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国家自然科学基金(30972240)

作品数:15 被引量:44H指数:4
相关作者:柴晓杰薛飞张婷丛玉婷张晓琳更多>>
相关机构:大连海洋大学更多>>
发文基金:国家自然科学基金辽宁省教育厅高等学校科学研究项目更多>>
相关领域:生物学农业科学医药卫生更多>>

文献类型

  • 15篇中文期刊文章

领域

  • 11篇生物学
  • 3篇农业科学
  • 1篇医药卫生

主题

  • 10篇盐藻
  • 6篇生物信息
  • 6篇生物信息学
  • 4篇蛋白
  • 4篇杜氏盐藻
  • 4篇生物信息学分...
  • 3篇原核
  • 3篇原核表达
  • 3篇DUNALI...
  • 3篇MAPK
  • 2篇杜氏藻
  • 2篇盐生杜氏藻
  • 2篇荧光
  • 2篇荧光定量
  • 2篇荧光定量PC...
  • 2篇原核表达及纯...
  • 2篇全长CDNA
  • 2篇基因
  • 2篇激酶
  • 2篇核表达

机构

  • 13篇大连海洋大学

作者

  • 13篇柴晓杰
  • 5篇薛飞
  • 5篇张婷
  • 5篇丛玉婷
  • 3篇余祝君
  • 3篇张晓琳
  • 3篇王逸云
  • 2篇韩冬梅
  • 2篇王媛
  • 2篇刘世才
  • 2篇李秀娟
  • 2篇郭卫华
  • 1篇张永攀
  • 1篇徐文琦
  • 1篇赵欢
  • 1篇姜玉声
  • 1篇安康
  • 1篇武天祥
  • 1篇王晓庆
  • 1篇刘丽颖

传媒

  • 4篇中国农学通报
  • 3篇生物技术通报
  • 2篇核农学报
  • 2篇Agricu...
  • 1篇化学学报
  • 1篇水产科学
  • 1篇中国生物化学...
  • 1篇Agricu...

年份

  • 1篇2021
  • 2篇2020
  • 1篇2018
  • 1篇2015
  • 4篇2014
  • 3篇2013
  • 2篇2012
  • 1篇2011
15 条 记 录,以下是 1-10
排序方式:
盐藻丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶基因DsSTPK的克隆、原核表达及纯化被引量:7
2014年
前期研究表明,盐藻丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶DsSTPK在转录水平上的表达受盐胁迫诱导。为了进一步研究该蛋白激酶的生理功能,通过RT-PCR扩增DsSTPK的开放阅读框,并将其克隆至pET32a(+)载体,得到重组表达载体pET32a(+)-DsSTPK。将重组表达载体转化E.coli.BL21(DE3),IPTG诱导表达,然后对融合蛋白进行表达形式分析,利用His60 Ni离子重力柱进行纯化,所得产物进行SDS-PAGE和Western-blot鉴定。本研究成功构建了重组表达载体pET32a(+)-DsSTPK,经IPTG诱导后表达出的融合蛋白的分子量与预期相符;表达形式分析显示该融合蛋白在上清和包涵体中均存在;将上清蛋白纯化后获得了纯度较高的融合蛋白;Western-blot检测显示该融合蛋白能被抗组氨酸抗体特异性识别,具有良好的免疫学活性。DsSTPK的成功表达、纯化,为下一步制备抗体,然后进一步在蛋白质水平上研究其在盐藻耐盐机制中的作用奠定了基础。
陶晓迎柴晓杰薛飞李秀娟丛玉婷
关键词:盐生杜氏藻原核表达纯化
Functional Analysis of Dunaliella salina Calmodulin Kinase Gene
2020年
[Objectives] This study was conducted to investigate the function of Dunaliella salina calmodulin kinase(CaM K) gene.[Methods] The sense and antisense gene fragments(223 bp) and spacer sequence(129 bp) of D.salina calmodulin kinase gene were cloned and inserted into the downstream part of the35 S promoter of the eukaryotic expression vector pM DCMGN-Cat.The siRNA expression system of CaM K gene was successfully constructed.The p CaM K-RNAi expression vector was transformed into D.salina cells by the LiA c/PEG-mediated method,giving transgenic D.salina.The expression of CaM K gene was then analyzed by real-time fluorescence quantitative PCR.[Results]The expression of CaM K gene in the transgenic D.salina was significantly reduced,by 70% compared with the control group,suggesting that the expression of CaM K gene was significantly inhibited.The examination of the growth status of D.salina showed that D.salina cell division and proliferation were also affected.It is proved that CaM K gene has a positive regulation effect on the division and proliferation of D.salina cells.[Conclusions] The study provides important information for further elucidating the function and action mechanism of D.salina calmodulin kinase gene.
Zhenyu XINGMingfang WANGXiangnan GAOWeiwei XUYuting CONGXiaojie CHAI
关键词:DUNALIELLASALINACAMKRNAI
利用免疫共沉淀联合质谱技术筛选盐藻MAPK的互作蛋白被引量:2
2020年
为进一步探究杜氏盐藻促有丝分裂原活化蛋白激酶(DsMAPK)的功能,采用免疫共沉淀联合质谱技术筛选盐藻MAPK的互作蛋白。将pGS21a-MAPK质粒转入大肠杆菌BL21中表达MAPK蛋白并制备多克隆抗体;将培养至对数生长期的盐藻细胞进行盐胁迫处理,然后提取盐藻总蛋白,并进行SDS-PAGE和Western blotting检测;以内源性靶蛋白为诱饵,将细胞总蛋白与MAPK抗体进行共孵育,将经蛋白A/G琼脂糖珠纯化的免疫共沉淀复合物进行质谱检测。结果表明,制备的多克隆抗体特异性良好;筛选出165种特有的差异蛋白。通过GO和KEGG分析发现,这些差异蛋白主要参与了新陈代谢、遗传信息的传递以及信号转导等生物学调控过程。蛋白质互作网络分析发现,直接与MAPK相互作用的蛋白有4种。本研究结果为深入研究杜氏盐藻响应盐胁迫的分子机制提供了参考。
岳金荣丛玉婷邢震宇高相楠王明芳柴晓杰
关键词:杜氏盐藻MAPK质谱技术
盐藻DsMAPKKK基因的克隆与生物信息学分析被引量:1
2014年
为了阐明MAPKs级联反应在盐藻耐盐机制中发挥的作用,需要克隆MAPKs信号转导途径中的成员之一MAPKKK基因并研究其功能。采用RT-PCR与RACE技术从盐藻中首次克隆到一个盐藻MAPKK激酶基因,将其命名为DsMAPKKK(GenBank Accession No.KF366904)并进行了生物信息学分析。结果表明,DsMAPKKK基因的cDNA全长为1460 bp,开放阅读框为879 bp,编码292个氨基酸;该蛋白无信号肽,无跨膜域,是定位于细胞质基质的亲水性不稳定蛋白质;蛋白质序列中包含一个24—45位的蛋白激酶ATP结合区和一个137—149位的丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶活性区;发现了多个潜在的磷酸化位点和一个重要的催化活性位点Asp141;蛋白质二级结构的主要组成元件为α-螺旋和自由卷曲;成功构建了蛋白质三级结构立体模型;系统进化分析表明该蛋白质与团藻、衣藻的相应蛋白进化关系最近。
王逸云柴晓杰韩冬梅刘世才郭卫华
关键词:盐藻全长CDNA生物信息学
Cloning of Ds MAPK Gene and Construction of Antisense Expression Vector
2018年
In order to investigate the role of MAPK gene in adaptation of Dunaliella salina to hypersaline environment, the Ds MAPK gene of D. salina was amplified by PCR. After inverted insertion of the open reading flame ofDs MAPK gene into downstream sequence of 35S promoter of plant expression vector, an antisense expression vector of Ds MAPK gene was successfully constructed and introduced into D. salina cells by LiAc/PEG-mediated method. The expression of Ds MAPK gene in transgenic D. salina was analyzed by semi-quantitative RT-PCR method. The results showed that the expression of Ds MAPK gene in D. salina was significantly inhibited at the transcriptional level. The study laid the foundation for further identification of the function of Ds MAPK gene.
Jinrong YUEYuting CONGXiangnan GAOZhenyu XINGWenjing YUEXiaojie CHAI
盐藻钙调素基因的克隆及表达分析
2021年
为探究盐藻钙调素基因的结构与功能,利用RT-PCR和RACE技术克隆到盐藻钙调素基因(DsCaM,GenBank登录号:MN428415),并对其进行生物信息学分析,通过qRT-PCR方法检测盐藻钙调素在盐胁迫条件下的表达情况。试验结果显示,盐藻钙调素基因cDNA全长1061 bp,开放阅读框495 bp,编码164个氨基酸。盐藻钙调素为亲水蛋白,该蛋白主要分布在细胞质和液泡内,无跨膜区域,不存在信号肽,蛋白质的二级结构以α-螺旋(56.71%)和无规则卷曲(26.22%)为主,成功构建蛋白质三级结构。系统进化分析表明,盐藻钙调素基因与莱茵衣藻钙调素基因亲缘关系最近。qRT-PCR结果表明,在高盐胁迫下盐藻钙调素基因的表达量显著上调,胁迫6 h时表达量达到最高值,差异达到极显著水平(P<0.01)。该研究成果将为进一步分析盐藻钙调素基因的功能及盐藻应答盐胁迫信号的分子途径提供新信息。
王明芳高相楠徐微微丛玉婷柴晓杰
关键词:盐藻钙调素QRT-PCR生物信息学分析
盐藻蛋白质组的研究进展被引量:1
2011年
盐藻是一种公认的能耐受高盐度的海藻,是研究植物高盐适应的模式生物。高通量的蛋白质组学为人们深入探讨盐藻的耐盐机制提供了强有力的工具。就蛋白质组及其主要技术、盐藻蛋白质组的研究概况和研究展望作一简要综述。
张永攀柴晓杰王晓庆徐文琦
关键词:蛋白质组学盐藻双向电泳耐盐机制
盐藻CDPK基因的克隆与生物信息学分析被引量:15
2013年
为了研究CDPK基因的结构和功能,应用RT-PCR和RACE方法从盐藻Dunaliella salina中克隆得到CDPK基因(GenBank登录号为JQ964113),并对其进行生物信息学分析。结果表明:盐藻CDPK基因的cDNA全长3 052bp。5'-UTR长70bp;开放阅读框长1650bp,编码549个氨基酸;3'-UTR长1332bp。蛋白表现为弱酸性,且稳定、亲水,二级结构中以无规则卷曲和α-螺旋为主,三级结构同源建模成功。亚细胞定位于叶绿体和细胞核中,无跨膜结构域,无信号肽。蛋白序列中存在4个丝氨酸磷酸化位点、4个苏氨酸磷酸化位点和3个酪氨酸磷酸化位点,蛋白激酶结构域在53~331位氨基酸处,蛋白激酶ATP结合域在59~82位氨基酸处,丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶活性域在173~185位氨基酸处,4个EF-hand钙结合域分别在357~385、393~421、429~457、465~493位氨基酸处。进化分析结果表明,克隆的CDPK基因与团藻、衣藻、盐藻Dunaliella tertiolecta的CDPK亲缘关系最近。为进一步研究CDPK基因的功能及探究盐藻耐盐机制的信号转导途径奠定了分子基础。
张晓琳柴晓杰张婷余祝君薛飞
关键词:盐藻CDNA全长生物信息学分析
杜氏盐藻MAPKK激酶基因DsMAPKKK的克隆、原核表达与纯化
2015年
为了进一步研究MAPKK激酶的生理功能,利用RT-PCR技术扩增了Ds MAPKKK的开放阅读框序列,并利用T4连接酶与质粒p GS21a连接,构建了原核表达载体p GS21a-Ds MAPKKK。将该重组质粒导入大肠杆菌BL21(DE3)感受态细胞,经IPTG诱导成功表达了融合蛋白。经SDS-PAGE检测,融合蛋白在上清和包涵体中均存在。可溶性蛋白经过GST柱纯化,电泳分析结果表明,在68 k D左右有单一的蛋白条带,说明融合蛋白得到有效纯化。蛋白印迹结果显示在68 k D左右有明显的杂交条带,初步证明纯化的蛋白就是带有GST标签的MAPKK激酶。Ds MAPKKK的成功表达与纯化,为深入探讨Ds MAPKK激酶的性质及功能打下了坚实的基础。
柴晓杰刘艺琼王逸云武天祥刘丽颖
关键词:杜氏盐藻原核表达蛋白印迹
盐生杜氏藻MAPK基因的克隆及表达分析被引量:4
2013年
克隆盐藻MAPK基因(命名为DsMAPK),为研究盐藻耐盐分子机制奠定基础。采用RT-PCR和RACE技术克隆DsMAPKcDNA全长,对其进行生物信息学分析,并通过QRT-PCR方法检测盐胁迫下该基因的表达情况。DsMAPK的cDNA全长序列为1861bp(GenBank AccessionJQ782412),包含一个开放阅读框,长度为1407bp,编码468个氨基酸;DsMAPK蛋白为亲水性蛋白,α-螺旋和自由卷曲是其蛋白质二级结构的主要结构元件,伸展链散布其中。据氨基酸序列同源性分析表明,DsMAPK和衣藻、团藻的MAPK蛋白具有较近的亲缘关系。盐藻在高盐胁迫下,DsMAPK基因表达显著上调,1h后达到最大值,为正常对照组的5倍,差异极显著(P<0.01)。DsMAPK基因可能在盐藻对盐胁迫的反应中起重要作用,是一种参与盐藻耐盐反应的早期快速反应基因。
张婷柴晓杰王媛姜玉声丛玉婷
关键词:盐生杜氏藻CDNA生物信息学荧光定量PCR
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