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云南省鼠疫耶尔森菌规律成簇间隔短回文重复序列分型被引量：11: 2014年; 鼠疫耶尔森菌（鼠疫菌）基因组中包含3个规律成簇的间隔短回文重复序列（CRISPR）位点（YPa,YPb和YPc）.本研究对云南省不同生态型鼠疫菌株的CRISPR序列进行分析,了解不同鼠疫疫源地及鼠疫菌株间的相互联系.; 杨光璨石丽媛郭英张蓉董珊珊崔志刚李伟王鹏; 关键词：鼠疫耶尔森菌

脉冲场凝胶电泳技术简介及其在细菌分子分型中的应用被引量：28: 2013年; 目前可用于细菌分子分型的方法较多,脉冲场凝胶电泳(PFGE)技术以其重复性好、分辨力强的优势被作为细菌分子分型的"金标准"广泛应用;利用PFGE技术对细菌进行分型并分析细菌间分型结果的差异,可以有效地对疾病进行监测,追溯疾病的感染来源,明确感染途径,追溯其遗传特征,为细菌性疾病的预防与控制提供分子生物学证据。; 叶蕊石丽媛王鹏宋志忠; 关键词：脉冲场凝胶电泳细菌分子分型

云南省鼠疫耶尔森菌多位点可变数目串联重复序列分析被引量：12: 2013年; 目的通过多位点可变数目串联重复序列分析(multiple-locus variable-number tandem-repeat analysis,MLVA)方法,对云南省鼠疫菌株进行基因分型。方法采用聚合酶链反应(PCR)和毛细管电泳,通过BioNumerics软件进行处理,分析云南省158株鼠疫耶尔森菌基因型。结果选取鼠疫菌的14个VNTR位点,5个VNTR位点对云南省鼠疫菌具有多态性分析意义,利用这5个位点对云南菌株进行分析,云南158株鼠疫菌可分为2个群,3个簇,5个基因型,野鼠鼠疫菌属于A簇,丽江玉龙鼠疫菌属于B簇,家鼠鼠疫菌属于C簇,与传统的生态分型结果吻合。结论本次试验筛选的5个位点可以用于云南省鼠疫菌的分型,云南家鼠鼠疫菌、野鼠鼠疫菌及玉龙鼠疫菌分属不同的基因簇,玉龙鼠疫菌与野鼠鼠疫菌同属一个群,聚类结果与实际的地理相关性很好。; 朱俊洁王鹏张蓉海荣梁莹宋志忠; 关键词：鼠疫耶尔森菌基因型

云南省鼠疫耶尔森菌脉冲场凝胶电泳分析: 2013年; 目的构建云南省鼠疫菌株脉冲场凝胶电泳（PFGE）图谱库，为云南鼠疫的溯源及分型防控提供依据。方法选取云南省家、野鼠型以及玉龙鼠疫菌株共29株，分别采用AscI和FseI两种内切酶对菌株进行酶切分析，并使用BioNumerics6．6软件对图谱聚类。结果PFGE分析可以将29株鼠疫菌分为20个基因型，这些基因型又归为3大簇，即家鼠基因簇、野鼠基因簇以及玉龙基因簇，家鼠基因簇又可分为德宏亚簇、文山亚簇及临沧亚簇。结论云南鼠疫菌PFGE分子分型具有区域聚集性；PFGE基因型与菌株生态型能够很好地对应；玉龙鼠疫菌是云南一个独立的PFGE基因型。; 王鹏石丽媛叶蕊崔志刚李伟杨光璨董珊珊郭英宋志忠; 关键词：耶尔森菌鼠疫电泳脉冲场

云南省玉龙县一起鼠间鼠疫的实验室判定被引量：10: 2015年; 目的对云南省玉龙县一起鼠间鼠疫进行实验室判定。方法取6份干燥自毙鼠标本的肌肉及骨骼,用生理盐水进行浸泡,然后取浸泡液进行免疫胶体金(GICA)及鼠疫反相间接血凝抑制试验(RIHA)检测;采用DNA提取试剂盒对以上6份标本的骨骼及肌肉进行了全DNA的提取;采用聚合酶链式反应(PCR)检测caF1及pla基因;采用实时荧光定量PCR(real^time PCR)检测caf1、pla及YPO0392基因;采用LB平板对肌肉及骨髓标本进行细菌分离培养。结果经GICA初筛,6份标本中4份为阳性;RIHA检测4份阳性标本的效价分别是1:320、1:640、1:1 280及1:640;4份免疫学阳性标本的普通PCR检测,其中3份标本为阳性,1份为阴性;实时荧光PCR检测4份免疫学阳性标本DNA,其中3份标本为阳性,1份为阴性;所有6份标本细菌培养皆阴性。结论判定玉龙县此次事件为鼠间鼠疫疫情,同时建立了一套对干燥标本进行鼠疫实验室诊断的技术流程。; 王鹏张福新郭英谭红丽张正飞宋志忠; 关键词：鼠疫实时荧光定量PCR

云南鼠疫菌Asc I酶切分型及其流行病学意义: 2014年; 目的构建以AscI酶切的云南省鼠疫菌PFGE图谱库并探究其流行病学意义。方法采用限制性内切酶AscI对云南家、野鼠型及玉龙鼠疫菌进行酶切分析，并对电泳图谱进行聚类分析。结果30株被试菌株分为15种PFGE型别（相似性系数为88．9％～100．0％）、5个簇、4个群，除404号菌与EV76归为一群，其余3个群分别为家鼠型基因群、野鼠型基因群及玉龙基因群。结论云南鼠疫菌PFGE基因型与生态型相吻合，具有一定的区域聚集性；玉龙鼠疫菌是云南独立的一个基因群。; 叶蕊石丽媛王鹏董珊珊郭英杨光璨崔志刚李伟宋志忠; 关键词：鼠疫耶尔森菌 ASC I

鼠疫耶尔森氏菌分子分型方法的研究进展被引量：1: 2013年; 鼠疫是一种流行在啮齿动物间通过跳蚤传播的自然疫源性传染病,以发病急、传播快、病死率高为特征,是我国法定的甲类传染病。历史上鼠疫曾经引起3次人间的世界大流行,给人类带来巨大的灾难,20世纪90年代以来,鼠疫发病率呈上升趋势。鼠疫仍是人类面临的重要的公共卫生问题。鼠疫耶尔森氏菌（以下简称鼠疫菌）是引起鼠疫的病原菌,对鼠疫菌进行分型可以了解其在自然界的生存条件及生物学特征,; 朱俊洁夏淑婷王鹏宋志忠; 关键词：鼠疫耶尔森氏菌分子分型方法自然疫源性传染病甲类传染病世界大流行

云南省鼠疫菌FseI酶切分型及其流行病学意义被引量：2: 2014年; 目的构建云南省鼠疫菌FseI酶切的脉冲场凝胶电泳（PFGE）图谱库并探讨其流行病学意义。方法采用限制性内切酶FseI对云南家、野鼠型及丽江玉龙鼠疫菌株进行酶切分析，并聚类分析电泳图谱。结果30株被试菌株分为16种PFGE型别，其相似性系数为79．8％～100．O％；16种PFGE基因型可以分为4个簇，除EV76自成一簇，其余3个簇分别为家鼠型基因簇、野鼠型基因簇及玉龙基因簇。结论云南省鼠疫菌PFGE基因型与生态型、生物型相吻合，具有一定的区域聚集性，而丽江玉龙鼠疫菌为一个独立基因簇。; 石丽媛叶蕊董珊珊郭英杨光璨张蓉崔志刚李伟王鹏; 关键词：鼠疫耶尔森菌脉冲场凝胶电泳

鼠疫耶尔森菌质粒种类、功能及其流行病学意义: 2014年; 质粒是鼠疫耶尔森菌（鼠疫菌）染色体外的遗传物质,大多数鼠疫菌都带有3个质粒：pMT1 （pFra/pYT）、pCD1 （pYV）及pPCP1 （pPst/pPCY1/pPla/pYP）[1],是鼠疫菌毒力的重要组成部分,在抗吞噬及侵入扩散中扮演重要角色.除上述质粒外,国内外还陆续报道了一些其他质粒,这些质粒对鼠疫菌自身特性及遗传进化具有特殊的意义.本文就鼠疫菌质粒的种类、功能及其流行病学意义进行概述.; 丁奕博王鹏; 关键词：鼠疫耶尔森菌质粒

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云南省应用基础研究基金(2011FB134)