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吗啡衍生化反应的区位选择性的理论研究: 气相色谱和液相色谱中常用衍生化方法[1]分析样品,最后进行色谱测定,酰化试剂对于解决此类问题,是常用的衍生化试剂,本文在此对吗啡与酰化试剂[2]进行了理论计算研究,利用密度泛函理论中的B3LYP方法[3-5],6-31+...; 马竞赵东霞杨忠志; 文献传递

分子形貌和从头算理论探讨分子间相互作用: 如何判断分子的反应活性位点以及形成化学键强弱,一直备受科学家们的重视。随着量子化学的发展,人们已用电子密度、电子局域函数、Fukui函数和静电势的拓扑学分析等不同理论方法,探讨分子的反应活性[1-2]。杨等人建立的分子形...; 朱尊伟赵东霞杨忠志; 文献传递

应用ab initio方法和ABEEMσπ模型研究含铝金属酶被引量：2: 2013年; 应用原子-键电负性均衡方法中的σπ模型(ABEEMσπ模型),通过大量量子化学计算,拟合确定了含铝金属酶体系的ABEEMσπ参数.将这些参数应用到含铝金属酶大分子体系的电荷分布及Fukui函数的计算,结果显示,ABEEMσπ模型计算得到的电荷分布及Fukui函数与从头算和实验结论均有很好的一致性.还进一步计算分析了1L3R酶与丝氨酸结合前后的分子各区域的电荷分布,结果表明,Al 3+是1L3R酶的活性中心,根据结合后分子的Fukui函数可以得出丝氨酸会使1L3R酶的活性降低.另外,通过比较两者结合前后Al 3+的广义Fukui函数,证明了广义Fukui函数可用于该体系分子间反应活性的比较,同时也说明利用ABEEMσπ模型来预测含铝金属酶的抑制剂是可行的.; 杨忠志宁方达; 关键词：从头算方法 ABEEMΣΠ模型电荷分布

应用abinitio和ABEEMσπ/MM浮动电荷力场研究碱基和氨基酸侧链的相互作用: 蛋白质和核酸是组成生命最为重要的生物大分子,蛋白质-核酸相互作用在生命活动中发挥了一系列非常重要的功能,是人们了解基因表达具体机制、揭开生命奥秘的关键所在。在蛋白质-核酸相互作用中,蛋白质侧链和核酸的碱基的相互作用占相当...; 卢丽男杨忠志; 文献传递

ABEEM浮动电荷分子力场在含离子体系中的发展和应用被引量：2: 2013年; 离子水合及生物分子体系内离子选择性的微观作用机制是人们长期探索的重要课题,其难点在于如何合理精确地描述上述体系内的离子-水、离子-生物分子等各种相互作用.本文主要总结近年来原子-键电负性均衡浮动电荷分子力场(ABEEM/MM)在含离子体系中的发展和应用,包括离子水溶液、金属蛋白、离子-核酸碱基体系的研究.我们优选相关参数,构建上述体系的势能函数,并对气相水合离子团簇、离子水溶液、金属蛋白、离子-核酸碱基体系进行研究,模拟其结构、活性、热力学和动力学等性质.研究和比较结果表明,我们的ABEEM浮动电荷力场总体上优于其它力场方法,其精度可达到或接近高水平从头计算MP2方法.这为进一步探讨生物分子体系内的离子选择性、金属酶及其它含离子体系的结构和性质奠定了基础.; 宫利东; 关键词：金属蛋白 ABEEM MM 量子化学计算分子动力学模拟

发展应用于DNA体系的ABEEMσπ极化力场: DNA在人体生命活动中起着至关重要的作用,DNA结构的稳定性主要靠氢键与堆叠作用维持。要准确模拟DNA体系中的这两种作用首要是准确模拟体系的极化效应和电荷转移效应。国内外许多研究组在大力发展极化力场对此进行模拟,本文基于...; 李月刘翠; 关键词：分子动力学模拟; 文献传递

ABEEM_(σπ)和OPLS-AA力场对蛋白质G_A88/G_B88的分子动力学模拟被引量：3: 2013年; 将原子与键电负性均衡方法融入分子力学方法,即利用ABEEMσπ浮动电荷力场与ABEEM-7P水模型相结合的方法及OPLS-AA固定电荷力场方法,对GA88和GB88蛋白进行了水溶液(温度295 K)和真空中的分子动力学模拟.比较两种方法得到的两个蛋白质的结构与实验结构的均方根偏差,分析了两种方法得到的两个蛋白质的回旋半径、氢键分布、径向分布及电荷分布情况.结果表明,ABEEMσπ和OPLS-AA力场均能正确模拟蛋白质结构,得到的各项偏差值接近,但从各偏差的波动大小可见,ABEEMσπ力场的模拟更稳定;回旋半径模拟很好地体现了蛋白质的'电致紧缩'现象;氢键分布、径向分布及电荷分布表明,与OPLS-AA固定电荷力场相比,ABEEMσπ浮动电荷力场能更好地体现蛋白质和周围水分子的极化效应.; 王晶晶刘翠杨忠志; 关键词：分子力场分子动力学模拟动力学性质

M-均苯三甲酸基配聚物(M=Cu和Co)的合成、结构及光伏性能被引量：3: 2014年; 采用水热方法合成2种均苯三甲酸根配位聚合物{[Cu2(Hbtc)2(H2O)6]·ppz·H2O}n(1)和{[Co2(btc)2(H2O)6]·(H2ppz)·(H2O)}n(2)(H3btc=均苯三甲酸,ppz=哌嗪),通过红外光谱(IR)、紫外-可见-近红外吸收光谱(UV-Vis-NIR)、元素分析和X射线单晶衍射(XRD)对配位聚合物进行表征,利用表面光电压光谱(SPS)考察配位聚合物的光伏性能,并将SPS与UV-Vis吸收光谱进行关联,采用半导体能带理论与晶体场理论分析且指认各响应带.结果表明:配位聚合物1和2均属于三斜晶系,P-1空间群;二者具有均苯三甲酸根桥连的1D链状结构,不对称单元中均包含2个晶体学不等效的M(Ⅱ)离子(M1=Cu,M2=Co);二者中心金属离子的配位构型不同,相同有机分子的存在形式不同;2种配位聚合物在紫外-可见光诱导下均产生光伏响应,且配位聚合物中心离子的配位环境对光伏响应影响较大.; 董娇娇金晶鄢欣曲秀娟牛淑云; 关键词：表面光电压

稀有气体化合物HNgY的原子电荷及原子间的成键情况: <正>稀有气体因其填满的s和p价层轨道而具有相当稳定的电子组态,化学性质不活泼,在室温下以单原子气态的形式存在。含有稀有气体元素的化合物具有特殊的性质而受到了广泛的关注。例如,大量的实验和理论计算表明1,HArF分子呈线...; 朱尊伟杨忠志赵东霞; 文献传递

甲苯与氯分子亲电取代反应过程的分子形貌理论研究: 分子形貌是基于分子中单电子作用势,将第四维的电子密度映射在三维空间的分子内禀特征轮廓上,表现出分子的形状和前沿电子密度。在分子的内部,Dpb可以用来表征化学键的强弱。本文应用分子形貌理论,在MP2/6-311++G（3d...; 张乐杨忠志; 关键词：亲电取代反应过渡态分子形貌 DPB; 文献传递

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