⅤ低表达,ST3GalⅡ、ST3GalⅢ表达无显著性差异,两细胞系内均为检测出ST6GalⅠ表达,ST6GalⅡ表达无显著差异;hepa1-6细胞膜α2-3和α2-6连接唾液酸含量均显著增加;提示ST3GalⅠ、ST3GalⅣ、ST3GalⅤ、ST3GalⅥ可能与肝癌发生过程相关,ST3GalⅠ、ST3GalⅣ、ST3GalⅥ可能与肝癌细胞膜α2-3唾液酸含量增加相关,ST6Gal家族对细胞膜α2-6连接唾液酸含量增加无贡献.; 马汝海王冬青潘忠诚王天骄何群赵雨杰; 关键词：肝癌细胞膜糖基化

应用凝集素芯片分析癌细胞膜表面糖链表达被引量：4: 2010年; 细胞膜表面糖复合物的糖链结构与肿瘤细胞增殖、侵染、转移等发展过程密切相关.凝集素芯片技术的出现实现了对癌症的糖组进行快速、高通量的检测.通过模式细胞系PANC-1证明了构建的凝集素芯片体系的准确性、重复性、特异性,应用这一芯片体系初步检测了几种癌细胞系(HT-29、SGC-7901、BEL-7402、H460)的膜表面糖链表达.这几种癌细胞系表面都有唾液酸、乙酰葡萄糖/葡萄糖、乙酰半乳糖/半乳糖、甘露糖等糖链.根据实验结果,推测它们的细胞膜表面α1-6岩藻糖链表达水平可能较高,而α1-3岩藻糖链表达水平较低;这些聚糖可能是癌症潜在的标志物.凝集素芯片有助于推动癌细胞膜表面糖链的快速分析和筛选出癌症相关的糖链标志物.; 李春辉何群马静红潘忠诚王天骄张玉魁赵雨杰

小鼠肝癌及肝正常组织B4GalT糖基转移酶家族mRNA表达差异及其对细胞膜相关糖链的影响: 2012年; 探讨肝癌模型鼠与正常小鼠肝组织B4GalT(β-1,4-半乳糖转移酶)家族mRNA表达差异以及对细胞膜相关糖链的影响.采用RT-PCR方法检测肝癌模型鼠和正常对照小鼠肝癌组织中B4GalT家族7个成员以及唾液酸α-2,3转移酶ST3GalⅢ、ST3GalⅣ、ST3GalⅥ、α-1,6-岩藻糖转移酶FUT8 mRNA表达差异,应用凝集素芯片检测细胞膜表面半乳糖、岩藻糖、唾液酸表达情况.结果显示:与正常对照组相比,肝癌模型鼠肝组织中B4GalT-1和B4GalT-3、ST3GalⅣ和ST3GalⅥ、FUT8呈现高表达,肝癌细胞膜半乳糖、岩藻糖、唾液酸类型糖链增加,提示B4GalT-1和B4GalT-3与肝癌细胞膜半乳糖链增加相关.由于细胞Galβ-1,4-GlcNAc糖表位在ST3GalⅢ、ST3GalⅣ或ST3GalⅥ催化下与唾液酸α-2,3连接生成s-lewis x抗原前体,本实验中B4GalT-1和B4GalT-3与ST3GalⅣ、ST3GalⅤ、FUT8 mRNA表达具有相关性,提示B4GalT-1和B4GalT-3可能与ST3GalⅣ、ST3GalⅥ以及FUT4协同作用,导致肝癌细胞膜半乳糖、岩藻糖、唾液酸类型糖链增加.; 马汝海王冬青潘忠诚王天骄何群赵雨杰; 关键词：肝癌细胞膜糖基化

α-2，3-唾液酸糖基转移酶ST3家族分子序列生物信息学分析被引量：1: 2011年; 目的比较探讨人类α-2,3-唾液酸糖基转移酶家族成员间的同源性,探讨其进化规律及其与功能相关性。方法利用网上数据库和生物信息学软件对核酸及蛋白质序列进行同源比较、结构域分析和进化树绘制。结果人类α-2,3-唾液酸糖基转移酶家族一级结构、二级结构均有较高的同源性,系统进化分析显示其各成员来源于同一祖先并在不同时期分野。结论各成员来自于同一祖先的同一家族,其进化方式属于趋异性进化,家族中各亚型底物特异性可能与其糖基化位点相关。; 马汝海钟连生潘忠诚王天骄何群; 关键词：同源性分析结构域系统进化树

小鼠肝腹水细胞膜表面糖表达谱: 2010年; 目的探讨肝癌腹水细胞膜表面糖链表达谱。方法用H22细胞制备肝腹水模型鼠,36只小鼠随机分为正常组(6只)和肝腹水组(20只),注射10d后抽取腹水提取癌细胞用吖啶橙荧光标记,应用凝集素芯片检测细胞膜表面糖表达谱。结果肝癌腹水细胞膜表面有大量唾液酸、乙酰葡萄糖、乙酰半乳糖、甘露糖和半乳糖糖链表达,正常小鼠肝组织中只有多聚乳糖胺类型糖链表达。结论肝癌发生过程中伴随着细胞膜糖链类型和数量增加,唾液酸、乙酰葡萄糖、乙酰半乳糖、甘露糖和半乳糖糖链表达增加与肝癌变发生发展紧密相关。; 马汝海何群赵雨杰潘忠诚; 关键词：肝癌糖基化细胞膜

细胞膜表面糖识别芯片的制备及其初步应用被引量：9: 2008年; 目的制备可以对细胞膜表面糖链进行识别的凝集素芯片并进行初步应用。方法在芯片上制备 22 种凝集素点阵,提取组织和体液细胞进行荧光标记,利用凝集素与细胞膜表面糖链特异亲和性对细胞进行自动捕获,激光扫描仪和光镜检测。结果根据芯片上各个凝集素位点捕获细胞情况和该点凝集素的特异性获得细胞膜表面糖谱,并在光镜下对细胞数量形态进行观察。芯片的重复性和稳定性较好。结论该凝集素芯片可以对细胞进行自动捕获,对细胞膜表面糖链进行总体、即时的观察,对细胞膜糖链特征有一个总体的认识,建立各种细胞膜表面糖谱,为细胞膜表面糖链特征检测提供一个新的分析方法。; 何群宋春阳张艳潘忠诚王天骄房凯张玉魁赵雨杰; 关键词：凝集素糖组学细胞膜

应用凝集素芯片检测细胞膜表面糖链种属特异性: 2011年; 目的应用凝集素芯片检测小鼠和兔不同组织细胞膜表面的糖链类型,探求不同物种间相同组织细胞膜表面糖复合物在种群免疫和细胞功能中的作用。方法选择22种凝集素,利用生物芯片点样仪制备芯片,选用牛血清白蛋白(BSA)为阴性质控,马铃薯凝集素(STL)为阳性质控。分别用胶原酶Ⅰ、Ⅱ、Ⅳ消化小鼠和兔的肾、脾、肝组织,制备细胞悬液,并加入吖啶橙荧光标记细胞。将细胞悬液分别滴加至凝集素芯片中,利用凝集素与糖链的特异亲和性捕获细胞,激光扫描仪检测芯片中各凝集素位点的荧光信号强度,行常规HE染色后于荧光显微镜下观察各凝集素位点所捕获的细胞形态,并分析不同胶原酶消化对检测结果的影响。结果小鼠和兔相同组织的细胞膜表面糖链类型基本相同,仅个别位点略有不同。在GNA、LTL、HHL、NPL位点,兔脾细胞均为阴性,小鼠脾细胞均为阳性。在BPL、WFA位点,兔肾细胞均为阴性,小鼠肾细胞均为阳性;在MAL-I位点,兔肾细胞为阳性,小鼠肾细胞为阴性。MPL、WBA、LTL、SBA、BPL、WFA、MAL-I、AAL、BCL位点,兔肝细胞均为阳性,小鼠肝细胞均为阴性;在NPL位点,小鼠肝细胞为阳性,兔肝细胞为阴性。DSL、STL位点,小鼠和兔各组织细胞检测结果均为阳性;在EEL、DBA位点,小鼠和兔各组织细胞检测结果均为阴性。在GNA位点,兔脾组织经胶原酶Ⅱ消化后可见极少量细胞,经其他2种胶原酶消化后则未见捕获细胞。兔肾组织以及小鼠的脾和肾组织经3种胶原酶消化后,检测结果无明显差异。在BCL位点,兔肝组织经胶原酶IV消化后捕获细胞最多,其次为胶原酶Ⅱ,胶原酶Ⅰ最少。结论通过制备的凝集素芯片成功检测了小鼠和兔不同组织细胞膜表面的糖链特异性。小鼠和兔相同组织的细胞膜表面具有相同类型糖链,但不同组织之间细胞膜糖链类型也存在其特异性,这可能与组织分化及其; 马汝海王天骄潘忠诚何群; 关键词：细胞膜凝集素类

应用凝集素芯片检测肝癌细胞膜表面糖链变化被引量：10: 2010年; 利用凝集素糖链特异亲和原理构建对细胞膜表面糖链进行即时检测的凝集素芯片体系,检测肝癌发生过程中细胞膜糖链的变化.从H22细胞系、正常小鼠和肝癌模型鼠肝组织中提取细胞进行荧光标记,激光扫描仪检测凝集素位点捕获的细胞,根据凝集素特异亲和性确定细胞膜表面糖表达谱,显微镜下观察捕获细胞的形态.对凝集素芯片捕获细胞的最佳条件进行探讨,用甘露糖抑制试验、流式细胞仪和不同血型红细胞验证了凝集素捕获细胞的特异性.结果显示:正常和肝癌小鼠肝细胞膜表面糖链存在较大差异,正常组只有PSA、DSL、STL、NPL凝集素位点捕获到细胞,实验组只有LTL和DBA位点没有捕获到细胞,提示小鼠肝癌组织细胞膜表面糖链显著增加,细胞膜上唾液酸、乙酰葡萄糖、乙酰半乳糖、甘露糖和半乳糖糖链表达增加,这些糖链及其相关糖蛋白可能在肝癌的发生和发展中起一定作用.该凝集素芯片有较好的稳定性和特异性,可以对细胞膜表面糖链进行动态、即时、通量的检测,为研究细胞膜表面聚糖在细胞发育和癌变等过程中的变化提供了一个技术平台.; 何群李春辉潘忠诚王天骄张玉魁钟连声王绍成赵雨杰; 关键词：肝癌糖基化

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国家自然科学基金(20672144)

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