国家科技攻关计划(2005BA711A04) 作品数:9 被引量:28 H指数:4 相关作者: 骆清铭 鲁强 邓勇 张智红 龚辉 更多>> 相关机构: 华中科技大学 中国科学院上海生命科学研究院 上海生物信息技术研究中心 更多>> 发文基金: 国家科技攻关计划 国家自然科学基金 湖北省自然科学基金 更多>> 相关领域: 生物学 理学 机械工程 自动化与计算机技术 更多>>
用基于方位分辨的漫后向散射光确定粒子尺寸分布及相对折射率 被引量:9 2006年 基于偏振门技术,提出了利用漫后向散射光随线偏振光入射方位的变化来测量双层模型表层的粒子尺寸分布及相对折射率。双层物理模型用来模拟上皮组织,上层分别由聚苯乙烯小球或HeLa细胞悬浮液组成,下层由脂肪乳溶液组成,每层的光学特性与上皮组织光学特性匹配。根据米氏(Mie)散射理论,建立了与散射体形态参量相关的偏振后向漫散射强度随入射偏振方位变化的理论模型,并采用浮点遗传算法反演程序获得表层粒子的尺寸分布(PSD)及相对折射率。将理论值和实验测量值进行比较。研究结果表明通过测量随方位变化的后向漫散射光的偏振差分信号,能够获得类上皮组织模型表层的形态结构信息。 邓勇 鲁强 骆清铭关键词:医用光学与生物技术 偏振光 面向恶性肿瘤早期诊断与药物研发的光学分子成像 2009年 随着光学成像技术、光学标记技术和基因组学/蛋白质组学的发展,光学分子成像在生命科学研究领域发挥着越来越重要的作用。 骆清铭 张智红 杨杰 陆锦玲 杨孝全 全国涛 龚辉关键词:肿瘤 药物研发 动态监测 混浊介质中线偏振光和圆偏振光的后向漫散射特征 被引量:2 2007年 以标准的组织模型Intralipid脂肪乳溶液为研究对象,采用CCD偏振成像系统,通过测量该混浊介质的后向漫散射光的斯托克斯矢量,深入研究了不同方位的线偏振光及不同旋向的圆偏振光入射时,后向漫散射光的特征.研究结果表明:对不同的入射偏振态,后向漫散射强度、偏振度的空间分布具有方位选择性,强度和偏振度的大小随距离入射点的距离增加而减小;介质浓度增加,后向散射强度增加,偏振度减小,且同一浓度下,圆偏振光的偏振度总是高于线偏振光. 邓勇 鲁强 骆清铭关键词:混浊介质 基于基因功能的创新药物研究 被引量:4 2005年 朱维良 龚珍 蒋华良 陈凯先关键词:药物研究 基因功能 高新技术产业 医药产业 生物技术领域 锥束微型CT图像重建中射线源位置的修正 被引量:5 2006年 目的:针对利用锥束光X射线机构建的微型CT系统,对射线源的微小偏差进行校准。方法:以FAXITRONMR_20型cone-beam数字X射线机为实验对象,利用金属球模型的二维投影图像计算出射线源垂直投影位于探测板平面相对坐标。对常用的锥束CT滤波逆投影算法,给出了在非标准位置扫描时的锥束CT的修正公式。结果:通过投影测量法发现所使用仪器的射线源和探测器中心存在1.056mm的偏差,并进行了修正;以模型实验显示了修正前后的结果。结论:该方法可以精确测量射线源的相对位置,通过软件修正,重建清晰的CT图像。 方全 方正 仲爱军 骆清铭 龚辉关键词:锥束CT 基于集群的代谢网络计算平台研究 2008年 在生物代谢网络研究中,为提供面向多用户的高性能计算服务,开发了基于Linux计算机集群的代谢网络模拟W eb计算平台。该平台以集群为密集计算后台,以重建心肌细胞能量代谢网络为算例,采用集中式任务调度模型、加权结合轮询法的负载平衡技术以及消息传递接口并行编程模型,实现了对多用户并发任务的处理。通过实例应用和调度监控,验证了该平台在代谢网络模拟中的可用性,以及集群服务器并行处理多任务的有效性。 贾璐 罗若愚 刘谦 李亦学 骆清铭关键词:LINUX集群 并行计算 负载平衡 消息传递接口 多光子激发随机扫描显微成像软件系统仿真 2006年 多光子激发随机扫描显微成像系统将为神经功能成像提供一个有效工具而成为研究热点,但成像软件系统的研制是其难点之一。分析了多光子激发随机扫描显微成像的实验流程,在VC6.0开发平台下,对飞秒激光扫描控制和荧光信号采集,全视场图像重构,感兴趣区域选取,图像和信号曲线动态同步显示等主要功能进行了软件仿真,对开发完整的多光子激发随机扫描显微成像软件系统具有重要的参考价值。 张红民 易秋实 李德荣 骆清铭 曾绍群关键词:显微成像 仿真 面向恶性肿瘤早期诊断与药物研发的光学分子成像 <正>随着光学成像技术、光学标记技术和基因组学/蛋白质组学的发展,光学分子成像在生命科学研究领域发挥着越来越重要的作用。针对恶性肿瘤早期诊断与药物研发的重 骆清铭 张智红 杨杰 陆锦玲 杨孝全 全国涛 龚辉关键词:肿瘤 药物研发 动态监测 文献传递 光动力作用对铜绿假单胞杆菌杀伤效应的研究 被引量:7 2006年 目的:探讨不同的光动力剂量下光动力疗法(photodynam ic therapy,PDT)对体外培养的铜绿假单胞杆菌的杀伤效应。方法:以耐药性较强的铜绿假单胞杆菌(Pseudom onas aeruginos,P.aeruginosa)为研究对象,采用亚甲基蓝(m ethylene b lue,MB)作为光敏剂,用656 nm的激光作为光源(m axoutput=300 mW),对不同系列浓度的MB进行不同剂量的光照,用菌落计数的办法来观测PDT对铜绿假单胞杆菌的杀伤作用;同时利用血培养基检测铜绿假单胞杆菌致病性的改变。结果:在光照剂量相同的情况下,浓度适中(131.7 m ol)的亚甲基蓝溶液能够有效地杀伤铜绿假单胞杆菌,使其致病性降低;而浓度较高(1 317 m ol)或较低(13.17 m ol)的亚甲基蓝溶液对铜绿假单胞杆菌的杀伤作用相对较弱。结论:光动力作用对体外培养的铜绿假单胞杆菌具有明确的杀伤作用,但是其效果和剂量关系密切,所以在治疗过程中必须寻找合适的光敏剂剂量。 周斯博 张智红 Onega V Ulianova Sergey S Ulyanov 骆清铭关键词:光动力疗法 亚甲基蓝 铜绿假单胞杆菌 用遗传算法反演类上皮组织模型的偏振散射光谱 被引量:1 2006年 基于生物组织的粒状模型以及光谱对米氏(Mie)散射体形态的灵敏性,构建了类上皮组织模型的偏振后向散射光谱反演模型。针对反演模型的多参量、多极值、非线性,涉及到非常复杂的三角函数计算,模型空间极小的特点,采用每代保留最优个体的浮点遗传算法对类上皮组织模型的偏振后向散射光谱反演。对编码策略、适值调整策略及选择策略进行了讨论。研究结果表明:经过70代反演迭代,每个参量的相对误差趋于稳定,最小的达到0.02%左右,最大的不超过3%。采用基于实数编码的遗传算法能从偏振散射光谱中同时反演获得表层粒子的形态参量,具有全局收敛性和良好的反演精度与抗噪声能力。 邓勇 鲁强 骆清铭关键词:医用光学与生物技术 遗传算法