国际科技合作与交流专项项目(2007DFA70670)
- 作品数：2 被引量：21H指数：2
- 相关作者：朱平高雷徐振源程家兴唐旭清更多>>
- 相关机构：江南大学安徽大学更多>>
- 发文基金：国际科技合作与交流专项项目国家教育部博士点基金国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：生物学理学自动化与计算机技术更多>>
- 基于归一化距离的结构聚类分析被引量：9
- 2009年
- 在有序粒度空间理论的基础上,提出基于归一化距离的结构聚类(分类)分析理论和方法研究.首先,提出依距离的一致聚类的概念,给出有序粒度空间的结构聚类特征研究.其次,给出基于归一化距离结构聚类分析完整的理论研究,获得基于归一化距离结构聚类的算法.再给出基于粒度空间的最佳聚类问题研究,提出基于粒度空间的、获取最佳聚类的方法,并且这一方法具备全局最优性质.最后,给出基于归一化距离空间的结构聚类的融合技术的研究,即通过两个归一化距离的交运算获取结构聚类融合的研究方法.这些结论为基于距离的结构聚类(分类)提供一整套理论和方法.
- 唐旭清朱平程家兴
- 基于拟氨基酸编码方法的同义密码子的偏好性与结合强度的相关性研究被引量：12
- 2009年
- 计算了基于拟氨基酸编码方法下的同义密码子的相对使用度,分析了78个人类基因(19967个密码子)中基于拟氨基酸编码方法下的同义密码子的偏好使用情况.石秀凡等的研究结果显示了人类基因中基于基因组基因编码方法下,对同义密码子的选择在所有密码子家族中仍都呈现明显一致的偏好.即偏好使用密码子-反密码子结合作用强的密码子,恰好是以c结尾的密码子;且避免使用结合作用中度的密码子.依据结果和数据分析,推测人类基因对密码子的选择除了受基因组结构中isochore和基因签名的影响外,还和密码子-反密码子结合强度密切相关.这些因素共同作用于人类基因,从而在所有密码子家族中都呈现出对同义密码子明显一致的偏好现象.文中则是展示了上述性质在拟氨基酸编码方法下,这些特征不但存在,而且更为明显.
- 朱平高雷徐振源
- 关键词：同义密码子偏好人类基因
