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四川省教育厅自然科学科研项目(11ZA294)

作品数：2 被引量：0H指数：0
相关作者：杨丽君袁文彬刘茜文丰玉杨胜勇更多>>
相关机构：西华师范大学四川大学华西医院更多>>
发文基金：四川省教育厅自然科学科研项目西华师范大学科研启动基金更多>>
相关领域：理学更多>>

文献类型

  • 2篇中文期刊文章

领域

  • 2篇理学

主题

  • 2篇激酶
  • 1篇蛋白
  • 1篇蛋白激酶
  • 1篇动力学
  • 1篇豆蔻
  • 1篇肉豆蔻
  • 1篇自由能
  • 1篇位点
  • 1篇构象
  • 1篇IMATIN...
  • 1篇ABL

机构

  • 2篇西华师范大学
  • 1篇四川大学华西...

作者

  • 2篇刘茜
  • 2篇袁文彬
  • 2篇杨丽君
  • 1篇杨胜勇
  • 1篇文丰玉

传媒

  • 1篇物理化学学报
  • 1篇西华师范大学...

年份

  • 1篇2013
  • 1篇2012
共 2 条 记 录，以下是 1-2
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排序方式：
动力学方法研究Imatinib与蛋白激酶的结合构象与结合自由能
2012年
对imatinib两种典型复合物晶体结构imatinib-Abl与imatinib-c-Kit进行比对分析,并利用MM/PBSA方法计算imatinib与Abl、c-Kit、c-Src、p38及Syk等激酶的结合自由能.计算结果表明,imatinib与上述激酶结合时,范德华作用对结合自由能有主要贡献;其中,imatinib与激酶c-Kit结合自由能最低;imatinib与非活性构象激酶的结合自由能明显低于与活性构象激酶的结合自由能.
杨丽君刘茜袁文彬文丰玉
关键词：IMATINIB蛋白激酶动力学
激酶ABL与肉豆蔻酰位点小分子作用机理的分子动力学模拟及自由能计算
2013年
采用分子动力学方法研究激酶ABL与ATP位点小分子imatinib、P16及变构位点小分子STJ、MS7、MS9、3YY、MYR等的结合,并用GBSA(generalized Born surface area)方法将结合自由能分解到各残基.自山能计算结果表明,小分子STJ、MS7、MS9有利于imatinib与ABL结合;小分子STJ、MS7、MS9与激酶ABL的结合自由能接近,绝对值均大于ABL与3YY、MYR的结合自由能.能量分解表明,ABL残基ILE502、VAL506、LEU510与STJ和MYR的相互作用是αl螺旋处于弯曲状态的重要原因.模拟过程中ABL肉豆蔻酰口袋残基均方根偏差(RMSD)变化值表明,STJ等小分子抑制剂与ABL结合后降低了肉豆蔻酰口袋残基的柔性.
杨丽君刘茜袁文彬杨胜勇
关键词：激酶自由能
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