天津市高等学校科技发展基金计划项目(2004BA31)
- 作品数:6 被引量:27H指数:4
- 相关作者:王晓梅王茜戴伟胡鹏飞靳婷婷更多>>
- 相关机构:天津农学院东北农业大学大连水产学院更多>>
- 发文基金:天津市高等学校科技发展基金计划项目天津市科技发展战略研究计划项目天津市应用基础与前沿技术研究计划更多>>
- 相关领域:生物学农业科学更多>>
- 中华绒螯蟹与合浦绒螯蟹线粒体细胞色素b基因片段的DGGE分析(英文)被引量:2
- 2011年
- [目的]探讨利用DGGE技术对中华绒螯蟹和合浦绒螯蟹遗传多样性进行分析的可能性。[方法]对中华绒螯蟹5个群体和合浦绒螯蟹1个群体共180个个体的线粒体细胞色素b(cytb)基因片段进行了PCR扩增和变性梯度凝胶电泳(DGGE)分析。[结果]所有PCR产物在DGGE电泳时共有2种迁移速率,合浦绒螯蟹所有个体的PCR产物的迁移速率相同,且中华绒螯蟹江都群体46.7%、仪征群体23.3%以及温州群体20.0%的个体与合浦绒螯蟹的迁移速率一致;而以上3个中华绒螯蟹群体的其他个体以及南京、盘锦群体所有个体的PCR产物在DGGE电泳时的迁移速率均相同,均快于合浦绒螯蟹,表明在中华绒螯蟹中混杂有合浦绒螯蟹的遗传标记类型。[结论]DGGE方法可用于绒螯蟹的遗传多样性分析。
- 王晓梅李晓东王茜靳婷婷
- 关键词:中华绒螯蟹合浦绒螯蟹DGGE
- 不同水系中华绒螯蟹线粒体COⅠ基因片段的RFLP分析被引量:4
- 2007年
- 应用PCR-RFLP技术分析了长江、瓯江和辽河3个水系中华绒螯蟹的线粒体COⅠ的基因片段遗传多样性,应用11种限制性内切酶对COⅠ基因片段进行限制性片段长度多态分析,共检测出6种复合单倍型,其中瓯江群体检测出5种复合单倍型,长江和辽河均有2种复合单倍型。经数理统计分析,3个群体内线粒体DNA的核苷酸多样性指数分别为0.006 7(长江)、0.016 7(瓯江)和0.000 3(辽河),瓯江群体的遗传多态度最高,其次为长江群体,而辽河群体在3个群体中遗传多态度最低。结果说明,中华绒螯蟹具有一定群体内遗传多样性:瓯江群体>长江群体>辽河群体。在群体间,辽河与瓯江群体的净遗传距离最大为0.023 7,长江与瓯江群体间的净遗传距离次之为0.020 7,而长江与辽河群体间的净遗传距离最小为0.004 3,说明3个种群中长江与瓯江种群间的亲缘关系最近,而辽河与瓯江种群间的亲缘关系最远。
- 王晓梅邢克智戴伟王茜曹维维李晓东
- 关键词:中华绒螯蟹限制性片段长度多态性
- 绒螯蟹线粒体细胞色素b基因的RFLP分析被引量:7
- 2006年
- 对中国大陆4个水系的8个地理种群绒螯蟹样本的线粒体细胞色素b基因片段进行了PCR扩增,并应用6种限制性内切酶对该PCR产物进行RFLP分析.在应用的6种内切酶中,HinfⅠ,RsaⅠ和Eco RⅤ酶切该PCR片段后,在某些地区绒螯蟹之间表现出限制性片段长度多态性,为多态性的内切酶,但在本研究中尚未发现种群特异的RFLP标记.应用3种多态性的限制性内切酶对8个地理种群的绒鳌蟹个体样本的线粒体细胞色素b基因片段进行RFLP分析,共检测到5种复合限制性酶切类型,即AAA型、BBB型、ABA型、BAB型、ACA型.依据群体间的净遗传距离绘制的UPGMA分子系统树显示,合浦绒螯蟹形成了独立的一支.
- 马成学戴伟王茜李晓东王晓梅
- 关键词:绒螯蟹
- DGGE技术检测中华绒螯蟹线粒体Cytb基因遗传多样性的实验条件探讨被引量:2
- 2008年
- 目前,变性梯度凝胶电泳技术(DGGE)多用于微生物和临床医学检测,而用于水产动物基因片段检测的报道甚少。相关研究显示,针对不同的目的基因,其PCR条件、变性剂浓度梯度和电泳时间是DGGE检测实验成败的关键。因此,为应用DGGE技术分析中华绒螯蟹线粒体Cytb基因片段的遗传多样性,探讨了DGGE技术的关键因子,确定了PCR反应体系和循环参数、电泳时PCR产物的上样量、变性剂浓度范围和电泳的最适时间。
- 靳婷婷王秀利王晓梅
- 关键词:PCRDGGE电泳
- 不同水系绒螯蟹线粒体DNA的遗传差异和群体遗传多样性研究被引量:8
- 2008年
- 对中国大陆6水系10个地区中华绒鳌蟹和合浦绒螯蟹自然群体及1个俄罗斯地区日本绒鳌蟹群体中共289个个体的线粒体细胞色素氧化酶亚基Ⅰ进行了RFLP分析。选用8种能识别4碱基的限制性内切酶AluⅠ,DpnⅡ,HaeⅢ,MspⅠ,MseⅠ,RsaⅠ,TaqⅠ和TasⅠ及3种能识别6碱基的限制性内切酶ApaⅠ,NdeⅠ和VspⅠ对该基因片段酶切后,在11个群体中共检测到15种复合单倍型,其中复合单倍型1为除合浦绒鳌蟹以外的群体所共有,并均以该复合单倍型为主(46.4%~96.7%),复合单倍型4在合浦绒鳌蟹群体中占有很大比例(91.7%);合浦绒螯蟹与中华绒螯蟹北方水系(黄河、海河、辽河)的遗传差异最为明显(Pnet=0.060~0.061);不同水系中华绒螯蟹及合浦绒螯蟹、日本绒螯蟹具有一定的群体内遗传多态性(π=0.0002~0.0167),但并不高。
- 胡鹏飞李晓东戴伟王茜王晓梅
- 关键词:限制性片段长度多态性
- 长江水系中华绒螯蟹线粒体DNA的遗传多样性研究被引量:9
- 2006年
- 本文对长江水系南京和江都地区中华绒螯蟹共61个个体的线粒体COI基因进行了限制性片段长度多态性(RFLP)分析。应用PCR技术扩增了中华绒螯蟹线粒体COI基因,选用8种能识别4碱基的限制性内切酶对该基因片段进行RFLP分析。在两个群体中共检测出8种复合单倍型,其中复合单倍型AAAAAAAA和BBBBBAAB为两个群体所共有,它的个体数所占的百分比在两个群体(南京和江都)中分别为87.9%、12.1%和50.0%、25.0%。在南京群体中,复合单倍型间的遗传距离为0.077,而在江都群体中,复合单倍型间的遗传距离为0.004~0.077;南京和江都群体的线粒体COI基因多态度(或称核苷酸多样性指数)π值分别为0.008和0.019。结果说明长江水系中华绒螯蟹具有一定的群体内遗传多样性。
- 胡鹏飞王茜戴伟王晓梅
- 关键词:中华绒螯蟹线粒体COI基因RFLP