中国农业科学院兰州兽医研究所所长基金(07-11)
- 作品数：2 被引量：8H指数：1
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- 绵羊痘病毒ORF121基因的序列分析及其B细胞表位预测被引量：1
- 2009年
- 选取GenBank上4株不同绵羊痘毒株ORF121基因序列，采用DNASTAR软件对该基因序列进行同源性分析，并以B细胞表位分析参数及蛋白质二级结构分析数据，综合预测ORF121蛋白B细胞表位。结果表明：4株不同绵羊痘毒株ORF121基因核苷酸序列的同源性为99％；在ORF121蛋白的肽链中，35～46、76～82、160～167区段亲水性强，35～45、54～83、90～124、130～139、144～158和160～167区段柔韧性好，37～45、112～116、129～137和143～167区段抗原指数高，33～45、78～83和159～167区段表面可及性高，30～57和151～170区段可形成一定的空间构象。结果说明ORF121基因在不同的绵羊痘病毒流行株之间非常保守，ORF121蛋白35～45、160～167区段可能是B细胞表位优势区，具有潜在的疫苗或／和诊断价值。
- 陈轶霞乔自林刘俊林王明明陆会宁郑亚东陈智华
- 关键词：绵羊痘病毒B细胞表位
- 绵羊痘病毒甘肃流行株ORF121基因的克隆及序列分析被引量：8
- 2009年
- 从甘肃景泰疑似羊痘绵羊的皮肤组织中提取基因组DNA,PCR扩增糖蛋白ORF121基因。序列分析表明,该基因由519个核苷酸组成,编码172个氨基酸,分子量为19.9 kua,序列中A+T含量占74.95%,G+C含量仅占25.05%。甘肃景泰株ORF121基因同绵羊痘病毒参考株之间的核苷酸同源性高达99%;与疙瘩皮肤病病毒和山羊痘病毒参考株之间的同源性分别为97%和95.6%。结构预测结果显示,ORF121蛋白具有两个N-糖基化位点和一个跨膜区,且具有极强的亲水性。以上结果表明,ORF121蛋白在不同的绵羊痘病毒流行株之间非常保守,具有潜在的疫苗或/和诊断价值。
- 陈轶霞才学鹏郑亚东张冬峰骆学农乔自林
- 关键词：绵羊痘病毒糖蛋白
