国家科技重大专项(2012ZX10003008002)
- 作品数：8 被引量：42H指数：4
- 相关作者：赵卫国阳幼荣吴雪琼梁艳张俊仙更多>>
- 相关机构：河北北方学院解放军第309医院解放军第307医院更多>>
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- 用DNAStar软件预测Rv1410c结核分枝杆菌蛋白抗原表位被引量：24
- 2015年
- 目的预测Rv1410c结核分枝杆菌（MTB）的抗原表位。方法利用DNAStar软件包中Editseq软件将Rv1410c MTB氨基酸序列进行编辑保存,然后利用Protean软件进行氨基酸序列分析,预测Rv1410c MTB的二级结构、B细胞抗原表位及T细胞抗原表位,然后再用BLAST分析其与人类抗原表位的同源性。结果 Rv1410c具有丰富的二级结构,含有较多潜在的B细胞抗原肽表位,主要位于1~10、67~77、129~137、189~205、222~235、253~267、296~306、330~338、359~367、462~467、494~517氨基酸残基或其附近,这些区域基本上含有β转角结构,亲水性、表面可能性和柔韧性指数都较高;也含有较多潜在的T细胞表位,主要位于16~37、84~102、108~115、137~160、202~207、219~222、245~263、321~325、355~362、387~391、417~445、486~494氨基酸残基或其附近。结论 Rv1410c MTB既含有较多潜在的B细胞抗原表位,也含有较多潜在的T细胞抗原表位。
- 李江英白雪娟梁艳张俊仙阳幼荣赵卫国吴雪琼
- 关键词：抗原表位结核分枝杆菌
- 结核分枝杆菌Rv3134c蛋白抗原表位的预测被引量：3
- 2015年
- 目的预测结核分枝杆菌Rv3134c的抗原表位,了解其免疫学特性。方法利用DNAStar软件包中Protean软件对Rv3134c氨基酸序列进行分析,采用包括二级结构、亲水性、抗原性、表面可能性、柔韧性等多参数预测其二级结构及T细胞和B细胞抗原表位,最后BLAST分析其与人类抗原表位的同源性。结果 Rv3134c蛋白具有丰富的二级结构和多处抗原指数较高的区段,含有较多潜在的B细胞抗原表位,可能位于1-7、30-37、65-81、89-100、111-120、138-148、184-195、209-216、233-238位氨基酸残基或其附近,这些区域基本上含有β转角结构,亲水性、表面可能性和柔韧性指数都较高。该蛋白潜在的T细胞抗原表位较少,可能位于62-76、89-97、185-195、203-213、219-231、248-255位氨基酸残基或其附近。BLAST分析结果显示,其与人类抗原表位的同源性很低。结论结核分枝杆菌Rv3134c是一个即含有较多B细胞抗原表位又含有较多T细胞抗原表位的蛋白抗原,实验结果为该蛋白抗原表位的进一步研究与合成肽疫苗奠定了基础。
- 崔瑞娜白雪娟阳幼荣梁艳张俊仙赵卫国吴雪琼
- 关键词：结核分枝杆菌抗原表位
- 结核分枝杆菌潜伏感染相关蛋白Rv2004c的抗原表位预测被引量：7
- 2016年
- 本文应用生物信息学技术预测结核分枝杆菌潜伏感染相关蛋白Rv2004c的抗原表位,为结核病的诊断和疫苗研发筛选合适的抗原靶位。通过Blast分析发现Rv2004c蛋白与人类蛋白的同源性较低;采用DNAStar软件包中的Protean软件分析其二级结构、亲水性、抗原性、柔韧性及表面可能性,预测该蛋白有10个候选B细胞抗原表位;应用RANKPEP及SYFPEITHI法预测该蛋白有37个候选Th细胞抗原表位,主要位于第200位氨基酸之后,其中HLA-DRB1*0401及HLA-DRB1*0701表型相对的表位数目较多且某些候选表位的主要组织相容性复合体(MHC)限制类型存在交叉重叠;应用SYFPEITHI法、BIMAS法及NetCTL法预测该蛋白有10个候选细胞毒性T淋巴细胞(CTL)表位,其中以HLA-A2限制性表位数目较多、分值较高。由此得出结论:Rv2004c蛋白含有较多潜在的T细胞和B细胞抗原表位,可作为新的结核病诊断试剂和疫苗研发的候选靶蛋白。
- 王东方白雪娟刘银萍梁艳吴雪琼林明贵
- 关键词：结核分枝杆菌表位预测生物信息学
- 结核分枝杆菌Rv3407免疫原特性及研究进展被引量：1
- 2015年
- 据WHO估计，全球约有20亿人感染结核分枝杆菌（MTB），其中5％～10％会发展成结核病（TB）患者，大部分人会以潜伏感染状态持续终生。结核潜伏性感染（LTBI）是宿主感染结核分枝杆菌后皮肤结核菌素实验阳性，而无活动性结核的临床表现，无影像学改变或细菌学证据的一种尚未发病的特殊状态。潜伏感染阶段，MTB无代谢，无DNA复制和毒力。虽然休眠的MTB的毒力和对宿主细胞的破坏能力降低，但是同时也容易逃避免疫防御，通常难以被清除。
- 赵亚静吴雪琼赵卫国
- 关键词：分枝杆菌疫苗
- 结核菌感染巨噬细胞钙离子通道表达的研究被引量：1
- 2014年
- 目的研究结核分枝杆菌(MTB)感染的小鼠腹腔巨噬细胞L-型钙通道(L-type calcium channel,LTCC)的mRNA表达水平,并探讨其免疫学意义。方法结核分枝杆菌强毒株H37Rv、弱毒株H37Ra、卡介菌(简称BCG)分别感染小鼠24h后,腹腔灌洗收获巨噬细胞,用逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)半定量技术检测巨噬细胞LTCC mRNA的表达情况,并选择正常小鼠和金黄色葡萄球菌(金葡菌)感染小鼠作对照。结果巨噬细胞LTCC mRNA表达水平(相对含量)MTB H37Rv组为0.42±0.14),H37Ra组为0.35±0.09,BCG组为0.32±0.10,与正常未感染组0.20±0.08比较差异有统计学意义(P<0.01或P<0.05);H37Rv、H37Ra感染组与金葡菌感染组0.24±0.07比较差异有统计学意义(P<0.01或P<0.05);BCG感染组与金葡菌感染组之间差异无统计学意义(P>0.05);金葡菌感染组与正常未感染组之间差异也无统计学意义(P>0.05);BCG感染组、H37Ra感染组和H37Rv感染组间差异无统计学意义(P>0.05);不同抗菌谱的金葡菌感染组间差异也无统计学意义(P>0.05)。结论 MTB感染小鼠后巨噬细胞LTCC mRNA表达量显著增加,提示LTCC在MTB的致病机制和机体的免疫保护机制中均发挥了一定的作用。
- 崔瑞娜宋乐乐阳幼荣梁艳赵卫国吴雪琼
- 关键词：钙通道巨噬细胞结核分枝杆菌
- 结核DNA疫苗肌肉注射加电转染不同免疫方案免疫效果的研究
- 2014年
- 目的：研究结核DNA疫苗肌肉注射加电转染不同免疫方案的免疫效果，获得DNA疫苗肌肉注射加电转染免疫的最佳方案。方法40只BALB/c小鼠随机分为4组：（1）生理盐水组。（2）50μgAg85ADNA组。（3）100μgAg85ADNA组。上述3组分别肌肉注射加电转染免疫3次。（4）混合Ag85ADNA免疫组，第1和3次各肌肉注射加电转染10μgAg85ADNA，第2次肌肉注射加电转染100μgAg85ADNA，每2周免疫1次。最后1次免疫后2周、6周每组各杀5只小鼠，用ELISA方法检测小鼠脾细胞培养上清中IFN-γ和IL-4水平；用流式细胞术检测小鼠全血单个核细胞分泌IFN-γ的Th1细胞和分泌IL-4的Th2细胞比值；用定量RT-PCR检测小鼠肌肉电转染部位Ag85ADNA的含量。用ELISA方法检测小鼠免疫前、第1～3次免疫后10d小鼠血清特异性抗体水平。结果免疫结束后2周，小鼠脾淋巴细胞产生IFN-γ水平：混合Ag85ADNA免疫组[（703．66±394．74）pg/ml]和50μgAg85ADNA组[（648．60±439．41）pg/ml]明显高于生理盐水组[（70．58±108．76）pg/ml]（t值分别为3．975、3．629，P值分别为0．0004、0．0010）和100μgAg85ADNA组[（86．08±135．73）pg/ml]（t值分别为3．878、3．532，P值分别为0．0005、0．0013），但混合Ag85ADNA免疫组和50μgAg85ADNA组之间差异无统计学意义（t＝0．3457，P＝0．7318）；全血单个核细胞内Th1/Th2细胞比值：混合Ag85ADNA免疫组（3．82±1．09）均显著高于生理盐水组（0．37±0．11）、50μgAg85ADNA组（1．20±0．80）、100μgAg85ADNA组（1．10±0．60）（t值分别为2．980、2．260、2．352，P值分别为0．0058、0．0315、0．0257）；肌肉注射加电转染部位Ag85ADNA含量：100μgAg85ADNA组[（963．40±892．79）拷贝]显著高于50μgAg85ADNA组[（270．90±398．18）拷贝]和混合Ag85ADNA免疫组[（205．80±136．95）拷贝]（t值分别为2．639、2．887，P值分别为0．0144、0．0081）。免疫结束后6周，小鼠
- 梁艳肖漓张晓燕白雪娟阳幼荣高钰张俊仙陈丹王兰史迎昌李忠明吴雪琼
- 关键词：DNA疫苗电转染免疫
- 结核分枝杆菌Rv1419蛋白抗原表位的预测被引量：4
- 2015年
- 目的预测结核分枝杆菌Rv1419蛋白的抗原表位。方法利用DNAStar软件包中Protean软件对Rvl419氨基酸序列进行分析，采用包括二级结构、亲水性、抗原性、可及性、柔韧性、电荷分布等多参数预测其二级结构及T细胞和B细胞抗原表位。结果Rvl419蛋白具有丰富的二级结构和多处抗原指数较高的区段，含有少数潜在的B细胞抗原肽表位（可能在67-70、72-82、142-154、131-137位氨基酸残基或其附近），这些表位抗原性较好，都含有B转角和无规则卷曲结构，呈现在表面的可能性和柔韧性都较大。该蛋白含有较多潜在的T细胞抗原肽表位（可能在5-15、18-22、29-32、43-55、58-62、64--68、86-97、99-109、110-114、117-123、126-128、136-140位氨基酸残基或其附近）。结论结核分枝杆菌Rv1419蛋白是一个T细胞抗原表位占优势的蛋白抗原，也存在B细胞抗原表位，本研究结果为该蛋白抗原表位的进一步研究、应用奠定了基础。
- 刘银萍王全立张俊仙梁艳阳幼荣白雪娟吴雪琼
- 关键词：表位细菌蛋白质类蛋白质结构结核分枝杆菌
- 结核分枝杆菌Rv3407蛋白抗原表位的预测被引量：8
- 2014年
- 目的预测结核分枝杆菌Rv3407的抗原表位。方法利用DNAStar软件包中Protean软件对Rv3407氨基酸序列进行分析,采用包括二级结构、亲水性、抗原性、表面可能性、柔韧性等多参数预测其二级结构及T细胞和B细胞抗原表位。结果 Rv3407蛋白具有丰富的二级结构和多处抗原指数较高的区段,潜在的B细胞抗原表位较少,可能位于11-26、28-43、50-61、66-74、76-99位氨基酸残基或其附近,这些区域基本上含有β转角结构,亲水性、表面可能性和柔韧性指数都较高。该蛋白潜在的T细胞抗原表位较多,可能位于2-12、22-26、34-37、40-44、56-60、75-79、86-93位氨基酸残基或其附近。结论结核分枝杆菌Rv3407是一个T细胞抗原表位占优势的蛋白抗原,B细胞抗原表位略少,预测结果为该蛋白抗原表位的进一步研究与应用奠定了基础。
- 赵亚静白雪娟梁艳张俊仙阳幼荣赵卫国吴雪琼
- 关键词：结核分枝杆菌抗原表位
