中央高校基本科研业务费专项资金(201122005)
- 作品数：3 被引量：15H指数：2
- 相关作者：史晓翀张晓华秦岩高天翔吴福顺更多>>
- 相关机构：中国海洋大学更多>>
- 发文基金：中央高校基本科研业务费专项资金海洋公益性行业科研专项国家高技术研究发展计划更多>>
- 相关领域：农业科学建筑科学天文地球更多>>
- 四种海水样品总基因组DNA提取方法的比较研究被引量：2
- 2013年
- 采用4种不同的方法,分别提取了同一来源的50 mL、200 mL和1 000 mL海水样品的基因组DNA,利用紫外分光光度法测定DNA质量和纯度。研究发现:方法 1(使用PIPES缓冲液)和方法 2(使用TENS缓冲液)所提取的DNA,其OD260/OD280和OD260/OD230很低(不足1.4);方法 3(使用STE缓冲液)及其改进后的方法 4(使用STE缓冲液,但利用机械作用取代酶消化作用来破碎细胞)所提取DNA的两个指标都较高(超过1.6),并且方法 4所得DNA的产率是其他3种方法的1.5～2.4倍。另外,检测方法 3和方法 4所提取DNA的PCR扩增效率,结果表明所提取DNA无需纯化就能进行高效PCR扩增反应。综合以上结果,从DNA浓度、纯度及PCR扩增效率可以看出,方法 4是适合于海水样品多样性研究的一种高效DNA提取方法。
- 尹琦史晓翀董雪富冰冰刘吉文张晓华
- 关键词：微生物基因组DNA提取
- 海洋石油降解菌的筛选鉴定及其功能基因研究被引量：5
- 2014年
- 以石油原油为唯一碳源,从中国海洋大学海洋微生物菌种库15株菌中筛选到5株石油降解菌。16SrRNA基因测序结果表明,WH072、WH069、WH303、ZXM008和ZXM183分别为耐盐芽孢杆菌(Bacillus halodurans)、除烃海杆状菌(Marinobacter hydrocarbonoclasticus)、弯曲芽孢杆菌(B.flexus)、普里兹湾假交替单胞菌(Pseudoalteromonas prydzensis)和嗜麦芽糖寡养单胞菌(Stenotrophomonas maltophilia)。其中对石油降解率最高的为WH072(高达36.4%),其次是WH069(20.0%)。对这5株菌检测已报道的石油烃降解酶基因,结果在WH072和WH069中均检测到了alkB、P450和almA3种功能基因。根据功能基因编码的氨基酸序列构建系统发育树并分析其各自的进化关系,发现P450基因在一定程度上具有种属特异性。对本研究首次报道的高效石油降解菌耐盐芽孢杆菌WH072,采用高效热不对称性交错PCR(hiTAIL-PCR)方法,成功获得了这3种功能基因的全长序列,其中alkB与已知同源基因序列相似性较低,其结构和功能有待进一步研究。
- 吴福顺王龙黄泽瑜史晓翀张晓华
- 关键词：石油降解菌ALKBP450
- 东营近海鲬鱼渔业生物学及资源丰度的季节变化被引量：8
- 2012年
- 基于2010年春、夏、秋3个季节东营近海生物资源与环境调查资料,对东营近海鲬鱼群体渔业生物学特征及资源状况进行研究,同时分析其时空变化规律。结果表明:东营近海鲬鱼群体的优势体长组随着季节变化有所波动,优势体长组从大到小排序为春季>秋季>夏季,但是最大体长个体和最大体重个体均出现在夏季。渔获物中雌性个体数量多于雄性,夏季雌、雄比为1.25∶1,秋季雌、雄比为1.78∶1,性腺成熟度多集中在I期和II期,摄食等级以少量摄食为主,多集中于1级和2级。东营近海鲬鱼资源丰度的季节变化波动较大,且平均渔获率和平均尾数渔获率均处于较低水平,所获鲬鱼个体体长多分布在300mm以下,体重多集中于100g以下,群体呈现小型化趋势。此外,由于时空变化出现了夏季集中,春、秋季分散的规律,笔者推测东营近海鲬鱼群体可能为生殖洄游群体,东营近海存在鲬鱼的产卵场。研究结果为渤海鲬鱼资源可持续利用与保护提供了理论依据。
- 秦岩高天翔
- 关键词：渔业生物学洄游
